验证VDAC1在IBD患者和DSS模型中的表达
确认VDAC1是否在IBD中异常表达
对来自健康、结肠炎、溃疡性结肠炎和克罗恩病患者结肠组织微阵列进行IHC染色,评估VDAC1表达;同时免疫组化检测DSS诱导小鼠结肠的VDAC1表达。
The role of the mitochondrial protein VDAC1 in inflammatory bowel disease: a potential therapeutic target
包含患者组织芯片、细胞实验(CT-26和Caco-2)、DSS和TNBS诱导的体内模型,并涉及功能验证(凋亡、炎症、mtDNA释放)和机制验证(VDAC1寡聚化、NLRP3炎症小体激活)。
DSS诱导的结肠炎小鼠模型 TNBS诱导的结肠炎小鼠模型 CT-26小鼠结肠癌细胞系 Caco-2人结肠癌细胞系
VDAC1在IBD患者和DSS小鼠结肠中的过表达水平(6-8倍) VBIT-12抑制DSS诱导的VDAC1寡聚化和凋亡(细胞模型) VBIT-12给药时间(D2或D5)对DSS结肠炎严重程度的影响 DSS诱导的炎症因子(TNF-α、IL-1β、IL-6)和MPO活性的变化 血清mtDNA水平的变化(DSS vs VBIT-12)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认VDAC1是否在IBD中异常表达
对来自健康、结肠炎、溃疡性结肠炎和克罗恩病患者结肠组织微阵列进行IHC染色,评估VDAC1表达;同时免疫组化检测DSS诱导小鼠结肠的VDAC1表达。
评估VBIT-12在细胞水平上对DSS诱导的VDAC1过表达、寡聚化及下游效应的抑制作用
CT-26和Caco-2细胞用DSS(1%-3%)处理48小时,有或无VBIT-12(10或20μM),检测VDAC1表达、寡聚化、凋亡、mtROS、Ca2+水平和mtDNA释放。
评估VBIT-12在DSS诱导的UC小鼠模型中的治疗效果
C57BL/6小鼠给予2%或2.5% DSS饮水5天,从D2或D5开始给予VBIT-12(20 mg/kg)至第14天,评估体重变化、DAI、结肠长度、脾脏重量、组织学损伤、炎症评分等。
阐明VBIT-12保护作用的分子机制,特别是对凋亡和炎症小体激活的抑制
通过TUNEL染色、免疫印迹检测凋亡相关蛋白(Bax、caspase-3等),免疫染色检测NLRP3、MAVS、caspase-1表达及活性,ELISA或qPCR检测炎症因子,qPCR检测血清mtDNA。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织微阵列 | 组织微阵列芯片 | Biomax US | CO245 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Biological Industries | -- |
| EMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 葡聚糖硫酸钠 | -- | -- |
| 药物处理 | VBIT-12 | -- | -- |
| VBIT-4 | -- | -- | |
| 细胞活性检测 | XTT试剂 | -- | -- |
| 凋亡检测 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| 线粒体ROS检测 | MitoSOX Red线粒体超氧化物指示剂 | Invitrogen | -- |
| 钙离子检测 | Fluo-4-AM钙离子荧光探针 | -- | -- |
| VDAC1寡聚化检测 | 乙二醇双(琥珀酰亚胺琥珀酸酯) | -- | -- |
| 免疫印迹 | 抗VDAC1抗体 | -- | -- |
| Caspase-1活性检测 | Caspase-1荧光测定试剂盒 | BioVision | -- |
| MPO活性检测 | 十六烷基三甲基溴化铵 | Sigma-Aldrich | -- |
| 免疫组化/免疫荧光 | DAPI染色液 | -- | -- |
| 特殊染色 | PAS染色 | -- | -- |
| 天狼星红染色 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 抗MUC2抗体 | -- | -- |
| 抗嗜铬粒蛋白A抗体 | -- | -- | |
| 抗α-SMA抗体 | -- | -- | |
| 抗波形蛋白抗体 | -- | -- | |
| 抗E-钙粘蛋白抗体 | -- | -- | |
| 抗Ki-67抗体 | -- | -- | |
| 抗TNF-α抗体 | -- | -- | |
| 抗NF-κB抗体 | -- | -- | |
| 抗磷酸化P65抗体 | -- | -- | |
| 抗iNOS抗体 | -- | -- | |
| 抗NLRP3抗体 | -- | -- | |
| 抗MAVS抗体 | -- | -- | |
| 抗caspase-1抗体 | -- | -- | |
| 抗HIF-1α抗体 | -- | -- | |
| 抗MIF抗体 | -- | -- | |
| 抗HK-I抗体 | -- | -- | |
| 抗细胞色素c抗体 | -- | -- | |
| 抗IP3R抗体 | -- | -- | |
| 抗ATP合酶5a抗体 | -- | -- | |
| 抗p53抗体 | -- | -- | |
| 抗Bax抗体 | -- | -- | |
| 抗caspase-3抗体 | -- | -- | |
| 抗caspase-8抗体 | -- | -- | |
| 抗Bcl-2抗体 | -- | -- | |
| 抗t-Bid抗体 | -- | -- | |
| 抗β-actin抗体 | -- | -- | |
| 荧光检测 | iCyt流式细胞仪 | SONY Biotechnology | ec800 |
| 免疫印迹成像 | FUSION-FX化学发光成像系统 | Vilber Lourmat | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| DSS诱导结肠炎模型 | 小鼠品系和性别(C57BL/6雌性,6-7周龄)、DSS浓度(2%或2.5%)、处理时间(5天)、VBIT-12剂量(20 mg/kg)和给药时间(D2或D5) 阅读提示:Materials and Methods: DSS-induced colitis in mice, Figure 2A |
| 细胞培养和DSS处理 | 细胞系(CT-26, Caco-2)、DSS浓度(1%-3%)、处理时间(48小时)、VBIT-12浓度(10或20 μM) 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture, DSS treatment |
| 凋亡检测 | TUNEL染色、caspase-3活性、cleaved caspase-3表达、凋亡相关蛋白(Bax, t-Bid, p53) 阅读提示:Results: DSS-induced colon cell apoptosis is reduced by VBIT-12, Figure 4 |
| 炎症评估 | 炎症因子(TNF-α, IL-1β, IL-6)、iNOS、MPO活性、NF-κB/p-P65表达 阅读提示:Results: VBIT-12 prevents DSS-induced inflammation, Figure 5 |
| NLRP3炎症小体激活 | NLRP3、MAVS、caspase-1表达和活性、血清mtDNA 阅读提示:Results: DSS-induced MAVS expression, inflammation, and serum mtDNA, Figure 6 |
| 代谢与信号通路 | HK-I、citrate synthase、ATP synthase 5a、P2X7受体、CA2+信号 阅读提示:Results: DSS-induced UC alterations in the expression of metabolism-related enzymes and P2X7 receptor, Figure 7 |