疫苗设计和体外表达验证
验证LUNAR-COV19能否在体外表达SARS-CoV-2刺突蛋白。
将编码全长刺突蛋白和VEEV复制酶的STARR RNA以及仅编码刺突蛋白的常规mRNA转染Hep3b细胞,通过Western blot检测刺突蛋白表达。
A single dose of self-transcribing and replicating RNA-based SARS-CoV-2 vaccine produces protective adaptive immunity in mice
包含体外表达验证、小鼠免疫原性评估(体液和细胞免疫)、转录组分析、攻毒保护实验及细胞耗竭机制验证,多个独立证据层级。
BALB/c小鼠 C57BL/6小鼠 K18-hACE2转基因小鼠 Hep3b细胞
LUNAR-COV19剂量:0.2、2、10 μg 免疫途径:肌内注射 攻毒剂量:5 × 10^4 TCID50,攻毒途径:鼻内 抗体检测时间点:第30、60天 细胞耗竭实验:抗CD20和抗CD8抗体处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证LUNAR-COV19能否在体外表达SARS-CoV-2刺突蛋白。
将编码全长刺突蛋白和VEEV复制酶的STARR RNA以及仅编码刺突蛋白的常规mRNA转染Hep3b细胞,通过Western blot检测刺突蛋白表达。
评估STARR RNA在体内是否延长抗原表达并诱导天然免疫相关基因表达。
将表达荧光素酶的STARR RNA或常规mRNA肌内注射BALB/c小鼠,测量生物发光信号;C57BL/6小鼠注射LUNAR-COV19或对照后,分析全血和淋巴结中免疫基因表达。
检测LUNAR-COV19是否诱导SARS-CoV-2特异性T细胞反应。
C57BL/6小鼠免疫后第7天取脾细胞,通过流式细胞术分析CD8和CD4 T细胞亚群及IFNγ和IL-4染色,并用ELISpot检测刺突肽池刺激的IFNγ产生。
评估LUNAR-COV19诱导的抗体反应及其中和能力。
在BALB/c和C57BL/6小鼠中测定不同时间点的IgM和IgG滴度,并在第30天测IgG亚类、亲和力及对活病毒的中和抗体滴度(PRNT50/70)。
验证单次LUNAR-COV19免疫是否保护hACE2转基因小鼠免受致命SARS-CoV-2感染。
hACE2转基因小鼠免疫2或10 μg疫苗,30天后鼻内攻击5×10^4 TCID50野生型SARS-CoV-2,监测体重、临床评分和存活率,并在第5天检测肺和脑中的病毒载量。
确定疫苗保护作用中B细胞和CD8+ T细胞的贡献。
在hACE2转基因小鼠中,用抗CD20抗体耗竭B细胞或在攻毒前用抗CD8抗体耗竭CD8+ T细胞,然后免疫疫苗并攻毒,检测病毒RNA。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 疫苗构建 | T7 RNA聚合酶 | -- | -- |
| RNA纯化 | 硅胶柱(Macherey-Nagel) | Macherey-Nagel | -- |
| RNA质量分析 | 片段分析仪(Advanced Analytical) | Advanced Analytical | -- |
| LNP制备 | 二硬脂酰磷脂酰胆碱 | -- | -- |
| 胆固醇 | -- | -- | |
| PEG2000-DMG | -- | -- | |
| LNP表征 | ZEN3600粒度仪(Malvern Instruments) | Malvern Instruments | -- |
| RiboGreen RNA试剂 | -- | -- | |
| 体外转染 | Lipofectamine MessengerMax转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 蛋白质印迹 | PNGase F | New England Biolabs | -- |
| 兔抗S1抗体 | Sino Biological | 40150-T62-COV2 | |
| 鼠抗S2抗体 | GeneTex | GTX632604 | |
| 山羊抗兔800 | LI-COR | -- | |
| 山羊抗鼠680 | LI-COR | -- | |
| 细胞培养 | Hep3b细胞 | -- | -- |
| 动物实验 | BALB/c小鼠 | Jackson Laboratory | -- |
| C57BL/6J小鼠 | inVivos | -- | |
| K18-hACE2转基因小鼠 | Jackson Laboratory | -- | |
| 细胞耗竭 | 抗CD20抗体 | BioLegend | SA271G2 |
| 抗CD8抗体 | Bio X Cell | BE0061 | |
| 同型IgG2b对照抗体 | Bio X Cell | BE0090 | |
| 流式细胞术 | B220抗体(RA3-6B2) | BD | -- |
| CD3抗体(17A2) | BD | -- | |
| CD4抗体(RM4-5) | BD | -- | |
| CD8α抗体(53-6.7) | BD | -- | |
| CD44抗体(IM7) | BD | -- | |
| CD62L抗体(MEL-14) | BD | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | -- | 16561-29-8 | |
| 离子霉素 | -- | 56092-82-1 | |
| GolgiPlug | BD | -- | |
| IFNγ抗体(XMG1.2) | BD | -- | |
| IL-4抗体(11B11) | BD | -- | |
| ELISpot | 小鼠IFN-γ ELISpotBASIC试剂盒 | Mabtech | -- |
| PVDF包被的96孔板 | -- | -- | |
| Luminex免疫分析 | MAGPIX Luminex微球 | Luminex | -- |
| ABC偶联试剂盒 | Thermo | -- | |
| 抗鼠IgM-生物素 | SouthernBiotech | -- | |
| 抗鼠IgG-生物素 | SouthernBiotech | -- | |
| 链霉亲和素-PE | SouthernBiotech | -- | |
| 抗6xHIS-PE抗体 | -- | -- | |
| 昆虫细胞来源的HIS标签SARS-CoV-2全刺突蛋白 | Sino Biological | -- | |
| GFP | TRIzol LS | Invitrogen | -- |
| 基因表达分析 | NanoString nCounter小鼠炎症和免疫学v2检测组合 | NanoString Technologies | -- |
| QIAGEN RNAeasy试剂盒 | QIAGEN | -- | |
| 流式细胞术 | BD LSRFortessa流式细胞仪 | BD | -- |
| ELISpot | ImmunoSpot分析仪 | Cellular Technology Limited | -- |
| 数据分析 | Prism v.8.1.0 | GraphPad Software | -- |
| Partek Genomics Suite | Partek | -- | |
| FlowJo软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 疫苗免疫 | 免疫剂量:0.2, 2, 10 μg;免疫途径:肌内注射;小鼠品系:BALB/c, C57BL/6 阅读提示:Materials and methods, Animal studies |
| 抗体检测 | 采血时间点:基线,第10, 19, 30, 40, 50, 60天(BALB/c),第10, 20, 30天(C57BL/6);血清稀释度:1:2000;检测方法:Luminex免疫分析 阅读提示:Materials and methods, Luminex immuno-assay |
| 中和抗体检测 | 病毒株:临床分离株BetaCoV/Singapore/2/2020;血清稀释范围:1:20-1:320;中和终点:PRNT50和PRNT70 阅读提示:Materials and methods, PRNT |
| T细胞检测 | 脾细胞获取时间:免疫后第7天;刺激条件:PMA (50 ng/mL)和离子霉素 (500 ng/mL)刺激6小时;流式抗体组合 阅读提示:Materials and methods, T cell assessment |
| ELISpot | 脾细胞数量:4×10^5/孔;肽池:4个池,每肽1 μg/mL;孵育时间:过夜 阅读提示:Materials and methods, ELISpot |
| 攻毒实验 | 攻毒剂量:5×10^4 TCID50;攻毒途径:鼻内;攻毒时间:免疫后30天;观察指标:体重、临床评分、存活率、病毒载量(第5天) 阅读提示:Materials and methods, SARS-CoV-2 challenge studies |
| 细胞耗竭实验 | B细胞耗竭:抗CD20抗体 (50 μg) 在免疫前第-3和-1天腹腔注射;CD8+ T细胞耗竭:抗CD8抗体 (5 μg) 在攻毒前第-3和-1天腹腔注射;确认耗竭:流式细胞术 阅读提示:Materials and methods, B cell and CD8+ T cell depletion studies |