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染色质免疫沉淀-测序(ChIP-Seq)
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单细胞测序
¥1
伯豪生物单细胞测序服务——BD RhapsodyTM技术平台
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空间转录组测序
单细胞核测序
ATAC-Seq 单细胞ATAC测序
细胞核分离试剂盒[组织样本/细胞样本]
伯豪生物芯片服务
ceRNA 芯片
¥6000
芯片:Illumina 850K
¥3500
全转录组测序服务
概述 染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。 ChIP-Seq的原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息。
技术路线 1.实验流程(Solexa)
实验流程示意图
生物信息分析流程示意图
研究内容 1.测序 对客户提供的ChIP样品(如果有阴阳参启动子区域或DNA序列的)进行定量检测,检测合格后进行测序文库构建、DNA成簇(Cluster generation)扩增、高通量测序。 2.基本数据分析 数据产出统计:对测序结果进行图像识别(Base calling),去除污染及接头序列;统计结果包括:测定的序列(Reads)长度、Reads数量、数据产量。 3. 高级数据分析 标准高级数据分析内容包括: (1)ChIP-Seq序列与参考序列比对; (2)Peak calling:统计样品Peak信息(峰检测及计数、平均峰长度、峰长中位数); (3)统计样品Uniquely mapped reads在基因上、基因间区的分布情况及覆盖深度; (4)给出每个样品Peak关联基因列表及GO功能注释; (5)在多个样品间,对与Peak关联基因做差异分析。
染色质免疫共沉淀测序分析,详见链接:http://www.ebioservice.com/product_list.asp?pid=115&pcid=192
技术特点
应用领域 由于ChIP-Seq的数据是DNA测序的结果,为研究者提供了进一步深度挖掘生物信息的资源,研究者可以在以下几方面展开研究: (1)判断DNA链的某一特定位置会出现何种组蛋白修饰; (2)检测RNA polymerase II及其它反式因子在基因组上结合位点的精确定位; (3)研究组蛋白共价修饰与基因表达的关系; (4)CTCF转录因子研究。
案例分析
染色质免疫沉淀-测序案例研究
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ChIP-Seq整体服务
人全基因组重测序,90G,含生物信息分析,30X
¥0
DNA甲基化测序服务
全基因组测序及分析
¥4000
DNA羟甲基化测序服务
环状RNA测序
测序类服务:外显子组测序技术服务
¥2000
测序类服务:宏基因组测序(全基因组测序)技术服务
Immune Repertoire Sequencing Services
RIP测序
宏基因组测序-16S rDNA 测序服务
¥580
外显子组测序
扩增子高通量测序
DNA-6mA甲基化测序
16S测序
染色质免疫共沉淀 ChIP-Seq 技术服务
小RNA(miRNA)测序
ChIP测序 | 核酸-蛋白互作研究
RIP测序 | 核酸-蛋白互作研究
全基因组甲基化测序(WGBS)
Mr chong
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2020.12.28-2021.01.31
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2020.12.16-2021.01.31
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