患者识别和基因突变检测
筛选具有VIP-D和/或BRAF突变的神经母细胞瘤患者,进行基因测序确认突变。
通过MSKCC数据系统回顾1998-2020年神经母细胞瘤患者,筛选VIP-D或BRAF突变,并采用MSK-IMPACT或FoundationOne Liquid CDx进行肿瘤测序。
Association of BRAF V600E mutations with vasoactive intestinal peptide syndrome in MYCN-amplified neuroblastoma
基于两例病例报告和回顾性分析,包含基因组测序和临床观察,但缺乏前瞻性实验设计和功能验证。
高危神经母细胞瘤患者(病例1和2) 肿瘤组织样本(包括肾上腺、肝、脑、肺等转移灶)
BRAF V600E突变检测(MSK-IMPACT和FoundationOne Liquid CDx测序) 血清VIP水平监测(正常值<400 pg/mL) 腹泻症状评估(每日腹泻量) BRAF和MEK抑制剂治疗(达拉非尼和曲美替尼) 肿瘤克隆演变分析(全基因组测序)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选具有VIP-D和/或BRAF突变的神经母细胞瘤患者,进行基因测序确认突变。
通过MSKCC数据系统回顾1998-2020年神经母细胞瘤患者,筛选VIP-D或BRAF突变,并采用MSK-IMPACT或FoundationOne Liquid CDx进行肿瘤测序。
评估VIP-D的临床表现和血清VIP水平。
记录患者腹泻出现时间、每日腹泻量,并检测血清VIP水平(正常<400 pg/mL)。
评估BRAF抑制剂(达拉非尼)或联合MEK抑制剂(曲美替尼)对VIP-D的疗效。
病例1在检测到BRAF V600E后使用达拉非尼,VIP-D在72小时内缓解;复发起始重新用药并联合曲美替尼。病例2使用达拉非尼和曲美替尼,腹泻一周内缓解,VIP从1416降至209 pg/mL。
分析治疗过程中肿瘤的克隆演变和突变谱变化。
病例1进行连续全基因组测序(83-107X)显示分支进化,BRAF V600E仅存在于治疗后肾上腺肿瘤,而脑、肺、肝转移灶有不同ALK突变;病例2中BRAF V600E在治疗后淋巴结中存在,但肾上腺肿瘤中未检测到。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因突变检测 | MSK-IMPACT | Memorial Sloan Kettering Cancer Center | -- |
| FoundationOne Liquid CDx | Foundation Medicine | -- | |
| 治疗 | 达拉非尼 | -- | 1195765-45-7 |
| 曲美替尼 | -- | 871700-17-3 | |
| 奥曲肽 | -- | 83150-76-9 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者筛选和基因检测 | 神经母细胞瘤患者队列,VIP-D或BRAF突变,测序方法(MSK-IMPACT或FoundationOne Liquid CDx) 阅读提示:METHODS部分 |
| 症状评估 | 血清VIP水平正常值范围(<400 pg/mL),腹泻量记录 阅读提示:CASE REPORTS部分 |
| 治疗干预 | 药物剂量和治疗时间:文中未明确说明 阅读提示:CASE REPORTS部分 |
| 肿瘤演变分析 | 全基因组测序覆盖率(83-107X),样本类型和处理前后时间点 阅读提示:FIGURE LEGENDS |