设计引物时,如何检测 PCR 引物特异性?
茫茫的实验过程中,你是否遇到过如下的困境:做完 PCR,跑胶发现有多条很诡异的条带……更为可怕的是,做完二代测序发现了一个崭新的突变点,一代测序验证也能开心的验证出来,但发文章时,别人告诉我们,这其实是相似序列引发的假阳性……也就是说,相似序列之间的差异碱基,刚好就是那个所谓的突变点!一代测序也枉然!以上的问题,可能多半都是因为引物不特异。也就是说,同一对引物,能匹配基因组上好几个位置。所以,设计完引物,做一个在线的 PCR,以 ...
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qPCR引物设计,Primer3 Plus 和 Primerbank 都能搞定!
引物设计是 qPCR 非常重要的环节。今天小编给大家推荐 2 款简单实用的在线 qPCR 引物设计网站,让你分分钟搞定 qPCR 引物!Primer3 Plus推荐指数:五颗星理由:严格的 qPCR 引物设计一般要求其中一条引物要跨外显子,最好在 3' 端设计引物,产物的长度在 300bp 以内等。本在线软件可满足 qPCR 引物设计的要求。网址链接:http://www.primer3plus.com/1、选择 Run latest Versionof Primer3Plus,就进入了设计引物的 ...
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第八章:常用引物设计工具大集合
Oligo 6作为目前最好、最为专业的引物设计软件,Oligo的功能很强大,他主要功能有:普通引物对的搜索、测序引物的设计、杂交探针的设计以及评估「引物对」质量的功能,如何使用Oligo6 请参看:「两分钟教你学会 Oligo 7」Oligo 6 联合使用 Primer 5 http://wenku.baidu.com/view/da565dd380eb6294dd886c41.htmlBLAST BLAST(Basic Local Alignment Search T ...
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[资源] 所有的看家基因(housekeeping genes)列表+引物设计服务
以下是所有的看家基因的列表,大家在设计引物时,可以直接采用这些基因的序列,本表来自于Trends in Gentics上一篇文献,内容全面,所有的看家基因均标注了基因银行号(Genbank),可以直接到pubmed中查询得出。引物设计可以推荐用primer 5,也可以直接与fbzhang@hotmail.com联系,请注明:引物设计服务, 同时提供您所需要的引物的基因银行编号或全部序列。List of housekeeping genes de ...
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