2018年7月至2022年12月2家儿童医院社区起病革兰阳性菌侵袭性感染

Invasive Community-Onset Gram-Positive Infections From July 2018 Through December 2022 at 2 Children's Hospitals

作者信息Eric E Engstrom, Alexander S Plattner, J Chase McNeil, Kristina G Hulten, Patrick J Reich, Mary G Boyle, James J Dunn, Stephanie A Fritz, Sheldon L Kaplan
PMID38023538
发布时间2023-11-09
DOI10.1093/ofid/ofad563

实验完整度

中

多中心回顾性与前瞻性监测结合,分析年度发病率趋势及与病毒感染的关联,但未进行功能实验或机制验证。

主要模型

儿童患者队列(<18岁,社区起病侵袭性感染) 两家儿童医院(Texas Children's Hospital和St Louis Children's Hospital)

重点核对

患者年龄范围:<18岁,非新生儿,社区起病 感染定义:从正常无菌部位分离出目标病原体,排除仅PCR阳性及医疗相关病例 分母:每年非新生儿儿科入院数 病毒检测:每月阳性病毒检测结果数(RSV、流感、SARS-CoV-2) 统计:年率比及95% CI,P值,采用Stata 15

摘要

背景 由化脓性链球菌(侵袭性A族链球菌[iGAS])和肺炎链球菌(侵袭性肺炎球菌病[IPD])引起的侵袭性感染在COVID-19大流行初期显著减少。我们的研究旨在评估这种减少的程度以及自大流行相关的社会调整逆转以来这些感染的趋势。我们还希望比较这些感染与侵袭性社区起病金黄色葡萄球菌(I-CO-SA)感染及常见呼吸道病毒感染在此期间的频率。 方法 在2018年7月至2022年12月期间,通过两家美国大型儿童医院的阳性培养,前瞻性和回顾性地识别iGAS、IPD和I-CO-SA感染病例。使用入院数据来估计频率。作为比较,通过各机构病毒检测阳性结果的数量估计呼吸道合胞病毒(RSV)、流感和SARS-CoV-2的比率。 结果 I-CO-SA感染在研究期间变化不大。iGAS感染和IPD的比率分别从2019年到2020年下降了46%和44%,与RSV和流感的大幅下降同时发生。2022年,RSV和流感感染率增加到大流行前冬季季节的水平,同时IPD恢复到疫情前的水平(从2021年到2022年增加225%),而iGAS感染则激增超过疫情前的水平(从2021年到2022年增加543%)。 结论 COVID-19大流行对IPD和iGAS感染产生了意想不到的影响,这种影响在时间上与病毒感染率的变化相关。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
COVID-19大流行对儿童iGAS、IPD和I-CO-SA感染的年度趋势有何影响,且这种影响是否与常见呼吸道病毒感染相关?
核心机制
非药物干预措施(如口罩、社交距离)导致呼吸道病毒传播减少,进而影响与病毒相关的侵袭性细菌感染的发生。
主要证据
在两个儿童医院,2020年iGAS和IPD率下降(分别下降46%和44%),2022年回升至疫情前水平或更高,而I-CO-SA保持稳定。
研究意义
研究表明大流行对iGAS和IPD有独特影响,与病毒感染相关,但iGAS和IPD与I-CO-SA的差异趋势的影响和临床意义尚需进一步研究。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

病例识别与数据收集

确定符合研究定义的侵袭性革兰阳性菌感染病例。

在两家医院,对2018年7月至2022年12月期间培养阳性的社区起病侵袭性感染进行前瞻性和回顾性监测,收集人口统计学和临床数据。

2

计算年感染率

评估三年间各细菌感染的发生频率变化。

使用每年非新生儿入院数作为分母,计算每10000人院的年感染率,并比较各年间的率比。

3

分析病毒检测数据

评估呼吸道病毒感染趋势与细菌感染趋势的时间关联。

收集各医院每月RSV、流感和SARS-CoV-2阳性检测结果数,与细菌感染率进行比较。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
Stata 15StataCorp LLC--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
病例识别
培养阳性社区起病侵袭性感染,年龄<18岁,正常无菌部位分离,排除仅PCR阳性及医疗相关病例
阅读提示:Methods部分,病例识别和纳入/排除标准
率计算
每年非新生儿入院数(2019: 33,102;2020: 27,200;2021: 32,337;2022: 35,023)
阅读提示:Methods部分,分母定义及图2注
统计分析
率比计算及95% CI,P值;统计软件为Stata 15
阅读提示:Methods部分,数据分析和表2
病毒数据
每月RSV、流感和SARS-CoV-2阳性检测结果数
阅读提示:Methods部分,病毒检测收集和图1