单剂量的自转录和复制RNA SARS-CoV-2疫苗在小鼠中产生保护性适应性免疫

A single dose of self-transcribing and replicating RNA-based SARS-CoV-2 vaccine produces protective adaptive immunity in mice

作者信息Ruklanthi de Alwis, Esther S Gan, Shiwei Chen, Yan Shan Leong, Hwee Cheng Tan, Summer L Zhang, Clement Yau, Jenny G H Low, Shirin Kalimuddin, Daiki Matsuda, Elizabeth C Allen, Paula Hartman, Kyoung-Joo Jenny Park, Maher Alayyoubi, Hari Bhaskaran, Adrian Dukanovic, Yanjie Bao, Brenda Clemente, Jerel Vega, Scott Roberts, Jose A Gonzalez, Marciano Sablad, Rodrigo Yelin, Wendy Taylor, Kiyoshi Tachikawa, Suezanne Parker, Priya Karmali, Jared Davis, Brian M Sullivan, Sean M Sullivan, Steve G Hughes, Pad Chivukula, Eng Eong Ooi
PMID33823303
期刊Mol Ther
发布时间2021-06
DOI10.1016/j.ymthe.2021.04.001

实验完整度

高

包含体外表达验证、小鼠免疫原性评估(体液和细胞免疫)、转录组分析、攻毒保护实验及细胞耗竭机制验证,多个独立证据层级。

主要模型

BALB/c小鼠 C57BL/6小鼠 K18-hACE2转基因小鼠 Hep3b细胞

重点核对

LUNAR-COV19剂量:0.2、2、10 μg 免疫途径:肌内注射 攻毒剂量:5 × 10^4 TCID50,攻毒途径:鼻内 抗体检测时间点:第30、60天 细胞耗竭实验:抗CD20和抗CD8抗体处理

摘要

已开发出一种基于自转录和复制RNA(STARR)的疫苗(LUNAR-COV19)来预防SARS-CoV-2感染。该疫苗编码基于甲病毒属的复制子和SARS-CoV-2全长刺突糖蛋白。复制子的翻译产生复制酶复合物,该复合物扩增并延长SARS-CoV-2刺突糖蛋白的表达。小鼠中单次初免疫苗接种诱导了强大的抗体反应,其中和抗体滴度持续增加至第60天。细胞介导免疫的激活产生了强烈的病毒抗原特异性CD8+ T淋巴细胞反应。通过细胞内细胞因子染色检测干扰素(IFN)γ和白细胞介素-4(IL-4)阳性的CD4+ T辅助(Th)淋巴细胞以及抗刺突糖蛋白免疫球蛋白G(IgG)2a/IgG1比值,支持了强烈的Th1型优势免疫反应。最后,在2 μg和10 μg剂量下单次LUNAR-COV19疫苗接种完全保护了人ACE2转基因小鼠免受野生型SARS-CoV-2攻击后的死亡甚至可测量感染。我们的研究结果共同表明LUNAR-COV19作为单剂量疫苗的潜力。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
自转录和复制RNA疫苗(LUNAR-COV19)能否通过单次低剂量接种诱导保护性适应性免疫以预防SARS-CoV-2感染?
核心机制
LUNAR-COV19通过VEEV复制酶复合物增强并延长刺突蛋白表达,并通过形成双链RNA复制中间体激活天然免疫(I型干扰素),进而诱导强Th1型适应性免疫,包括抗体和CD8+ T细胞反应。
主要证据
小鼠免疫后检测到高水平中和抗体、IgG2a/IgG1比值显示的Th1偏向、IFNγ+ CD8+ T细胞反应,以及攻毒实验显示完全保护并伴有病毒载量显著降低。
研究意义
该研究提示STARR平台可作为单剂量COVID-19疫苗的有效策略,可能减少剂量和接种次数,有利于全球大规模免疫。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

疫苗设计和体外表达验证

验证LUNAR-COV19能否在体外表达SARS-CoV-2刺突蛋白。

将编码全长刺突蛋白和VEEV复制酶的STARR RNA以及仅编码刺突蛋白的常规mRNA转染Hep3b细胞,通过Western blot检测刺突蛋白表达。

2

体内蛋白表达和免疫基因分析

评估STARR RNA在体内是否延长抗原表达并诱导天然免疫相关基因表达。

将表达荧光素酶的STARR RNA或常规mRNA肌内注射BALB/c小鼠,测量生物发光信号;C57BL/6小鼠注射LUNAR-COV19或对照后,分析全血和淋巴结中免疫基因表达。

3

T细胞反应评估

检测LUNAR-COV19是否诱导SARS-CoV-2特异性T细胞反应。

C57BL/6小鼠免疫后第7天取脾细胞,通过流式细胞术分析CD8和CD4 T细胞亚群及IFNγ和IL-4染色,并用ELISpot检测刺突肽池刺激的IFNγ产生。

4

体液免疫评估

评估LUNAR-COV19诱导的抗体反应及其中和能力。

在BALB/c和C57BL/6小鼠中测定不同时间点的IgM和IgG滴度,并在第30天测IgG亚类、亲和力及对活病毒的中和抗体滴度(PRNT50/70)。

5

攻毒保护实验

验证单次LUNAR-COV19免疫是否保护hACE2转基因小鼠免受致命SARS-CoV-2感染。

hACE2转基因小鼠免疫2或10 μg疫苗,30天后鼻内攻击5×10^4 TCID50野生型SARS-CoV-2,监测体重、临床评分和存活率,并在第5天检测肺和脑中的病毒载量。

6

B细胞和CD8+ T细胞耗竭实验

确定疫苗保护作用中B细胞和CD8+ T细胞的贡献。

在hACE2转基因小鼠中,用抗CD20抗体耗竭B细胞或在攻毒前用抗CD8抗体耗竭CD8+ T细胞,然后免疫疫苗并攻毒,检测病毒RNA。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
T7 RNA聚合酶----
硅胶柱(Macherey-Nagel)Macherey-Nagel--
片段分析仪(Advanced Analytical)Advanced Analytical--
二硬脂酰磷脂酰胆碱----
胆固醇----
PEG2000-DMG----
ZEN3600粒度仪(Malvern Instruments)Malvern Instruments--
RiboGreen RNA试剂----
Lipofectamine MessengerMax转染试剂Thermo Fisher Scientific--
PNGase FNew England Biolabs--
兔抗S1抗体Sino Biological40150-T62-COV2
鼠抗S2抗体GeneTexGTX632604
山羊抗兔800LI-COR--
山羊抗鼠680LI-COR--
Hep3b细胞----
BALB/c小鼠Jackson Laboratory--
C57BL/6J小鼠inVivos--
K18-hACE2转基因小鼠Jackson Laboratory--
抗CD20抗体BioLegendSA271G2
抗CD8抗体Bio X CellBE0061
同型IgG2b对照抗体Bio X CellBE0090
B220抗体(RA3-6B2)BD--
CD3抗体(17A2)BD--
CD4抗体(RM4-5)BD--
CD8α抗体(53-6.7)BD--
CD44抗体(IM7)BD--
CD62L抗体(MEL-14)BD--
DAPI----
佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯--16561-29-8
离子霉素--56092-82-1
GolgiPlugBD--
IFNγ抗体(XMG1.2)BD--
IL-4抗体(11B11)BD--
小鼠IFN-γ ELISpotBASIC试剂盒Mabtech--
PVDF包被的96孔板----
MAGPIX Luminex微球Luminex--
ABC偶联试剂盒Thermo--
抗鼠IgM-生物素SouthernBiotech--
抗鼠IgG-生物素SouthernBiotech--
链霉亲和素-PESouthernBiotech--
抗6xHIS-PE抗体----
昆虫细胞来源的HIS标签SARS-CoV-2全刺突蛋白Sino Biological--
TRIzol LSInvitrogen--
NanoString nCounter小鼠炎症和免疫学v2检测组合NanoString Technologies--
QIAGEN RNAeasy试剂盒QIAGEN--
BD LSRFortessa流式细胞仪BD--
ImmunoSpot分析仪Cellular Technology Limited--
Prism v.8.1.0GraphPad Software--
Partek Genomics SuitePartek--
FlowJo软件----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
疫苗免疫
免疫剂量:0.2, 2, 10 μg;免疫途径:肌内注射;小鼠品系:BALB/c, C57BL/6
阅读提示:Materials and methods, Animal studies
抗体检测
采血时间点:基线,第10, 19, 30, 40, 50, 60天(BALB/c),第10, 20, 30天(C57BL/6);血清稀释度:1:2000;检测方法:Luminex免疫分析
阅读提示:Materials and methods, Luminex immuno-assay
中和抗体检测
病毒株:临床分离株BetaCoV/Singapore/2/2020;血清稀释范围:1:20-1:320;中和终点:PRNT50和PRNT70
阅读提示:Materials and methods, PRNT
T细胞检测
脾细胞获取时间:免疫后第7天;刺激条件:PMA (50 ng/mL)和离子霉素 (500 ng/mL)刺激6小时;流式抗体组合
阅读提示:Materials and methods, T cell assessment
ELISpot
脾细胞数量:4×10^5/孔;肽池:4个池,每肽1 μg/mL;孵育时间:过夜
阅读提示:Materials and methods, ELISpot
攻毒实验
攻毒剂量:5×10^4 TCID50;攻毒途径:鼻内;攻毒时间:免疫后30天;观察指标:体重、临床评分、存活率、病毒载量(第5天)
阅读提示:Materials and methods, SARS-CoV-2 challenge studies
细胞耗竭实验
B细胞耗竭:抗CD20抗体 (50 μg) 在免疫前第-3和-1天腹腔注射;CD8+ T细胞耗竭:抗CD8抗体 (5 μg) 在攻毒前第-3和-1天腹腔注射;确认耗竭:流式细胞术
阅读提示:Materials and methods, B cell and CD8+ T cell depletion studies