纳米包裹及理化性质表征
制备GCN并验证其粒径、zeta电位、包封率及稳定性。
将GRC提取物与壳聚糖纳米颗粒结合,通过离心获得GCN,利用DLS测量粒径,TAC法评估抗氧化活性,HPLC测定腺苷含量。
Nano-Encapsulated Black Bean-Cultivated Cordyceps militaris Attenuates PM- and LPS-Induced Airway Inflammation
包含体外细胞实验(A549)验证细胞活力、ROS、基因和蛋白表达,并结合生物信息学分析;但缺少动物或体内模型验证。
A549 人肺泡 II 型上皮细胞 PM2.5 和 LPS 共暴露诱导的 A549 细胞炎症模型
PM2.5 来源和粒径分布(DLS 平均 318 ± 33.7 nm) GCN 和 GRC 的处理浓度(25-200 μg/mL)及孵育时间 LPS 浓度(5.5 ng/mL) RT-PCR 检测基因表达(TNF-α, CXCL-2, TRPC6) Western blot 检测蛋白磷酸化(p-IκB, p-NF-κB, p-c-Jun, p-ERK, p-JNK, p38)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
制备GCN并验证其粒径、zeta电位、包封率及稳定性。
将GRC提取物与壳聚糖纳米颗粒结合,通过离心获得GCN,利用DLS测量粒径,TAC法评估抗氧化活性,HPLC测定腺苷含量。
检测GCN对PM和LPS联合诱导的A549细胞毒性的保护作用。
A549细胞预先给予不同浓度GCN或GRC处理1小时,再与PM(200 μg/mL)和LPS(5.5 ng/mL)共孵育24小时,CCK-8法测定细胞活力,计算EC50、CC50和TI。
评估GCN对PM和LPS诱导的细胞内ROS产生的抑制作用。
A549细胞经GCN或GRC预处理后,与PM(200 μg/mL)和LPS(5.5 ng/mL)共处理4小时,使用DCFH-DA荧光探针检测ROS水平。
通过公共转录组数据分析,识别PM和LPS诱导肺部炎症的关键基因和通路。
从GEO数据库获取GSE193958和GSE41684数据集,用GEO2R分析DEGs,与GeneCards靶基因取交集,STRING构建PPI网络,CytoHubba筛选hub基因,DAVID进行GO和KEGG富集分析。
验证GCN对PM和LPS诱导的A549细胞中TNF-α、CXCL-2和TRPC6 mRNA表达的影响。
A549细胞经GCN或GRC预处理1小时后,加入PM(200 μg/mL)和LPS(5.5 ng/mL)刺激12小时,提取RNA,RT-PCR检测基因表达。
验证GCN对PM和LPS激活的MAPK/NF-κB/AP-1信号通路的抑制作用。
A549细胞经GCN或GRC预处理1小时后,与PM(200 μg/mL)和LPS(5.5 ng/mL)共处理1小时,提取总蛋白,Western blot检测p-ERK、p-JNK、p-p38、p-IκB、p-NF-κB和p-c-Jun的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 纳米颗粒制备 | 壳聚糖 | -- | -- |
| 总抗氧化能力测定 | 磷酸钠 | Sigma-Aldrich | -- |
| 钼酸铵 | Samchun Pure Chemical Co., Ltd. | -- | |
| 抗坏血酸 | Sigma-Aldrich | -- | |
| HPLC分析 | Zorbax ODS C18色谱柱 | Agilent Technologies | -- |
| 细胞培养与处理 | RPMI 1640培养基 | Welgene | -- |
| 胎牛血清 | Welgene | -- | |
| 青霉素和链霉素 | Welgene | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo Laboratories | -- |
| 细胞损伤诱导 | 脂多糖 | Sigma Aldrich | -- |
| 二甲基亚砜 | Sigma Aldrich | -- | |
| ROS检测 | DCFH-DA荧光探针 | Abcam | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | ReverTra Ace qPCR RT试剂盒 | Toyobo Biologics Inc. | -- |
| PCR引物合成 | 引物 | Bionics | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Cell Signaling Technology | -- |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | -- | |
| p-IκB抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 磷酸化NF-κB抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| HRP标记的抗兔IgG二抗 | Cell Signaling Technology | -- | |
| EzWestLumi plus化学发光液 | ATTO Corporation | -- | |
| DLS分析 | DynaPro板读取器II | Wyatt Technology | -- |
| 荧光显微镜 | 尼康Eclipse Ti荧光显微镜 | Nikon | -- |
| 荧光强度检测 | EnSpire荧光酶标仪 | PerkinElmer | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力检测 | A549细胞预处理浓度(25-200 μg/mL GCN或GRC)和时间(1小时);PM和LPS浓度(200 μg/mL 和5.5 ng/mL)及共处理时间(24小时) 阅读提示:见2.5节和Figure 2 |
| ROS检测 | A549细胞预处理浓度(200 μg/mL)和时间(1小时);PM和LPS浓度(200 μg/mL 和5.5 ng/mL)及共处理时间(4小时);DCFH-DA浓度(25 μM)和孵育时间(45分钟) 阅读提示:见2.7节和Figure 3 |
| RT-PCR | A549细胞预处理浓度(200 μg/mL)和时间(1小时);PM和LPS浓度(200 μg/mL 和5.5 ng/mL)及刺激时间(12小时);引物序列 阅读提示:见2.12节和Figure 5 |
| Western blot | A549细胞预处理浓度(200 μg/mL)和时间(1小时);PM和LPS浓度(200 μg/mL 和5.5 ng/mL)及刺激时间(1小时);抗体稀释度 阅读提示:见2.13节和Figure 6 |
| 生物信息学分析 | GEO数据集的选择(GSE193958, GSE41684);DEGs筛选阈值(|logFC|>1, p<0.05);GeneCards GIFtS阈值(≥30);STRING置信度(≥0.9) 阅读提示:见2.8-2.11节和Figure 4 |