检测eCypA在病毒感染中的表达
验证eCypA在病毒感染细胞、小鼠和患者中是否上调。
通过ELISA检测感染IAV、IBV或SARS-CoV-2的患者血清、小鼠BALF/血清及细胞培养上清中的eCypA水平。
The extracellular cyclophilin A-integrin β2 complex as a therapeutic target of viral pneumonia
包含细胞模型、小鼠模型和患者样本等多个证据层级,并有功能验证(抗体治疗)和机制验证(通路抑制、基因敲除)。
小鼠病毒性肺炎模型(IAV、IBV、SARS-CoV-2感染) 人单核细胞系THP1 人肺上皮细胞A549 患者血清样本
病毒感染的剂量和途径:IAV(3000 PFU)、IBV(10000 PFU)、SARS-CoV-2(100000 PFU)鼻内感染 抗CypA mAb处理:100 μg/只腹腔注射 磷酸盐缓冲液(PBS)作为对照 检测时间点:1、2、4、6天感染后 样本量:每组5-15只小鼠
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证eCypA在病毒感染细胞、小鼠和患者中是否上调。
通过ELISA检测感染IAV、IBV或SARS-CoV-2的患者血清、小鼠BALF/血清及细胞培养上清中的eCypA水平。
评估抗CypA mAb是否能减轻病毒诱导的炎症反应和肺损伤。
IBV、IAV或SARS-CoV-2感染的小鼠用OSE、抗CypA mAb或两者联合治疗,检测BALF中细胞因子水平、肺组织免疫荧光、micro-CT、H&E染色和生存率。
确定eCypA的新受体,并验证其与整合素β2的结合。
通过质谱鉴定CypA结合膜蛋白,使用ELISA、免疫沉淀、表面等离子共振(SPR)等方法验证CypA与整合素β2的结合及抗CypA mAb的阻断作用。
证明eCypA通过整合素β2激活触发白细胞粘附与迁移。
使用流式细胞术检测CD11/CD18激活,免疫共沉淀检测talin和kindlin-3结合,粘附和跨内皮迁移实验评估白细胞功能。
验证eCypA通过整合素β2-FAK-GTPase轴促进白细胞运输,并通过FAK-ERK-P65轴促进细胞因子产生。
使用siRNA敲低整合素β2、FAK抑制剂PF573228处理,检测FAK磷酸化、GTPase活性、F-actin聚合和细胞因子表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | GIBCO | -- |
| RPMI 1640培养基 | GIBCO | -- | |
| 胎牛血清 | GIBCO | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Sigma | -- | |
| MycoBlue支原体检测试剂盒 | Vazyme | -- | |
| 试验 | 细胞间粘附分子1 | -- | -- |
| 蛋白表达与纯化 | His标记的CypA | -- | -- |
| 整合素β2 | -- | -- | |
| CD147 | -- | -- | |
| Fc标记的CypA | -- | -- | |
| 蛋白互作 | 抗CypA单克隆抗体 | BGI Genomics | -- |
| 表面等离子共振 | Biacore T200生物分子相互作用分析仪 | Cytiva | -- |
| CM5传感芯片 | Cytiva | BR100530 | |
| 胺偶联试剂盒 | Cytiva | BR-1000-50 | |
| Rho GTPase活性检测 | RhoA/Rac1/CDC42激活检测生化试剂盒 | Cytoskeleton | BK030 |
| 细胞因子检测 | ProcartaPlex多重免疫分析试剂盒 | LAIZEE BIOTECH | EPX360-26092-901 |
| ELISA试剂盒 | MULTISCIENCES | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| qPCR | SYBR Premix Ex Taq试剂 | TaKaRa | -- |
| ABI 7500实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 小动物成像 | Quantum FX微型CT成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 细胞计数 | 自动细胞计数器 | Thermo Fisher | -- |
| 跨内皮迁移 | Transwell插入式培养皿 | Millipore | -- |
| 膜蛋白提取 | Mem-PER Plus膜蛋白提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 病毒中和 | 奥司他韦 | -- | -- |
| 抑制剂 | PF573228 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病毒感染模型 | 病毒毒株和剂量:IAV(3000 PFU)、IBV(10000 PFU)、SARS-CoV-2(100000 PFU) 阅读提示:Materials and methods, Virus and virus infection |
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件:DMEM或RPMI 1640,10% FBS,37°C,5% CO2 阅读提示:Materials and methods, Cell lines |
| 药物处理 | 抗CypA mAb剂量(100 μg/小鼠)和OSE剂量(200 μg/小鼠/24h),给药方式:腹腔注射 阅读提示:Results, Figure 2A legend |
| eCypA检测 | ELISA检测eCypA的方法和样本类型(血清、BALF、细胞上清) 阅读提示:Materials and methods, ProcartaPlex Multiplex Immunoassays and ELISA |
| 白细胞功能检测 | eCypA浓度(10 nM)和抗CypA mAb浓度(50 nM),粘附时间30分钟,迁移时间12小时 阅读提示:Materials and methods, Adhesion assay, Transendothelial migration assay |