COBALT:NCBI在线蛋白多序列比对(比ClustalW还强大
COBALT is a multiple sequence alignment tool that finds a collection of pairwise constraints derived from conserved domain database protein motif database and sequence similarity using RPS-Blast BLAST ...
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Fasta格式的详细说明
序列的Fasta格式是最经常看到的格式之一。下面简介说明一下什么是FASTA格式。Fasta格式开始于一个标识符:"",然后是一行描述,下面是一行行的序列。每一行最好不要超过80个字母。如:gi|532319|pir|TVFV2E|TVFV2E envelope proteinELRLRYCAPAGFALLKCNDADYDGFKTNCSNVSVVHCTNLMNTTVTTGLLLNGSYSENRTQ ...
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步一步教你如何做系统进化树
我在此介绍几个进化树分析及其相关软件的使用和应用范围。这几个软件分别是PHYLIP、PUZZLE、PAUP、TREEVIEW、CLUSTALX和PHYLO-WIN(LINUX)。在介绍软件之前,我先简要地叙述一下有关进化树分析的一些方法学问题。进化树也称种系树,英文名叫“Phyligenetic tree”。对于一个完整的进化树分析需要以下几个步骤:⑴ 要对所分析的多序列目标进行排列(To ali ...
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几个进化树分析及其相关软件的使用和应用范围
大家好:我在此介绍几个进化树分析及其相关软件的使用和应用范围。这几个软件分别是PHYLIP、PUZZLE、PAUP、TREEVIEW、CLUSTALX和PHYLO-WIN(LINUX)。在介绍软件之前,我先简要地叙述一下有关进化树分析的一些方法学问题。进化树也称种系树,英文名叫“Phyligenetic tree”。对于一个完整的进化树分析需要以下几个步骤:⑴ 要对所分析的多序列目标进行排列(To ...
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