COVID-19期间常见呼吸道病毒感染的骤降

Precipitous Fall in Common Respiratory Viral Infections During COVID-19

作者信息Michael F Parry, Asha K Shah, Merima Sestovic, Selma Salter
PMID33269297
发布时间2020-10-23
DOI10.1093/ofid/ofaa511

实验完整度

低

本研究为回顾性观察性分析,基于单中心临床检测数据,未包含功能或机制验证实验。

主要模型

Stamford Hospital社区患者队列

重点核对

比较期间:2020年CDC第14-29周 vs 2016-2019年同期 检测方法:GeneXpert Flu/RSV PCR和Biofire Multiplex Respiratory PCR Panel 样本采集:2016-2019年双鼻咽和咽喉拭子,2020年单鼻咽拭子 统计方法:卡方检验和Fisher精确检验

摘要

在2019冠状病毒病(COVID-19)大流行期间,我们惊讶地发现所有其他呼吸道病毒感染急剧下降。2020年我们COVID-19活动高峰的16周期间(美国疾病控制与预防中心第14-29周)呼吸道病毒感染数与过去4年同期相比显著降低(总共4例感染 vs 平均138例感染;P < .0001)。我们将此归因于广泛采用的公共卫生干预措施,包括戴口罩、社交距离、手卫生和居家令。由于这些干预措施在大多数流感季节通常被社区忽视,我们预计在即将到来的冬季继续使用这些措施可能会大幅减少流感和其他呼吸道病毒感染的病例数。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
COVID-19大流行期间实施的公共卫生干预措施是否减少了其他呼吸道病毒感染的发生。
核心机制
戴口罩、社交距离、手卫生和居家令等非药物干预措施减少了呼吸道病毒的传播。
主要证据
2020年COVID-19活动高峰期间,流感和其他呼吸道病毒感染病例数显著低于2016-2019年同期(4例 vs 平均138例,P < .0001),Biofire阳性率从38.9%降至1.4%。
研究意义
持续采用这些公共卫生措施可能减轻即将到来的流感季节的负担,并有助于控制COVID-19疫情。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

数据收集与时间段划分

收集2016-2020年期间Stamford医院所有呼吸道病毒检测结果,并定义COVID-19活动高峰时期。

从医院微生物实验室获取2016-2020年期间流感、RSV和Biofire呼吸道病毒检测数据,按CDC周划分时间,将2016-2019年作为历史季节,2020年作为当前季节。

2

比较历史季节与2020年感染率

评估2020年COVID-19期间呼吸道病毒感染是否减少。

比较2016-2019年与2020年同期(CDC第14-29周)的流感、RSV和其他呼吸道病毒检测结果。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
GeneXpertCepheid--
Biofire----
病毒转运介质Bartels--
Abbott ID-NOWAbbott--
Cepheid GeneXpert PCRCepheid--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
数据收集
医院地点、测试平台、样本采集方法(双拭子vs单拭子)
阅读提示:Methods部分
统计比较
时间段定义(CDC周)、历史季节定义、样本量
阅读提示:Methods和Results部分