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- 详细信息
- 技术资料
- 提供商:
ABCODE
- 服务名称:
AbMap抗体表位解析平台
抗体识别表位(Epitope)是抗体的核心表征,是抗体评估的重要维度,是抗体功能的关键要素。AbMapTM高通量抗体识别表位解析技术,联合通用的噬菌体展示肽库、高通量测序和AI算法,可快速、准确、低成本、高通量地鉴定抗体的识别表位,并提供核心氨基酸信息。
依托技术团队多年的持续性研究与整理,抗码芯瑞建立起了具有高度覆盖性和预测准确性的抗体表位解析数据库 — AbData数据库。该数据库涵盖近万个抗体信息。
对于输入的某一特定抗体,数据库会显示其完整的注释信息(Antigen_name, Uniprot-ID, Gene_ID, Immunogen_seq等),通过AbMap表位解析技术获得的短肽结合谱(Binding peptide profile)以及(可能存在的)共有基序(Motif),共有基序可准确提炼关键氨基酸以及抗体识别序列的偏好性,用于解析表位。
以三个科学界重点关注的抗体为例,下面展示了AbData数据库中对这些抗体的表位解析和预测情况。
HIV-1 Reverse Transcriptase
如上所示,AbData数据库展现的分析和预测结果,无论是准确性还是广泛性上都非常出色。
基于高通量测序和AI算法,可快速、准确、低成本、高通量的鉴定抗体的短肽结合谱以及结合表位,并提供核心氨基酸信息。同时,数据库中存储的大量信息对于制备高质量的抗体亦有重要的价值。
欢迎您的进一步了解!
技术原理
基于一个通用的、高多样性的、12aa长度的噬菌体随机肽库,AbMap可快速检测抗体所识别的肽段,并通过算法获得其氨基酸序列的模式(Pattern)或共有基序(Motif)。通过一级序列比对或三维构象重构可获得其识别表位。同时,共有基序可准确提炼关键氨基酸以及抗体识别序列的偏好性。NGS可实现多种抗体的并行检测分析。
技术优势
1、分辨率高:AbMap除了鉴定抗体的识别表位,还可以提供该表位中哪些氨基酸是关键氨基酸,实验氨基酸水平的分辨率
2、准确度高:针对线性表位,AbMap鉴定抗体表位的准确性>90%。
3、通量高、成本低:采用移液工作站,联合高通量测序(NGS),AbMap可实现>1000种抗体的并行分析,同时节约成本,价格低廉。
4、样本损耗少:AbMap仅需低至1 μg抗体,因此可兼容细胞培养上清以及微量表达体系。
应用案例
针对某个针对SARS-CoV-2刺突的抗体,通过AbMap首先获得其识别的氨基酸基序,并通过序列比对获得了其线性表位(红色标注序列),同时提示其中的K, P, Q, Q为核心氨基酸。为了验证该结果,合成了数条带有氨基酸单点突变的多肽,并构建了多肽芯片进行该抗体检测,结果和预期一致,关键氨基酸突变极大削弱抗体的结合,其它氨基酸突变则影响较小。
适用样本类型
单抗,多抗; 全长IgG,Fab;人源,鼠源,兔源等。
样本要求
抗体浓度:>0.5 mg/mL; 纯度:>85%; 总量:>1 μg
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