体外筛选Tα1调控的生物学通路
确定CD8+ T细胞在LPS刺激条件下Tα1影响的信号通路和生物过程。
使用以往微阵列数据,对CD8+ T细胞单独或联合LPS和Tα1处理后差异表达基因进行富集分析。
Thymosin Alpha 1 Mitigates Cytokine Storm in Blood Cells From Coronavirus Disease 2019 Patients
研究包含体外细胞实验(LPS刺激CD8+ T细胞)和离体患者样本实验,但缺乏体内动物模型或多中心临床验证。
CD8+ T细胞 COVID-19患者血细胞 健康供者(HD)血细胞
外周血样本:来自15名SARS-CoV-2阳性个体和4名健康供者 体外Tα1处理:浓度50 μg/mL,处理8小时,37°C,5% CO2 检测指标:细胞因子基因表达(RT-qPCR),蛋白表达(流式细胞术) 统计分析:非参数Kruskal-Wallis检验和Friedman检验,Spearman相关系数
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定CD8+ T细胞在LPS刺激条件下Tα1影响的信号通路和生物过程。
使用以往微阵列数据,对CD8+ T细胞单独或联合LPS和Tα1处理后差异表达基因进行富集分析。
评估Tα1离体处理对COVID-19患者血细胞中细胞因子基因表达的影响。
对COVID-19患者和健康供者血细胞进行Tα1离体处理,随后提取RNA,通过实时PCR检测细胞因子相关基因表达。
检测Tα1处理对CD4+和CD8+ T细胞活化标志物和细胞内细胞因子表达的影响。
通过流式细胞术分析Tα1处理前后血细胞中CD4+和CD8+ T细胞亚群中IL-6、CD38、HLA-DR的表达。
探究CD8+ T细胞活化标志物与细胞因子表达之间的相关性,以及Tα1处理对该相关性的影响。
使用Spearman相关系数分析患者中流式检测的CD38和HLA-DR表达与血液中mRNA水平的相关性,并比较Tα1处理前后的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 药物处理 | 胸腺肽α1 | SciClone Pharmaceuticals | -- |
| RNA提取 | 血液总RNA提取试剂盒 | GRiSP | -- |
| 逆转录 | ImProm-II逆转录系统 | Promega | -- |
| 实时PCR | SYBR Green | SMOBiO | -- |
| 流式细胞术 | 抗人CD38-ECD抗体 | Beckman Coulter | -- |
| CD8-BV605抗体 | Beckman Coulter | -- | |
| PD1-BV711抗体 | Beckman Coulter | -- | |
| HLA-DR-PE抗体 | BD Biosciences | -- | |
| CD56-PE抗体 | BD Biosciences | -- | |
| CD3-BV510抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗IL-6 FITC抗体 | ImmunoTools | -- | |
| 抗IFNγ BV650抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗TNFα AF700抗体 | Beckman Coulter | -- | |
| VersaLyse裂解液 | -- | -- | |
| IntraPrep透化试剂盒 | -- | -- | |
| CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本采集 | 患者入组标准、健康对照的年龄性别匹配情况、样本文本信息(详见表S1) 阅读提示:Methods: Subject Details |
| 离体处理 | Tα1浓度(50 μg/mL)、处理时间(8小时)、处理温度(37°C)、CO2浓度(5%)、培养基成分(RPMI 1640, 2 mM L-谷氨酰胺, 100 U/mL青霉素, 0.1 mg/mL链霉素, 10%胎牛血清) 阅读提示:Methods: Ex Vivo Treatment |
| 基因表达分析 | RNA提取试剂盒(GRiSP的血液总RNA提取试剂盒)、逆转录系统(Promega的ImProm-II)、实时PCR仪器(Bio-Rad CFX96)、SYBR Green(SMOBiO)、引物序列(见补充表S2) 阅读提示:Methods: Real-Time Analysis |
| 流式细胞术 | 抗体克隆号、荧光染料、孵育时间(15分钟)、裂解液(VersaLyse)、透化试剂盒(IntraPrep)、流式细胞仪(CytoFLEX)和软件(CytExpert 2.0) 阅读提示:Methods: Flow Cytometry Analysis |
| 统计分析 | 非参数检验(Kruskal-Wallis和Friedman)、Spearman相关性、多变量线性混合模型、Dunn-Šidák校正 阅读提示:Methods: Statistical Analysis |