美国儿童肺炎链球菌抗菌药物耐药性趋势:多中心评估

Trends in Streptococcus pneumoniae Antimicrobial Resistance in US Children: A Multicenter Evaluation

作者信息Salini Mohanty, Kristen Feemster, Kalvin C Yu, Janet A Watts, Vikas Gupta
PMID36968964
发布时间2023-03-07
DOI10.1093/ofid/ofad098

实验完整度

中

该研究为回顾性多中心监测研究,基于实验室药敏报告分析耐药趋势,未进行功能验证或机制研究,证据层级单一。

主要模型

儿童侵袭性肺炎链球菌分离株(血液、脑脊液/神经) 儿童非侵袭性肺炎链球菌分离株(呼吸道、耳鼻喉)

重点核对

年龄分组:<2岁、2-4岁、5-17岁 标本来源:侵袭性(血液、脑脊液/神经)与非侵袭性(呼吸道、耳鼻喉) 耐药定义:青霉素、大环内酯类、氟喹诺酮类、超广谱头孢菌素、四环素的中介或耐药 统计方法:广义估计方程、logistic回归,调整年龄、性别、环境、季节、医院特征和美国人口普查区域

摘要

背景:抗菌药物耐药性(AMR)对肺炎球菌疾病的治疗构成重大挑战。本研究评估了来自美国儿童的肺炎链球菌的AMR趋势。方法:我们评估了在BD Insights研究数据库(2011年1月至2020年2月)中219个美国医院住院/门诊环境中,来自儿童(<18岁)的侵袭性(血液或脑脊液/神经)或非侵袭性(呼吸道或耳/鼻/喉)标本的30天非重复肺炎链球菌分离株的抗生素耐药性,定义为设施抗菌药物药敏报告中的中介/耐药。我们使用描述性统计来表征抗菌药物耐药分离株的百分比,并使用广义估计方程来评估耐药性随时间的变化。结果:在分析的7605株肺炎链球菌分离株中,6641株(87.3%)来自非侵袭性来源。非侵袭性分离株的耐药率高于侵袭性分离株。分离株对≥1类药物(56.8%)、≥2类药物(30.7%)、大环内酯类(39.9%)和青霉素(39.6%)的耐药率较高,且对≥1类药物(+0.9%)、≥2类药物(+1.8%)和大环内酯类(+5.0%)的耐药率每年显著增加。结论:在过去十年中,美国儿童的肺炎链球菌分离株表现出持续高水平的抗生素耐药性,并且≥1类药物、≥2类药物和大环内酯类耐药率显著增加。解决肺炎链球菌AMR的努力可能需要针对耐药血清型的疫苗和抗菌药物管理措施。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
美国儿童肺炎链球菌分离株的抗菌药物耐药性趋势如何?
核心机制
非侵袭性分离株的耐药率高于侵袭性分离株;年龄、标本来源、医院规模和地区与耐药率相关;2011-2020年间,对大环内酯类、≥1类药物和≥2类药物耐药率显著增加,而青霉素耐药率下降。
主要证据
基于BD Insights研究数据库中219家医院、7605株儿童肺炎链球菌分离株的药敏报告,采用描述性统计和广义估计方程进行趋势分析。
研究意义
研究结果提示需要针对耐药血清型的疫苗(如PCV15、PCV20)和抗菌药物管理措施,以应对儿童肺炎链球菌耐药性的高发和上升趋势。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

收集和分类肺炎链球菌分离株

确定来自美国儿童侵袭性和非侵袭性肺炎链球菌感染标本的分离株。

从BD Insights研究数据库(2011年1月至2020年2月)中,收集来自儿童(<18岁)的30天内非重复S. pneumoniae分离株。根据来源分为侵袭性(血液、脑脊液/神经)和非侵袭性(呼吸道、耳鼻喉)感染。排除皮肤/伤口、尿液和其他非无菌来源,以及可能污染或定植的培养物。

2

评估抗菌药物耐药性

根据设施药敏报告评估肺炎链球菌分离株的耐药性。

基于设施的报告,评估对青霉素、大环内酯类、氟喹诺酮类、超广谱头孢菌素和四环素的耐药性(定义为中介或耐药)。计算总体、侵袭性和非侵袭性标本的耐药率,并按年份、性别、年龄组和医院特征进行分层。

3

分析耐药性随时间的变化

确定2011-2020年期间肺炎链球菌耐药性的年度趋势。

使用广义估计方程和logistic回归分析(一阶自回归方差-协方差矩阵)按季度评估耐药率的趋势。模型调整了年龄、性别、环境、季节、医院人口统计和美国人口普查区域。并分别对侵袭性和非侵袭性标本进行分层分析。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
BD Insights研究数据库Becton, Dickinson and Company--
R 4.0.3版----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
数据来源
医院数量:219家;数据时间范围:2011年1月-2020年2月;数据库:BD Insights研究数据库。
阅读提示:参见Methods部分:Study Design
样本纳入标准
年龄小于18岁;非重复:30天内非重复分离株;来源:侵袭性(血液、CSF/神经)和非侵袭性(呼吸道、ENT)。
阅读提示:参见Methods部分:Study Design
耐药性定义
中介或耐药;具体药物类别:青霉素、大环内酯类、氟喹诺酮类、ESC、四环素。
阅读提示:参见Methods部分:Study Design中的耐药性定义
统计分析
GEE模型、logistic回归;调整变量:年龄、性别、环境、季节、医院特征、美国人口普查区域。
阅读提示:参见Methods部分:Statistical Analysis