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靶向代谢组学(Targeted metabolome)

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靶向代谢组学
靶向代谢组学分析的重点是采用大量天然和生物变异样本,验证预先确认的代谢物。需要用分析标准品进行定量分析。
靶向代谢组需要用户提供一组给定的代谢物,比如某一条或者几条代谢通路的代谢物,我公司将根据这些化合物进行定性定量的研究,并研究其生物学意义。


靶向代谢组分析流程:

 

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靶向代谢组学靶向代谢组学分析的重点是采用大量天然和生物变异样本,验证预先确认的代谢物。需要用分析标准品进行定量分析。靶向代谢组需要用户提供一组给定的代谢物,比如某一条或者几条代谢通路的代谢物,我公司将根据这些化合物进行定性定量的研究,并研究其生物学意义。靶向代谢组分析流程: 
 靶向代谢组学技术概述    靶向代谢组学分析的重点是采用大量天然和生物变异样本,验证预先确认的代谢物。需要用分析标准品进行定量分析。    靶向代谢组需要用户提供一组给定的代谢物,比如某一条或者几条代谢通路的代谢物,我公司将根据这些化合物进行定性定量的研究,并研究其生物学意义。目前多数文章,可以通过非靶向代谢组学寻找差异差异物,然后通过靶向代谢组学进一步定性定量验证。 靶向代谢组学和非靶向代谢组的区别   非靶向代谢组 靶向代谢组 目的 发现差异代谢物,寻找biomarker 注重目标代谢产物,一般以通路为主 定性定量 可以定性,相对定量 定性定量同时进行,可以检测浓度 方法 直接进样即可分析,成本相对较低 需先购买标准品,进行方法学验证再检测,成本较高 帕诺米克优势  ★ 拥有标准化的实验室操作规范和先进的靶向技术平台,实验周期短,质量可靠。★ 拥有Waters Quattro Premier XE三重四极杆液质联用仪(MRM)、Agilent 7890A-5975C气质联用仪(SIM)等多种靶向仪器平台。★ 具有药学研究背景,严格的方法验证步骤,多重质控保证实验可靠。★ 拥有专业的生物信息团队和大型计算机,可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。靶向代谢组学技术路线
非靶向代谢组学(untargeted metabolome)非靶向代谢组学也叫发现代谢组学:发现代谢组学一般包括:1代谢谱分析(也称为差异表达分析),在一组实验和对照样品中,寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物2鉴定,进行代谢谱分析后,测定这些代谢物的化学结构3解释,研究流程的最后一步,解释所发现的代谢物与生物过程或生物状态之间的关联分析流程生物信息分析生物信息学分析  基础服务包   1. 原始数据Peak提取及保留时间纠正 2. 多样本Peak比对(peak alignment) 3. 缺失值模拟 4. 显著性差异Peak分析 基础分析包(统计分析)   1.主成分分析(PCA) 2.偏最小二乘法判别分析(PLS-DA) 3.热图分析 4.K-means聚类分析 5.决策树分类分析 6.ROC判别分析 增殖分析包(功能分析)   1. Peak代谢组注释 2. Pathway注释 增殖分析包(关联分析)   1. 代谢组与转录组关联分析 2.代谢组与蛋白组组关联分析
靶向代谢组学分析主要是以标准品为参照,对特定的代谢物群进行有针对性地、特异性地检测与分析。靶向代谢组学分析成功的关键因素是准确度、高通量和可靠性。虽然这类分析比代谢谱分析更为常规,但必须面对非常大量(成千上万)的样品。靶向代谢组学可以应用于:• 验证由发现代谢组学实验提出的假说;• 进行基于假说的探索性实验(通常根据最新的解释),针对特定代谢物,研究代谢模型。 目标代谢物绝对定量产品定义靶向代谢组学分析主要是以标准品为参照,对特定的代谢物群进行有针对性地、特异性地检测与分析。通常采用的技术方案包括常规的液质联用(LC-MS)分析技术,以及选择性反应/多反应监测技术(MRM/ SRM)。技术原理常规分析法首先利用LC-MS的方法对待分析样本进行大规模代谢组分析,然后通过与相同分析条件下标准品的分析结果进行比对,实现对样本内目标代谢群的定性和定量分析。MRM/SRM技术是更为特异、灵敏的靶向分析方法。其主要基于已知或假定的反应离子信息,有针对性地选择数据进行质谱信号采集,对符合规则的离子对进行信号记录,去除不符合规则离子信号的干扰。定量过程中,该技术首先筛选到目标代谢物特异性的母离子,然后选择性地对这些母离子进行碰撞诱导,去除其他离子的干扰,只对选定的特异MS/MS2离子进行质谱信号的采集,从而实现对目标代谢分子更为特异、灵敏、准确的分析。实验流程(MRM) 使用仪器常规分析法:agilent UHPLC1290-AB6600MRM/SRM:agilent UHPLC1290-AB6460技术优势常规分析法:高通量分析能力,相比于MRM/SRM简便、经济MRM/SRM:高通量分析能力,兼具高选择性、高特异性、高准确度、高重现性、高灵敏度、宽动态范围应用领域 非靶向代谢物组学结果的验证 代谢相关生理、病理研究 发酵工艺研究 食品科学与营养学研究 高通量靶标分析产品定义高通量靶标代谢组学分析主要是以标准品为参照,对对某个或某⼏几个特定组分进行有针对性地、特异性地检测与分析。使用仪器常规分析法:agilent UHPLC1290-AB6600MRM/SRM:agilent UHPLC1290-AB6460应用领域 非靶向代谢物组学结果的验证 

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