泰国住院急性腹泻患者的多重胃肠道检测板检测

Multiplex Gastrointestinal Panel Testing in Hospitalized Patients With Acute Diarrhea in Thailand

作者信息Anupop Jitmuang, Panuwat Lertlaksameewilai, Arnon Poorichitiporn, Navin Horthongkham, Methee Chayakulkeeree
PMID38962524
发布时间2024-06-15
DOI10.1093/ofid/ofae322

实验完整度

中

包含患者样本的前瞻性观察性研究,使用两种多重PCR检测板与传统诊断方法比较,并进行了多因素回归分析,但缺乏功能或机制验证。

主要模型

住院急性腹泻患者

重点核对

样本类型:新鲜粪便和Cary-Blair保存粪便(仅FA) 检测方法:Allplex(AP)和FilmArray(FA)胃肠道检测板 传统诊断:粪便培养、显微镜检查、艰难梭菌毒素基因PCR 样本量:199名住院患者 粪便样本采集时间:腹泻发作后中位数4天

摘要

背景 多重胃肠道(GI)检测板广泛用于门诊腹泻诊断。然而,多重检测在住院腹泻患者中的临床实用性尚未完全阐明。 方法 我们纳入了住院急性腹泻患者。患者的粪便样本一式三份采集;1份采用传统诊断,另2份分别采用Allplex(AP)和FilmArray(FA)GI检测板检测。回顾并分析临床数据。 结果 在199名受试者中,92名(46.5%)为男性,平均年龄66.3岁。腹泻发病中位数(四分位距)为住院后6(2–14)天。151名患者(75.9%)患有脓毒症,166名(83.4%)既往或当前接受过抗菌治疗。粪便培养阳性率为4/89(4.5%),艰难梭菌毒素基因检测阳性率为14/188(7.4%)。AP和FA多重检测的胃肠道病原体阳性率分别为49/199(24.6%)和40/199(20.1%)。AP最常检出的靶标为气单胞菌属。两种检测均常检出致病性大肠埃希菌(EPEC)、艰难梭菌毒素基因和沙门氏菌属;两种检测均未检出病原体的比例分别为75.4%和79.9%。发热(比值比[OR],2.05;95% CI,1.08–3.88;P = .028)、水样腹泻(OR,2.69;95% CI,1.25–5.80;P = .011)和抗菌治疗(OR,2.60;95% CI,1.18–5.71;P = .018)是与多重检测阴性结果独立相关的因素。 结论 多重GI检测板可有效检测住院受试者中与腹泻相关的肠道病原体。超过75%的病例病因未确诊。在实施检测前应考虑导致阴性结果的因素。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
多重胃肠道检测板在住院急性腹泻患者中的临床实用性如何?
核心机制
文中未明确说明。
主要证据
在199名住院患者中,AP和FA检测的阳性率分别为24.6%和20.1%,高于传统方法;发热、水样腹泻和抗菌治疗与阴性结果独立相关。
研究意义
多重GI检测板可提高住院腹泻患者的病原体检出率,但阳性结果需结合当地流行病学和患者情况解读,阴性结果可能与其他因素相关。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

患者纳入与样本采集

纳入符合急性腹泻定义的住院患者,并采集粪便样本用于后续检测。

纳入199名住院急性腹泻患者,采集3份粪便样本:1份用于传统诊断,另2份用于AP和FA检测。

2

传统实验室诊断

采用传统方法(显微镜检查、粪便培养、艰难梭菌毒素基因检测)检测粪便样本中的病原体。

对粪便样本进行直接显微镜检查、粪便培养(血琼脂、麦康凯、Hektoen、TCBS、MSRV等)和BD MAX Cdiff检测。

3

多重PCR GI面板检测

使用Allplex和FilmArray GI面板检测粪便样本中的多种肠道病原体,并与传统诊断结果比较。

对新鲜粪便样本进行AP检测,对Cary-Blair保存的粪便样本进行FA检测。

4

统计分析

分析检测结果与临床因素的关系,评估不同检测方法间的一致性。

使用卡方检验、t检验、Mann-Whitney U检验、多因素逻辑回归和Cohen's kappa进行数据分析。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
BD MAX Cdiff检测BD Diagnostics--
Allplex胃肠道检测板Seegene--
FilmArray胃肠道检测板BioFire Diagnostics--
NucliSENS裂解缓冲液bioMerieux--
NucliSENS easyMAG自动化提取系统bioMerieux--
Vitek-2自动化表型鉴定系统bioMérieux--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
患者纳入
年龄、腹泻定义(≥3次/天)、排除标准
阅读提示:Methods 部分
样本采集
粪便样本采集时间(中位数4天)、存储条件
阅读提示:Methods 部分
传统诊断
培养条件、检测目标
阅读提示:Methods 部分,Table 1
多重PCR GI面板
AP和FA检测的样本类型、仪器、试剂
阅读提示:Methods 部分,Table 2
统计分析
多因素逻辑回归变量、显著性阈值
阅读提示:Methods 部分,Table 5