人T细胞活化过程中共识基因表达谱的时间分辨荟萃分析

背景：活化T细胞的协调转录调控基于信号网络的复杂动态行为。在外部刺激下，T细胞基因表达表现为冲动和持续模式。在这里，我们分析了不同T细胞群体中活化的时间模式，以开发T细胞活化的共识基因特征。结果：我们识别并验证了以时间分辨方式稳健评估T细胞活化的通用生物标志物特征。我们确定了包含活化期间多达10个不同时间点和不同极化条件下521个基因的时间分辨基因表达谱。基因特征包括T细胞活化的核心转录调控因子，代表连续的波以及持续的诱导模式。它们涵盖了多个T细胞群体中的持续抑制、中间和晚期反应表达模式，从而定义了T细胞活化的共识生物标志物特征。此外，CAR T细胞输注产物中的中间和晚期反应活化特征与免疫效应细胞相关神经毒性综合征相关。结论：这项研究首次描述了跨T细胞群体的时间分辨基因表达模式。这些生物标志物特征是宝贵的资源，例如，用合理数量的基因监测T细胞活化过程中的转录变化，在单细胞转录组研究中注释T细胞状态，或评估人类T细胞免疫的失调功能。