2010-2021年纽约市利福平单耐药结核病:一项回顾性病例系列研究

Rifampin Mono-Resistant Tuberculosis in New York City, 2010-2021: A Retrospective Case Series

作者信息Joseph A Lindsey, Alice V Easton, Herns Modestil, Felicia Dworkin, Joseph Burzynski, Diana Nilsen
PMID38023554
发布时间2023-11-21
DOI10.1093/ofid/ofad534

实验完整度

低

本研究为回顾性病例系列,基于监测数据进行描述性分析,缺乏前瞻性实验设计和功能验证,实验细节不足。

主要模型

纽约市结核病监测病例队列

重点核对

利福平耐药诊断方法(表型或分子药敏试验) HIV感染状态 治疗完成情况 利福平从方案中移除的时间

摘要

背景:尽管相对罕见,利福平单耐药结核病(RMR TB)对有效的结核病治疗和控制构成重要挑战。需要关于RMR TB负担和治疗结局的信息来指导诊断和管理。方法:从纽约市(NYC)结核病监测系统中收集2010-2021年间在NYC接受RMR TB治疗的患者的标准化变量。结果:在2010-2021年报告的7097例结核病病例中,31例(<1%)在临床上按RMR TB治疗。其中5例(16%)为HIV感染者。17例(55%)患者的结核分枝杆菌对利福平耐药是通过分子和表型药敏试验同时确定的;2例(6%)仅通过表型试验确定利福平耐药,未进行分子检测;12例(39%)仅基于分子检测确定。这12例中,7例表型试验显示对利福平敏感,其余5例无法进行表型试验。31例中10例(32%)在2010-2015年确诊;其余21例(包括12例中仅通过分子检测确诊的10例)在2016-2021年确诊。31例患者中,21例(68%)完成了治疗(中位治疗持续时间为18个月)。尽管研究期间从结核病治疗开始到更换为非利福霉素方案的时间间隔显著缩短,但2010年至2021年期间总治疗持续时间未显著下降。结论:分子药敏试验识别出了表型检测未发现的RMR TB病例,并有助于及时调整结核病治疗方案。需要短程方案来缩短RMR TB的治疗持续时间。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
纽约市2010-2021年间利福平单耐药结核病的负担、特征和纵向趋势如何?
核心机制
分子药敏试验(如Xpert MTB/RIF)可检测rpoB基因突变,从而识别表型药敏试验可能漏诊的利福平耐药病例。
主要证据
基于纽约市结核病监测系统的7097例结核病患者中,31例被临床确定为利福平单耐药结核病;其中12例仅通过分子药敏试验确诊,占比39%;研究期间利福平从治疗方案中移除的时间显著缩短。
研究意义
分子诊断有助于及时识别RMR TB并调整治疗方案,但需要短程方案来缩短治疗持续时间;研究结果提示RMR TB不再仅限于HIV感染者。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

病例识别与纳入

确定纽约市2010-2021年间临床上按利福平单耐药结核病治疗的患者。

利用纽约市结核病电子监测系统识别病例,结合监测记录和临床判断,最终纳入31例患者。

2

数据收集与特征描述

收集并描述患者的入口学、临床、诊断和治疗特征。

提取标准化变量,包括性别、年龄、出生国家、HIV状况、糖尿病史、结核病史、病变部位、治疗地点和直接面视下服药等,并进行统计分析。

3

诊断方法评估

评估表型和分子药敏试验在识别利福平耐药中的使用和结果不一致情况。

记录患者的表型药敏试验(MGIT、固体琼脂比例法、MIC)和分子药敏试验(Xpert、GenoType MDRTBplus/sl、焦磷酸测序、Sanger测序、全基因组测序)结果,并比较不同方法的一致性。

4

治疗结局追踪

评估患者的治疗完成率及死亡、失访等结局。

追踪患者的治疗结局,计算治疗完成率,并描述未完成治疗的原因。

5

治疗过程的时间趋势分析

分析治疗开始至移除利福平的时间、以及总治疗持续时间的变化趋势。

使用线性回归分析时间趋势,计算从结核病治疗开始到移除利福平的天数,以及从治疗开始到完成治疗的天数。

6

治疗方案分析

总结RMR TB患者使用的药物方案及其变化。

分析初始方案、是否使用注射剂、氟喹诺酮类、BPaL等,并描述随时间的变化。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

验证样本或模型特征
数据分析与统计

产品清单

实验环节名称品牌货号
Xpert MTB/RIF检测Cepheid--
GenoType MDRTBplusHain LifeScience--
GenoType MDRTBslHain LifeScience--
分枝杆菌生长指示管(MGIT)Becton Dickinson--
Maven 5.4.系统Conduent Inc.--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
病例定义
利福平单耐药的定义(对利福平耐药但对异烟肼敏感)以及不确定结果时的临床判断。
阅读提示:Methods - Definitions and Inclusion Criteria
数据来源
纽约市结核病监测系统的具体数据字段和病例纳入标准。
阅读提示:Methods - Study Design and Data Collection
药敏试验
表型药敏试验的方法(MGIT、比例法、MIC)和分子药敏试验的方法(Xpert、GenoType、测序),以及结果判读标准。
阅读提示:Methods - Study Design and Data Collection, Results - Diagnostic Methods
治疗结局
治疗完成的具体定义,未完成治疗的原因分类(死亡、迁移、拒绝、失访)。
阅读提示:Results - Table 1, Methods - Definitions and Inclusion Criteria
时间趋势分析
线性回归模型的变量(年份、天数),显著性阈值,以及缺失数据的处理方式。
阅读提示:Methods - Analysis, Results - Trends in Time to Removal of RIF From Treatment Regimens