RESET结构设计与优化
确定最佳的RESET组件(铰链、CD3亚基、VHH方位)以确保高效的TCR整合和功能。
构建了不同变体(RESET-28h, RESET-4h, RESET-nh, RESET-γ, RESET-flip),在T细胞中表达,并与CD33+ HL-60或OCI-AML3细胞共培养,检测IFN-γ和IL-2产生。
RESET: A TCR-coupled antigen receptor with superior targeting sensitivity and reversible drug-regulated anti-tumor activity
包含体外细胞实验(细胞系共培养、细胞毒性、增殖)、体内小鼠模型(异种移植瘤)、转录组分析(RNA-seq)及基因编辑验证(TCR敲除),具有多层次功能与机制验证。
CD33+ HL-60 AML细胞系 低抗原密度OCI-AML3细胞系 NSG小鼠异种移植瘤模型 原代人T细胞
T细胞通过megaTAL敲除TCRα(TRAC)后,RESET功能丧失,验证了对TCR的依赖性 RESET的激活依赖于同时存在抗原和雷帕霉素,两者缺一不可 在低抗原密度(CD33约2,000拷贝,CLL1约200拷贝)下,RESET-T细胞仍显示显著细胞因子产生和体内抗肿瘤活性 使用20 nM非免疫抑制性雷帕霉素类似物(AP21967)进行体外实验 体内实验使用4 mg/kg rapalog或0.5 mg/kg Rapamune口服给药,每周3次
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定最佳的RESET组件(铰链、CD3亚基、VHH方位)以确保高效的TCR整合和功能。
构建了不同变体(RESET-28h, RESET-4h, RESET-nh, RESET-γ, RESET-flip),在T细胞中表达,并与CD33+ HL-60或OCI-AML3细胞共培养,检测IFN-γ和IL-2产生。
确认RESET功能依赖于内源性TCR复合物的整合。
使用TRAC靶向megaTAL敲除T细胞中的TCR表达,然后转导RESET或DARIC,与HL60细胞共培养,检测FRB表达和IFN-γ产生。
比较RESET、DARIC、CAR和TCR-T细胞的转录激活谱,评估信号保真度。
对激活或静息状态的T细胞进行RNA-seq,分析差异表达基因,PCA和WGCNA分析。
比较RESET与DARIC、TRuC在细胞因子产生、细胞毒性和增殖方面的功能。
将转导的T细胞与HL60细胞共培养,检测IFN-γ、IL-2分泌,细胞毒性(Incucyte)和增殖。
在NSG小鼠模型中评估RESET-T细胞的抗肿瘤活性和生存期。
NSG小鼠静脉注射表达荧光素酶的HL-60或OCI-AML3肿瘤细胞,随后输注不同架构的T细胞,定期测量肿瘤负担和生存率。
定量评估RESET-T细胞在不同抗原密度下的敏感性。
用不同浓度的CD33 mRNA电穿孔HL60.CD33KO细胞,产生不同抗原密度的靶细胞,与RESET、DARIC、CAR-T细胞共培养,检测IL-2。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 慢病毒生产 | Transit-2020转染试剂 | Mirus | MIR5404/5400/5405/5406 |
| T细胞培养 | X-Vivo 15培养基 | Lonza | BEBP04-744Q |
| 人AB血清 | Valley Biomedical | HP1022HI | |
| GlutaMAX添加剂 | Thermo Fisher Scientific | 35050061 | |
| HEPES缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | 15630-080 | |
| 重组人IL-2 | CellGenix | 1020-1000 | |
| T细胞激活 | 抗CD3抗体 | Miltenyi | 130-093-387 |
| 抗CD28抗体 | Miltenyi | 130-093-375 | |
| 流式细胞术 | LIVE/DEAD Fixable Near-IR死细胞染色试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | L10119 |
| Fc阻断剂 | BD Biosciences | 564220 | |
| 抗IFN-γ抗体 | BioLegend | 506518 | |
| BD Cytofix/Cytoperm固定/破膜试剂盒 | BD Biosciences | 554714 | |
| 抗FRB抗体 | Olympic Protein Technologies | -- | |
| 抗FKBP抗体 | Thermo Fisher | Mab24953 | |
| 抗CD45RA抗体 | BioLegend | 304148 | |
| 抗CCR7抗体 | BioLegend | G043H7 | |
| 抗CD62L抗体 | BD Biosciences | 563862 | |
| 抗CD4抗体 | BD Biosciences | 562970 | |
| 抗CD8抗体 | BD Biosciences | 557945 | |
| 抗CD3抗体 | BioLegend | 317322 | |
| 抗TCRα/β抗体 | BioLegend | 306712 | |
| 抗VHH抗体 | GenScript | A01994 | |
| 抗CD33抗体 | Acro | CD3-H82E7 | |
| UltraComp eBeads Plus补偿微珠 | Invitrogen | 01-3333-42 | |
| 细胞因子检测 | 稀释液2 | Meso Scale Discovery (MSD) | R51BB-2 |
| V-PLEX人IFN-γ检测试剂盒 | Meso Scale Discovery (MSD) | K151QOD-4 | |
| V-PLEX定制人生物标志物试剂盒 | Meso Scale Discovery (MSD) | K151A9H-4 | |
| 细胞毒性/增殖检测 | Incucyte活细胞成像系统 | Sartorius | -- |
| 多聚-L-鸟氨酸 | Millipore Sigma | A-004-C | |
| RNA-seq | miRNeasy 96试剂盒 | Qiagen | 217061 |
| 4200 TapeStation系统 | Agilent | -- | |
| D1000 ScreenTape | Agilent | 5067-5582 | |
| KAPA RNA HyperPrep试剂盒 | Roche | 07962363001 | |
| NextSeq 500/550 High Output 150循环试剂盒 | Illumina | 20024907 | |
| TCR敲除 | megaTAL mRNA | -- | -- |
| DNeasy血液和组织试剂盒 | Qiagen | 69504 | |
| Q5聚合酶预混液 | NEB | M0492L | |
| GolgiPlug蛋白转运抑制剂 | BD Biosciences | 555029 | |
| 抗原敏感性分析 | Quantibrite定量微球 | BD Biosciences | 340495 |
| CD33 mRNA | TriLink | -- | |
| 抗CD33抗体 | BioLegend | 266608 | |
| 同型对照 | BioLegend | 4001114 | |
| 动物实验 | 雷帕霉素口服溶液 | Pfizer | NDC |
| 雷帕霉素类似物(AP21967) | Takara | 635095 | |
| 流式细胞术 | REAlease CD4/CD8(TIL)微珠试剂盒 | Miltenyi | 130-121-561 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| RESET构建与转导 | RESET载体结构(FRB-CD3融合和VHH-FKBP融合)及转导方法 阅读提示:Materials and methods: Plasmid construction, Lentivirus production, T cell production |
| 体外共培养 | 效应细胞与肿瘤细胞比例,共培养时间,雷帕霉素浓度(1 nM或20 nM rapalog),检测指标(IFN-γ, IL-2) 阅读提示:Materials and methods: Cytokine assays, Cytotoxicity and proliferation assays |
| TCR依赖性验证 | TCR敲除效率,megaTAL浓度,共培养时间和比例,IFN-γ检测 阅读提示:Materials and methods: TCR KO assay and indel analysis; Figure 2A-D |
| 转录组分析 | 刺激条件(A549细胞、18小时),RNA提取方法,测序平台,数据分析软件(STAR, RSEM) 阅读提示:Materials and methods: Transcriptomics assay, RNA-seq data processing, Differential gene expression |
| 体内实验 | 小鼠品系(NSG),肿瘤细胞注射量和途径,T细胞剂量,rapalog/Rapamune给药剂量和频率,成像方法 阅读提示:Materials and methods: In vivo studies; Figure 3F-G, 4C-D |