蛋白质二级结构预测-基于氨基酸疏水性的预测方法
这种方法是一种用物理化学方法进行二级结构预测的方法,或称为立体化学方法。在蛋白质中,氨基酸的理化性质对蛋白质的二级结构影响较大,因此在进行结构预测时考虑氨基酸残基的物理化学性质,如疏水性、极性、侧链基团的大小等,根据氨基酸残基各方面的性质及残基之间的组合预测可能形成的二级结构。“疏水性”是氨基酸的一种重要性质,疏水性的氨基酸倾向于远离周围水分子,将自己包埋进蛋白质的内部。这 ...
来源:互联网 17453 阅读
蛋白质二级结构预测-Chou-Fasman预测方法
Chou-Fasman方法是一种基于单个氨基酸残基统计的经验参数方法,由Chou和Fasman在20世纪70年代提出来。通过统计分析,获得的每个残基出现于特定二级结构构象的倾向性因子,进而利用这些倾向性因子预测蛋白质的二级结构。每种氨基酸残基出现在各种二级结构中倾向或者频率是不同的,例如Glu主要出现在α螺旋中,Asp和Gly主要分布在转角中,Pro也常出现在转角中,但是绝不会出现在& ...
来源:互联网 13925 阅读
“点击化学”的应用:多肽和蛋白质修饰
随着蛋白质组学和生物医药等领域发展,多肽和蛋白质的修饰引起了人们的广泛关注,成为当前一个非常重要的研究方向。通过对多肽和蛋白的修饰,可以研究蛋白质分子结构与功能之间的关系以及蛋白质-蛋白质相互作用,利用标记分子进行追踪定位,另外还可以对一些活性多肽和蛋白质进行改性。
来源:互联网 11203 阅读
基于氨基酸组成的蛋白质预测软件
根据组成蛋白质的20种氨基酸的物理和化学性质可以辨析电泳等实验中的未知蛋白质,也可以分析已知蛋白质的物化性质。ExPASy工具包包涵的程序:http://www.expasy.ch/tools/AACompIdent:与把氨基酸序列在SWISS-PROT库中搜索不同,AACompIdent工具利用未知蛋白的氨基酸组成去确认具有相同组成的已知蛋白。该程序分析时需提交的相关信息包括:蛋白质的氨基酸 ...
来源:互联网 9733 阅读