患者招募与样本采集
评估微活检和常规皮肤切口采样在CL疑似患者中的诊断性能。
纳入29名年满18岁、未接受CL治疗、无内脏利什曼病和结核病合并症的CL疑似患者。在皮损处涂抹EMLA乳膏30-60分钟,酒精清洁后,使用微活检原型设备采集样本;随后在微活检部位附近采集常规皮肤切口样本,涂片并进行吉姆萨染色用于显微镜检查。记录两种采样方法的自我报告疼痛评分。
Minimally Invasive Microbiopsies as an Improved Sampling Method for the Diagnosis of Cutaneous Leishmaniasis
研究包含临床样本采集、PCR检测及统计分析,但缺乏功能验证或机制验证,属于临床验证性研究。
皮肤利什曼病患者的皮损样本
采样方法:微活检与常规皮肤切口样本对比 PCR检测:靶向kDNA基因,检测任何信号<50个循环且有2次独立运行阳性为阳性,仅1次运行阳性为弱阳性 疼痛评分:自报疼痛评分(0-10分) 样本量:29名疑似皮肤利什曼病患者
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估微活检和常规皮肤切口采样在CL疑似患者中的诊断性能。
纳入29名年满18岁、未接受CL治疗、无内脏利什曼病和结核病合并症的CL疑似患者。在皮损处涂抹EMLA乳膏30-60分钟,酒精清洁后,使用微活检原型设备采集样本;随后在微活检部位附近采集常规皮肤切口样本,涂片并进行吉姆萨染色用于显微镜检查。记录两种采样方法的自我报告疼痛评分。
从两种采样方法中提取DNA并通过PCR检测利什曼原虫DNA。
从冷冻的微活检样本和常温保存的皮肤切口玻片中,使用LEV血液DNA提取试剂盒和Maxwell 16自动化设备提取DNA。加入裂解缓冲液和蛋白酶K后,在56°C、400rpm孵育20分钟,然后按照制造商说明上机提取纯化。通过实时PCR检测kDNA基因,在QuantStudio 5循环仪上进行。阳性结果以循环阈值(Ct)表示,定义为在2个独立运行中检测到信号(任何信号<50个循环),仅1次运行阳性则判为弱阳性。
比较微活检与皮肤切口样本在PCR检测阳性率、Ct值及疼痛评分上的差异。
使用R 3.6.1和GraphPad Prism 8.0进行统计分析。采用Wilcoxon符号秩检验比较微活检和皮肤切口的Ct值和疼痛评分;计算两种方法的Ct值Spearman相关系数;并比较不同临床类型间Ct值(Kruskal-Wallis检验)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 样本采集 | 微活检装置 | Trajan Scientific and Medical | -- |
| 局部麻醉 | EMLA乳膏(5%利多卡因/丙胺卡因) | -- | -- |
| DNA提取 | LEV血液DNA提取试剂盒 | Promega | -- |
| DNA提取自动化 | Maxwell 16 | Promega | -- |
| 实时PCR | QuantStudio 5循环仪 | Applied Biosystems | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本采集 | 采样人群纳入标准(年龄>18岁、未接受CL治疗、无内脏利什曼病和结核病合并症);微活检装置类型(Trajan Scientific and Medical);EMLA乳膏型号和涂抹时间(30-60分钟);微活检采集深度(350µm);皮肤切口采样方法 阅读提示:Methods 部分 |
| DNA提取 | DNA提取试剂盒(LEV blood DNA extraction kit,Promega);自动化设备(Maxwell 16);裂解缓冲液和蛋白酶K孵育条件(56°C、400rpm、20分钟) 阅读提示:Methods 部分 |
| PCR检测 | PCR靶点(kDNA基因);循环仪型号(QuantStudio 5,Applied Biosystems);阳性判定标准(2次运行检测到信号<50循环,或1次弱阳性);阴性和阳性对照 阅读提示:Methods 部分 |
| 统计分析 | 统计方法和软件(R 3.6.1,GraphPad Prism 8.0);Wilcoxon符号秩检验、Spearman相关系数、Kruskal-Wallis检验的具体应用 阅读提示:Methods 部分 |