标签: 基因组扫描 插入 突变检测 限制性酶切标记基因组扫描 二维电泳 环境基因组学实验指南 第十章
当今,在环境毒素和辐射暴露导致的人类和其他生物突变检测上需要更有效的方法。而环境基因组学研究是以非模式系统生物作为研究对象,这就需要一种不需要知道这些生物的基因组序列信息的方法。限制性酶切标记基因组扫描(restrictionlandmarkgenomescanning,RLGS)是一种对末端标记的DNA片段进行双向电泳(2-DE)的分析方法。一种垂直大型2-DE凝胶系统已经得到发展并应用于RLGS。在小鼠或者人类DNA的单个RLGS图谱中,在一向电泳1.0〜5.0kb,二向电泳0.2〜3kb的范围内可以观察到大约2000个DNA片段(点)。理论上,这个系统可检测两类基因组的改变:(1)得到或者丢失研究中使用的三种限制性内切酶的任一酶切位点,以及(2)插人/删除/重排等事件。当样品制备和电泳条件优化后,单个DNA样本的凝胶电泳得到的点的分布图谱可与其他样本比较。这种技术不需任何探针即可检测3000个DNA片段,因此在监测分布于基因组中DNA片段的I/D/R事件引起的突变方面相当有效。此方法直接标记DNA片段而非杂交,所以不需了解基因组的准确信息。因此,此方法可适用于任何物种。 作者:马丁,本实验来自「环境基因组学实验指南」
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