队列建立与分组
识别ICU患者,并按照SOT状态和脓毒症状态分组。
从威尔康奈尔高级研究重症监护数据库中,纳入2006-2019年首次入住内科或外科ICU(排除心胸外科ICU)的成人患者,共28 431人,分为四组:SOT伴脓毒症、SOT不伴脓毒症、非SOT伴脓毒症、非SOT不伴脓毒症。
Effect of Sepsis on Death as Modified by Solid Organ Transplantation
基于约3万ICU患者的回顾性队列,使用TMLE调整混杂,包含敏感性分析,但无实验性验证。
ICU患者队列 实体器官移植(SOT)患者 非SOT患者
脓毒症定义:Sepsis-3(SOFA≥2,感染怀疑) 主要结局:28天死亡率(从ICU入院起) 效应修饰:SOT状态 调整混杂:人口统计学、ICU位置、合并症、中性粒细胞减少、感染源、微生物学数据
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
识别ICU患者,并按照SOT状态和脓毒症状态分组。
从威尔康奈尔高级研究重症监护数据库中,纳入2006-2019年首次入住内科或外科ICU(排除心胸外科ICU)的成人患者,共28 431人,分为四组:SOT伴脓毒症、SOT不伴脓毒症、非SOT伴脓毒症、非SOT不伴脓毒症。
使用Sepsis-3标准定义脓毒症。
根据Sepsis-3标准,器官功能障碍定义为ICU入院第1天SOFA评分≥2,感染怀疑定义为在ICU入院前后±7天内,抗生素和血培养在72小时内同时进行。
确定患者是否有实体器官移植史。
使用ICD9/ICD10诊断和手术代码识别肾、肝、胰、心、肺、心-肺、肠和多器官移植。
评估28天死亡率。
计算28天死亡率,从ICU入院时间开始,考虑了删失(如出院)和潜在混杂因素。
估计脓毒症对死亡的影响,并检验SOT的效应修饰。
使用靶向最小损失估计(TMLE)结合超级学习器估计脓毒症归因的28天死亡率差异,并检验SOT分组间的差异。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 统计分析 | R软件 4.0.3版 | -- | -- |
| gtsummary | -- | -- | |
| ggplot2 | -- | -- | |
| survminer | -- | -- | |
| lmtp | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 队列选择 | 数据来源:Weill Cornell-Critical Care Database for Advanced Research;纳入2006-2019年首次入住内科或外科ICU的成人患者,排除心胸外科ICU。 阅读提示:Methods: Data Source and Cohort Selection |
| 脓毒症定义 | Sepsis-3标准:SOFA评分≥2,抗生素和血培养在ICU入院前后7天内同时进行(±7天)且两者相隔≤72小时。 阅读提示:Methods: Definitions |
| SOT状态确定 | 通过ICD9/ICD10诊断和手术代码定义SOT,包括肾、肝、胰、心、肺、心-肺、肠和多器官移植。 阅读提示:Methods: Definitions |
| 结局评估 | 主要结局为28天死亡率,从ICU入院开始计算。 阅读提示:Methods: Statistical Analysis |
| 统计分析 | 使用TMLE,调整人口统计学、ICU位置、合并症、中性粒细胞减少、感染源和微生物学数据等混杂因素。 阅读提示:Methods: Statistical Analysis, Estimation Method |