微创微活检作为皮肤利什曼病诊断的改进采样方法

Minimally Invasive Microbiopsies as an Improved Sampling Method for the Diagnosis of Cutaneous Leishmaniasis

作者信息Gemechu Churiso, Saskia van Henten, Lieselotte Cnops, Julia Pollmann, Roma Melkamu, Mulualem Lemma, Amare Kiflie, Helina Fikre, Johan van Griensven, Wim Adriaensen
PMID32939358
发布时间2020-08-17
DOI10.1093/ofid/ofaa364

实验完整度

中

研究包含临床样本采集、PCR检测及统计分析,但缺乏功能验证或机制验证,属于临床验证性研究。

主要模型

皮肤利什曼病患者的皮损样本

重点核对

采样方法:微活检与常规皮肤切口样本对比 PCR检测:靶向kDNA基因,检测任何信号<50个循环且有2次独立运行阳性为阳性,仅1次运行阳性为弱阳性 疼痛评分:自报疼痛评分(0-10分) 样本量:29名疑似皮肤利什曼病患者

摘要

目前用于诊断皮肤利什曼病的采样方法具有侵入性且疼痛。在埃塞俄比亚的各种皮肤利什曼病皮损中评估了一种替代性的微创微活检装置。基于聚合酶链反应的诊断,微活检优于常规皮肤切口样本,检测到更多患者,同时疼痛评分显著更低。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
微创微活检能否作为皮肤利什曼病诊断的替代采样方法,结合分子检测用于多种皮损类型?
核心机制
文中未明确说明
主要证据
在29名临床疑似CL患者中,微活检PCR检测出全部29例(100%)阳性,而皮肤切口PCR检测出26例(89.7%)阳性,皮肤切口显微镜检查仅17例(58.6%)阳性;微活检采样疼痛评分显著低于皮肤切口采样。
研究意义
微活检有望成为更患者友好的CL诊断采样方法,适用于分子检测,并可用于临床试验和纵向研究中频繁采样。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

患者招募与样本采集

评估微活检和常规皮肤切口采样在CL疑似患者中的诊断性能。

纳入29名年满18岁、未接受CL治疗、无内脏利什曼病和结核病合并症的CL疑似患者。在皮损处涂抹EMLA乳膏30-60分钟,酒精清洁后,使用微活检原型设备采集样本;随后在微活检部位附近采集常规皮肤切口样本,涂片并进行吉姆萨染色用于显微镜检查。记录两种采样方法的自我报告疼痛评分。

2

DNA提取和PCR检测

从两种采样方法中提取DNA并通过PCR检测利什曼原虫DNA。

从冷冻的微活检样本和常温保存的皮肤切口玻片中,使用LEV血液DNA提取试剂盒和Maxwell 16自动化设备提取DNA。加入裂解缓冲液和蛋白酶K后,在56°C、400rpm孵育20分钟,然后按照制造商说明上机提取纯化。通过实时PCR检测kDNA基因,在QuantStudio 5循环仪上进行。阳性结果以循环阈值(Ct)表示,定义为在2个独立运行中检测到信号(任何信号<50个循环),仅1次运行阳性则判为弱阳性。

3

数据分析与性能比较

比较微活检与皮肤切口样本在PCR检测阳性率、Ct值及疼痛评分上的差异。

使用R 3.6.1和GraphPad Prism 8.0进行统计分析。采用Wilcoxon符号秩检验比较微活检和皮肤切口的Ct值和疼痛评分;计算两种方法的Ct值Spearman相关系数;并比较不同临床类型间Ct值(Kruskal-Wallis检验)。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
微活检装置Trajan Scientific and Medical--
EMLA乳膏(5%利多卡因/丙胺卡因)----
LEV血液DNA提取试剂盒Promega--
Maxwell 16Promega--
QuantStudio 5循环仪Applied Biosystems--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
样本采集
采样人群纳入标准(年龄>18岁、未接受CL治疗、无内脏利什曼病和结核病合并症);微活检装置类型(Trajan Scientific and Medical);EMLA乳膏型号和涂抹时间(30-60分钟);微活检采集深度(350µm);皮肤切口采样方法
阅读提示:Methods 部分
DNA提取
DNA提取试剂盒(LEV blood DNA extraction kit,Promega);自动化设备(Maxwell 16);裂解缓冲液和蛋白酶K孵育条件(56°C、400rpm、20分钟)
阅读提示:Methods 部分
PCR检测
PCR靶点(kDNA基因);循环仪型号(QuantStudio 5,Applied Biosystems);阳性判定标准(2次运行检测到信号<50循环,或1次弱阳性);阴性和阳性对照
阅读提示:Methods 部分
统计分析
统计方法和软件(R 3.6.1,GraphPad Prism 8.0);Wilcoxon符号秩检验、Spearman相关系数、Kruskal-Wallis检验的具体应用
阅读提示:Methods 部分