病例识别与数据收集
识别潜在的侵袭性霉菌感染病例并收集其医疗记录
在4家医疗中心,回顾了2016年9月1日至2018年8月31日期间,具有以下指标的患者的医疗记录:血清半乳甘露聚糖≥0.5 ng/mL或β-D-葡聚糖≥80 pg/mL、霉菌培养阳性、病理报告鉴定霉菌、使用抗霉菌抗真菌药物或ICD-10霉菌感染诊断代码。排除了双形真菌和毛发、指甲标本。
Invasive Mold Infections Following Hurricane Harvey-Houston, Texas
该研究为多中心回顾性观测性研究,基于病历审查和病例定义,缺乏干预性实验验证,但包含详细的病例分类、统计分析和敏感性分析。
4家休斯顿都市区医疗中心 侵袭性霉菌感染患者队列
病例定义:确诊、可能和监测IMI病例的定义标准 时间窗口:飓风前后各1年(2016年9月1日至2018年8月31日) 样本量:541例潜在IMI病例,537例有完整数据 统计方法:率比、中断时间序列、多变量逻辑回归
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
识别潜在的侵袭性霉菌感染病例并收集其医疗记录
在4家医疗中心,回顾了2016年9月1日至2018年8月31日期间,具有以下指标的患者的医疗记录:血清半乳甘露聚糖≥0.5 ng/mL或β-D-葡聚糖≥80 pg/mL、霉菌培养阳性、病理报告鉴定霉菌、使用抗霉菌抗真菌药物或ICD-10霉菌感染诊断代码。排除了双形真菌和毛发、指甲标本。
根据既定和新颖定义将潜在病例分类为确诊、可能、监测或非IMI病例
根据EORTC/MSG 2019版共识定义,将病例分为确诊、可能或监测IMI病例。确诊:从正常无菌部位培养出霉菌或组织病理学证据。可能:至少1个宿主因素、1个临床特征和真菌学证据。监测:接受抗霉菌治疗且至少1个宿主或临床因素。由2名传染病专科医生进行裁定,CDC处理分歧。
比较飓风前后IMI发病率,并分析IMI病例状态相关因素
使用率比(RR)比较飓风前后IMI发病率;使用中断时间序列(ITS)模型检查月度趋势变化,控制季节和自相关;使用单变量和多变量logistic回归分析患者特征与IMI病例状态的关联;进行敏感性分析(滞后1、2、3个月);使用χ2或Fisher精确检验比较比例。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 数据管理 | REDCap | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 研究设计和数据收集 | 医疗机构数量和类型、时间窗口(飓风前后各1年)、潜在病例的识别标准(半乳甘露聚糖阈值、β-D-葡聚糖阈值、培养、病理、抗真菌药物、ICD-10代码) 阅读提示:Methods-Study Population and Data Collection |
| 病例定义和裁定 | EORTC/MSG定义的应用(确诊、可能、监测)、裁定流程(双人审核、CDC处理分歧) 阅读提示:Methods-Case Definition and Adjudication,Supplementary Appendix Figure 1 |
| 统计分析 | 分母(医疗保健就诊次数)、率比计算、中断时间序列模型控制季节性和自相关、多变量logistic回归模型的具体变量、交互项探索、显著性水平 阅读提示:Methods-Data Analysis,Supplementary Appendix 6 |