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靶向代谢组学(Targeted metabolome)

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靶向代谢组学
靶向代谢组学分析的重点是采用大量天然和生物变异样本,验证预先确认的代谢物。需要用分析标准品进行定量分析。
靶向代谢组需要用户提供一组给定的代谢物,比如某一条或者几条代谢通路的代谢物,我公司将根据这些化合物进行定性定量的研究,并研究其生物学意义。


靶向代谢组分析流程:

 

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 靶向代谢组学技术概述    靶向代谢组学分析的重点是采用大量天然和生物变异样本,验证预先确认的代谢物。需要用分析标准品进行定量分析。    靶向代谢组需要用户提供一组给定的代谢物,比如某一条或者几条代谢通路的代谢物,我公司将根据这些化合物进行定性定量的研究,并研究其生物学意义。目前多数文章,可以通过非靶向代谢组学寻找差异差异物,然后通过靶向代谢组学进一步定性定量验证。 靶向代谢组学和非靶向代谢组的区别   非靶向代谢组 靶向代谢组 目的 发现差异代谢物,寻找biomarker 注重目标代谢产物,一般以通路为主 定性定量 可以定性,相对定量 定性定量同时进行,可以检测浓度 方法 直接进样即可分析,成本相对较低 需先购买标准品,进行方法学验证再检测,成本较高 帕诺米克优势  ★ 拥有标准化的实验室操作规范和先进的靶向技术平台,实验周期短,质量可靠。★ 拥有Waters Quattro Premier XE三重四极杆液质联用仪(MRM)、Agilent 7890A-5975C气质联用仪(SIM)等多种靶向仪器平台。★ 具有药学研究背景,严格的方法验证步骤,多重质控保证实验可靠。★ 拥有专业的生物信息团队和大型计算机,可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。靶向代谢组学技术路线
靶向代谢组学靶向代谢组学分析的重点是采用大量天然和生物变异样本,验证预先确认的代谢物。需要用分析标准品进行定量分析。靶向代谢组需要用户提供一组给定的代谢物,比如某一条或者几条代谢通路的代谢物,我公司将根据这些化合物进行定性定量的研究,并研究其生物学意义。靶向代谢组分析流程: 
非靶向代谢组学(untargeted metabolome)非靶向代谢组学也叫发现代谢组学:发现代谢组学一般包括:1代谢谱分析(也称为差异表达分析),在一组实验和对照样品中,寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物2鉴定,进行代谢谱分析后,测定这些代谢物的化学结构3解释,研究流程的最后一步,解释所发现的代谢物与生物过程或生物状态之间的关联分析流程生物信息分析生物信息学分析  基础服务包   1. 原始数据Peak提取及保留时间纠正 2. 多样本Peak比对(peak alignment) 3. 缺失值模拟 4. 显著性差异Peak分析 基础分析包(统计分析)   1.主成分分析(PCA) 2.偏最小二乘法判别分析(PLS-DA) 3.热图分析 4.K-means聚类分析 5.决策树分类分析 6.ROC判别分析 增殖分析包(功能分析)   1. Peak代谢组注释 2. Pathway注释 增殖分析包(关联分析)   1. 代谢组与转录组关联分析 2.代谢组与蛋白组组关联分析
一、代谢组分析技术概述       代谢组学是通过比较对照组和实验组的代谢组(metabolomes,某一生物的所有代谢物组分),以寻找其它代谢谱差异的研究方法。这些差异可能与临床生物标志物发现中研究的某些疾病相关,也可能与药物研发毒理研究中候选药物摄入后的代谢改变有关。环境代谢组学在研究化学品接触对野生生物和环境的影响方面日益受到重视。在农业/化工领域,代谢组学可用于除草剂和杀虫剂的开发。代谢组学谱型分析与基因表达研究或蛋白质组学分析这些只揭示细胞中发生的一部分行为的研究不同,它能描述某一时刻细胞的完整生理状态。更重要的是,如果能把蛋白质组学、转录组学和代谢组学的数据整合在一起(一种称为系统生物学的整合性研究思路和方法),将获得生命有机体生物学更完整的图像。应用领域:£  疾病诊断和发病机制研究£  药物毒理学、新药筛选、药物安全评价£  中药研究及中医结合£  植物和农业研究£  微生物与发酵研究£  食品健康、食品安全的研究£  新能源发掘质谱在代谢组学中的应用质谱(MS) 因具有广泛的动态范围、能进行可重现的定量分析,而且能够分析非常复杂的生理体液,已被用于代谢组学的研究中。由于这类样品的复杂性,为了尽可能多地检测代谢物,在质谱分析之前常常还要进行分离(气相色谱、液相色谱或毛细管电泳)。LC/MS,GC/MS, NMR比较   优点 缺点 LC/MS 灵敏度较高,无需衍生化,适合极性较大物质 分离率不高,时间较长,具有偏向性 GC/MS 较好的分离效率和检测灵敏度、适合极性较小物质 衍生化限制了应用范围,具有偏向性 NMR 精度高、对样品限制少、不破坏样品 灵敏度较低、动态范围有限 GC/MS分析气相色谱和质谱(GC/MS)是分析挥发性化学物质的有效组合。气相色谱使用运载气推动分析物通过涂渍的熔融石英毛细管。基于分析物在气相和毛细管内涂层之间的不同分配实现分离。GC/MS 要求分析物能够挥发,以便在毛细管中进行迁移。因此,分析物必须具有挥发性,或能够经过化学衍生具有挥发性。LC/MS分析液相色谱可以分离无挥发性和未衍生化的代谢物。因此,LC/MS可以分析的化合物种类范围比GC/MS 更广。LC/M

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