SNP的概念和特点

单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP），主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在，平均每500～1000个碱基对中就有1个，估计其总数可达300万个甚至更多。SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异，这种变异可由单个碱基的转换（ ...

来源：互联网    15645 阅读

SNP位点的选择

1，如果是检测基因的所有以知的SNP，那么你首先要去了解并查询到这些SNP位点吧，SNP位点可以通过查询dbSNP数据库（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/）和TSC（The SNP Consortium）数据库（http://snp.cshl.org/），可以获知基因及上下游邻近序列的SNP位点。2，至于挑选的原则，可以介绍一下Hap Map的正规化标准：SNP ...

来源：互联网    14958 阅读

SNP位点的命名

关于snp位点的命名其实并不统一，大家在文献中一般用的都是习惯或者说惯用名称。具体表现在以下几种形式：一、突变信息之间加上位置信息：主要有三种方式：比如说突变信息之间加上cDNA的位置，如C188T；突变信息之间加上DNA的位置，如A2546G；突变氨基酸信息之间加上氨基酸位置，如Glu145Lys.二、按发现顺序或频率顺序拟定的惯用名称也有几种形式，如CYP2D6*10CYP2C9*3等 ...

来源：互联网    13092 阅读

【求助】根据rs号如何查找SNP具体位置

lyvo 请问各位大侠，知道一个SNP的rs号 如何知道其在该基因中的具体位置 （如何知道其处于基因中的第几个碱基）？lyvo 例如rs2297518 对应的 -954G/C 是怎么查到的？madamcurie 回复楼主：关于SNP的rs问题，你可以看一下园内的一个贴：（可以很好的让你学会相关的知识）http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=9611445&sty=1&ticket=ST-85768-Eey5zIB ...

来源：丁香园论坛    12726 阅读