必须要保证cDNA的量要一致才有可比性,所以最好还是做RT-qPCR。之所以要做内参,一是利用△△C法运算得到基因差异,二就是利用内参可看得出你每孔的cDNA模板量是否具有一致性,一般来说,我们实验要求样品内参的Ct值最好相差不要超过0.2~0.5,还有值得注意的是,如果内参Ct值出现过大或者过小都会影响到你的实验数据分析,一般来说内参在Ct值=12~15的位置左右为宜
多谢以上各位!明白了!但是有个内质网应激方面的指标XBP1,文献都是用跑电泳来看splicing形式的多少,就是说扩出来是两种产物,貌似没查到用RT-qPCR的…………
要保证cDNA的量是一定的。因为内参在不同组表达恒定,所以cDNA恒定,内参就恒定。在这个前提下再去比较目的mRNA。
既然你需要进行这方面的比较,为什么不采用real-time PCR?RT-PCR只能用来定性检测,即大概看看是否多了或者少了,不能进行半定量,更不能进行定量。另外,如果你非得采用这种方法,模板量是一定要一样的