caspase家族蛋白酶的结构与功能
一 caspase家族蛋白酶的组成未活化的caspase家族蛋白酶是以酶原形式存在的,酶原的氨基端有一段被称为“原结构域”(pro-domain)的序列。酶原活化时不但要将原结构域切除,并且要将剩余部分剪切成一大一小两个亚基,分别称为P20和P10,活性酶就是由这两种亚基以(P20/P10)2的形式组成的。这种活化反应也是Asp特异的,剪切发生在酶原中保守序列的Asp与其后的氨基酸残基之间,一般是 ...
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蛋白质浓缩问题——超滤浓缩管的使用及保存
2.1 浓缩样品1、要浓缩的样品含盐量必须0.3M以上,含盐量低的样品须补加到0.3MNaCl。2、在内管(附有3KD膜)中加入500µl样品,将内管套入外管。3、对称放置离心管,14520rpm(即14000g)离心。(离心5min约浓缩2倍,10min约4倍,15min约6倍,20min约8倍,30min约10倍)。4、离心结束后,将内管倒置套在另一个干净的离心管呢,3880rpm离心min ...
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蛋白质相互作用网络分析软件
一、Osprey作者: Bobby-Joe Breitkreutz Chris Stark Mike Tyers网址:http://biodata.mshri.on.ca/osprey/servlet/Index编程语言:Java操作平台:Window2000/xp/9x; LinuxUnix;介绍:a network visualization system. A so ...
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基因表达谱聚类分析
对于基因表达谱数据的分析是生物信息学的研究热点和难点。转化为数学问题,分析任务是从数据矩阵 M 中找出显著性结构,结构类型包括全局模型 (model) 和局部模式 (pattern) 。对基因表达谱数据的分析是数据挖掘问题,所采用的方法包括通过可视化进行探索性数据分析( Exploratory Data Analysis )、描述建模 (descriptive modeling) 、分类、聚类、回归和机器学习等。 基因表达谱分析所采用的常用方法是聚类,其目的就是将 ...
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