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- 基于质谱技术的蛋白质组学
- 2025年12月09日
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- 服务名称：
TMT标记定量蛋白质组
- 提供商：
北京易默基因科技有限公司
实验原理
TMT(Tandem Mass Tags)技术是由Thermo 公司研发的多肽体外标记定量技术。采用6、10、11、16种稳定同位素标签，通过特异性标记多肽的氨基基团，然后进行串联质谱分析，可同时比较多达16种不同样本中蛋白质的相对含量。
TMT试剂由三部分组成：报告基团、平衡基团和反应基团。反应基团形成2-16种等质量同位素标签。TMT试剂标记酶解后的肽段，可与氨基酸N端及侧链的伯胺基团发生反应。在一级谱图中，来自于不同样本的同一肽段，标记后表现为相同的质荷比。在二级谱图中，报告基团、平衡基团和反应基团之间的键断裂，带不同同位素标签的同一肽段产生质量不同的报告离子，根据报告离子的丰度可获得样本间相同肽段的定量信息，再经过软件处理得到蛋白质的定量信息。
实验流程
- 确定检测方案并收集样本；
- 样本收集完成后进行前期处理，包括样本提取及蛋白质检；
- 利用TMT标记试剂分别标记不同样本；
- 每个样本等量混合均匀后，将蛋白质进行酶切；
- 酶切样本利用半制备液相色谱分离；
- 分馏产物利用液 质联用质谱仪进行质谱检测；
- 利用软件进行蛋白组的定性、定量分析。
提供结果：
- 蛋白和肽段水平质控信息；
- 定性和定量蛋白信息；
- 火山图，热图等统计信息;
- GO, KEGG pathway，Reactome分析，
- PPI（蛋白质相互作用分析）等生物信息学分析.
北京易默基因提供蛋白质组学服务内容：
1. 定性蛋白质组
2. DIA定量蛋白质组
3. Label free定量蛋白质组
4. TMT标记定量蛋白质组
5. 4D Label free/DIA定量蛋白质组
6. DIA磷酸化蛋白质组
7. 糖基化蛋白质组
8. 泛素化修饰蛋白质组
9. 乙酰化/琥珀酰化修饰蛋白质组
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3. Liu J, Liu D, Hu Z, et al. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration[J]. Food Chemistry, 2024, 435: 137596.
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