秘鲁亚马逊地区人类免疫缺陷病毒感染者的神经系统感染的临床和宏基因组学特征

背景：神经系统机会性感染在人类免疫缺陷病毒（HIV）感染者中导致显著的发病率和死亡率，但诊断困难。方法：对秘鲁伊基托斯140名有急性神经系统症状的HIV感染者，通过脑脊液弓形虫定量聚合酶链反应（qPCR）评估脑弓形虫病，并通过血清或脑脊液的隐球菌抗原试验（CrAg）评估隐球菌性脑膜炎。使用标准统计学方法评估组间差异。对部分样本进行脑脊液宏基因组二代测序（mNGS），以比较标准诊断方法并确定额外的诊断。结果：通过qPCR诊断27名参与者患有脑弓形虫病，13名通过CrAg诊断患有隐球菌性脑膜炎。与无脑弓形虫病的参与者相比，格拉斯哥昏迷评分异常（P = .05）、单侧局灶性运动体征（P = .01）、巴宾斯基反射阳性（P = .01）和头颅CT多发灶（P = .002）与脑弓形虫病相关。畏光（P = .03）和头颅CT无病灶（P = .02）与隐球菌性脑膜炎相关。42份样本的mNGS发现了8例脑弓形虫病、7例隐球菌性脑膜炎、5例可能的结核性脑膜炎，以及乙型肝炎病毒（n = 1）和pegivirus（n = 1）的偶然检测。mNGS与弓形虫qPCR的阳性一致率为71%，阴性一致率为91%。mNGS对隐球菌诊断的敏感性为78%，特异性为100%。结论：仅34%的参与者通过任何方法诊断出感染，这证明了在该人群中诊断神经系统机会性感染的挑战，并强调需要更广泛、更敏感的检测方法用于中枢神经系统感染。