关键词: 生物信息学 数据挖掘
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生物信息学是一门新兴的交叉学科。生物信息学是伴随基因组研究而产生的,它的研究内容紧随着基因组研究而发展。广义地说,生物信息学从事对基因组研究相关 生物信息的获取、加工、储存、分配、分析和解释。这一定义包括了两层含义,一是对海量数据的收集、整理与服务,即管好这些数据;另一个是从中发现新的规 律,即用好这些数据。具体地说,生物信息学是把基因组DNA序列信息分析作为源头,找到基因组序列中代表蛋白质和RNA基因的编码区;同时,阐明基因组中 大量存在的非编码区的信息实质,破译隐藏在DNA序列中的遗传语言规律;在此基础上,归纳、整理与基因组遗传信息释放及其调控相关的转录谱和蛋白质谱的数 据,从而认识代谢、发育、分化、进化的规律。
生物信息学自诞生以来,经历了3个阶段:1) 基因年代的生物信息学,主要是序列分析、数据库的查询、计算机操作和PC的应用;2) 基因组年代的生物信息学,主要是基因的寻找、数据与数据之间的比较、网络相互界面;3) 后基因组年代的生物信息学,主要是数据的挖掘、表达、数据多样性的分析、相互交叉数据分布的总结与分析。其研究的内容不仅包括基因的查寻和同源性分析,而 且进一步到基因和基因组的功能分析,即所谓的功能基因组研究。
生物信息学与数据挖掘
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血浆样品做芯片或者高通量测序
有谁做过检测血浆(或者血清)样品中 的小rna的表达差异的,检出率高吗?咨询 了几家公司结果不是很满意 。
2 评论
R package DESeq2中在差异表达分析那一步怎么得到正确的比值
这是我的condition,我想得到CR1/CR,PR1/PR,SR1/SR,可是DESeq处理后总是得到SR1/CR,这是为什么??有什么解决方法吗?
gsea软件无法打开
按照步骤下载java,gsea软件后,无法打开gsea软件,运行Java及遇到的问题如图,是Java安装有问题吗:
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