评估scFv76对变异株的体外结合和中和活性
验证scFv76是否对包括Omicron在内的变异株保持结合和中和能力
通过ELISA和SPR测定scFv76与Delta和Omicron刺突蛋白的结合亲和力及抑制ACE2结合的能力;通过假病毒和活病毒中和实验测定IC50。
Spike mutation resilient scFv76 antibody counteracts SARS-CoV-2 lung damage upon aerosol delivery
包含体外多种细胞系和假病毒/活病毒中和实验、体内hACE2转基因小鼠肺炎模型及组织病理和分子表达分析、以及冷冻电镜结构解析,多层次验证功能与机制。
hACE2转基因小鼠(K18-hACE2)肺炎模型 Vero E6细胞 Calu-3细胞 A549-hACE2细胞
Delta感染剂量为1x10^5 TCID50/小鼠,经鼻内感染 scFv76雾化剂量为3 mg/mL,每次2.5 mL,感染后1小时和8小时各一次,随后每天两次,共2天 中和/融合实验采用scFv76浓度范围及孵育时间 qRT-PCR检测病毒RNA,以2019-nCoV_N1基因和Rlp32为内参
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证scFv76是否对包括Omicron在内的变异株保持结合和中和能力
通过ELISA和SPR测定scFv76与Delta和Omicron刺突蛋白的结合亲和力及抑制ACE2结合的能力;通过假病毒和活病毒中和实验测定IC50。
评估scFv76能否阻止Omicron刺突介导的细胞融合
使用表达Omicron BA.1或BA.2刺突的HEK293T细胞与表达hACE2的A549细胞共培养,在存在或不存在scFv76的情况下观察合胞体形成。
在体内评估雾化递送scFv76对Delta感染的治疗效果
K18-hACE2转基因小鼠经鼻内感染SARS-CoV-2 Delta株,随后通过雾化给予scFv76或PBS,监测体重变化,并在感染后第4天检测肺和鼻甲中的病毒载量、组织病理及炎症因子表达。
从分子层面解释scFv76的广谱中和机制
将纯化的SARS-CoV-2刺突蛋白与scFv76孵育后制备冷冻样品,进行单颗粒冷冻电镜数据采集和处理,得到复合物结构,并分析抗原-抗体相互作用界面。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外结合和中和实验 | 重组刺突蛋白的浓度、来源和批号;SPR固定水平和流速;细胞系和MOI;病毒株信息 阅读提示:Materials and methods: Spike/ACE2 binding competition; SPR; Virus neutralization in Calu-3 cells; Microneutralization assay |
| 细胞融合实验 | 转染试剂和用量;scFv76浓度和孵育时间;融合定量方法 阅读提示:Materials and methods: Cell-cell fusion assay |
| 动物实验 | 小鼠品系、性别和年龄;感染剂量和途径;scFv76浓度、体积和给药时间表;雾化器型号和参数;安乐死时间点 阅读提示:Materials and methods: In vivo pharmacological evaluation of nebulized scFv76 in a model of SARS-CoV-2 Delta pulmonary infection; Figure 2A |
| 组织病理学和基因表达分析 | 肺灌注和固定方法;切片厚度;评分标准;RNA提取方法;引物和探针序列;内参基因 阅读提示:Materials and methods: Histopathological analysis; qRT-PCR for viral copy quantification and gene expression analysis |
| 冷冻电镜结构解析 | 蛋白浓度和孵育条件;冷冻制样参数;电镜型号和参数;数据处理软件版本和参数;分辨率判断标准 阅读提示:Materials and methods: Electron microscopy sample preparation; EM data collection and image processing |