临床队列建立与样本收集
收集SFTS住院患者临床数据及尿液、血浆样本,进行病毒载量检测和肾功能评估。
2021年5月至2022年9月期间,从南京医科大学第一附属医院纳入110例SFTS患者,排除8例未及时收集尿液者,最终102例患者纳入分析。采集入院时尿液和血浆样本,通过qRT-PCR定量病毒载量(U-SFTSV和P-SFTSV)。根据KDIGO标准评估肾功能,分为AKI组(n=28)和非AKI组(n=74)。
A High Viral Load in Urine Correlates With Acute Kidney Injury and Poor Outcomes in Hospitalized Patients With Severe Fever With Thrombocytopenia Syndrome: A Noninvasive and Convenient Prognostic Marker
包含临床队列分析(102例患者)、细胞感染实验(Vero E6细胞)和动物模型(IFNAR−/−小鼠)三个独立证据层级,并进行功能验证(病毒传染性)和机制验证(肾组织病理与免疫组化)。
IFNAR−/− C57BL/6小鼠模型 Vero E6细胞 SFTS住院患者队列
U-SFTSV载量(对数转换)与血浆SFTSV载量(r=0.624,P<.001)及肾损伤指标(sCr、BUN)的相关性 多因素Logistic回归中U-SFTSV的独立危险作用(OR=3.631, P=.019) U-SFTSV预测28天死亡风险的ROC曲线(AUC=0.881,cutoff=6379 copies/mL) 高U-SFTSV组(>6379 copies/mL)的Kaplan-Meier生存差异(log-rank P<.0001) 尿液病毒传染性实验(Vero E6细胞感染,Ct<35为阳性)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
收集SFTS住院患者临床数据及尿液、血浆样本,进行病毒载量检测和肾功能评估。
2021年5月至2022年9月期间,从南京医科大学第一附属医院纳入110例SFTS患者,排除8例未及时收集尿液者,最终102例患者纳入分析。采集入院时尿液和血浆样本,通过qRT-PCR定量病毒载量(U-SFTSV和P-SFTSV)。根据KDIGO标准评估肾功能,分为AKI组(n=28)和非AKI组(n=74)。
分析U-SFTSV与血浆病毒载量、疾病严重程度及肾损伤指标的相关性。
使用Spearman相关分析评估U-SFTSV与P-SFTSV以及各项临床实验室指标(如血细胞计数、肝酶、肾功能指标等)的相关性。
确定U-SFTSV是否为SFTS相关AKI的独立危险因素。
比较AKI组与非AKI组患者的临床特征和实验室指标,进行单因素Logistic回归分析,将P<.01的变量纳入多因素Logistic回归,确定独立危险因素。
评估U-SFTSV预测SFTS患者28天死亡结局的能力。
根据28天生存状态将患者分为存活组(n=87)和死亡组(n=15),比较两组特征。进行ROC分析确定U-SFTSV预测死亡的最佳截断值,并计算AUC。用Kaplan-Meier法比较截断值分组下的生存差异。
验证SFTSV在肾脏的复制和肾损伤的病理特征。
使用IFNAR−/− C57BL/6小鼠,分为模拟组和SFTSV感染组,皮下接种SFTSV(100μL,1.0×106 TCID50/mL)或DMEM。在感染后第5天收集肾组织,进行H&E染色和IHC检测SFTSV核蛋白(NP)。
检测SFTS患者尿液中的病毒是否具有感染性,探究尿液作为传播途径的可能性。
收集10份新鲜尿液样本,经0.22μm滤膜过滤并与DMEM按1:1稀释后,接种Vero E6细胞(1×105细胞/孔),培养5天后提取细胞RNA,通过qRT-PCR检测SFTSV核酸(Ct<35为阳性),判断病毒复制。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 样本采集 | 50毫升试管 | -- | -- |
| RNA提取 | 达安基因RNA提取试剂盒 | DAAN GENE | 广州,中国 |
| qRT-PCR | 特异性引物和探针 | -- | -- |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco Invitrogen | -- |
| 胎牛血清 | Gibco Invitrogen | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco Invitrogen | -- | |
| 磷酸盐缓冲液 | Gibco Invitrogen | -- | |
| 免疫组织化学 | SFTSV核蛋白单克隆抗体 | Cambridge Biologics | Boston, |
| 细胞感染实验 | Vero E6细胞 | ATCC | Manassas, |
| 实验耗材 | 0.22微米针头式过滤器 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者队列与样本收集 | 患者纳入标准:SFTS诊断标准(发热、血小板减少、SFTSV RNA阳性);排除标准:其他病原体感染、基础肾病或严重全身性疾病、未收集尿液;尿液和血浆样本均于入院时采集并用于qRT-PCR检测;肾功能评估采用KDIGO标准。 阅读提示:详见Methods部分'Patients'和'Urine Collection and SFTSV Detection' |
| qRT-PCR检测病毒载量 | RNA提取试剂盒(DAAN GENE);扩增循环参数:50°C 15min反转录,95°C 15min聚合酶激活,然后45个循环(94°C 15s变性,55°C 45s退火延伸);Ct值>35定义为阴性。 阅读提示:详见Methods部分'Urine Collection and SFTSV Detection' |
| 相关性分析与危险因素分析 | 样本量为102例;Spearman相关分析;单因素Logistic回归后纳入P<.01的变量进行多因素分析;U-SFTSV的OR=3.631(95%CI 1.239-10.640),P=.019。 阅读提示:详见Results部分'High Levels of SFTSV Loads in Urine in SFTS-Associated AKI'及Table 1 |
| 预后预测与生存分析 | ROC分析评价U-SFTSV预测28天死亡的AUC=0.881,截断值6379 copies/mL;Kaplan-Meier生存分析比较截断值分组的28天死亡率,log-rank P<.0001。 阅读提示:详见Results部分'Predictive Value of SFTSV Loads in Urine for the Prognosis of SFTS'及Figure 2 |
| 动物模型肾组织病理与免疫组化 | 小鼠品系为IFNAR−/− C57BL/6,6-8周龄;感染剂量为100μL 1.0×106 TCID50/mL SFTSV皮下接种;mock组接种DMEM;感染后5天收集肾组织;H&E染色观察肾小管损伤;IHC检测SFTSV NP。 阅读提示:详见Methods部分'Histopathology and Immunohistochemistry of Animal Kidney' |
| 尿液病毒传染性实验 | 收集10份尿液样本;Vero E6细胞(ATCC)以1×105细胞/孔接种6孔板;尿液经0.22μm滤膜过滤,与DMEM按1:1稀释后,取1mL进行10倍连续稀释并感染细胞2小时;培养5天后提取RNA,qRT-PCR检测SFTSV,Ct<35为阳性。 阅读提示:详见Methods部分'Urinary SFTSV Infectivity' |