收集和分类肺炎链球菌分离株
确定来自美国儿童侵袭性和非侵袭性肺炎链球菌感染标本的分离株。
从BD Insights研究数据库(2011年1月至2020年2月)中,收集来自儿童(<18岁)的30天内非重复S. pneumoniae分离株。根据来源分为侵袭性(血液、脑脊液/神经)和非侵袭性(呼吸道、耳鼻喉)感染。排除皮肤/伤口、尿液和其他非无菌来源,以及可能污染或定植的培养物。
Trends in Streptococcus pneumoniae Antimicrobial Resistance in US Children: A Multicenter Evaluation
该研究为回顾性多中心监测研究,基于实验室药敏报告分析耐药趋势,未进行功能验证或机制研究,证据层级单一。
儿童侵袭性肺炎链球菌分离株(血液、脑脊液/神经) 儿童非侵袭性肺炎链球菌分离株(呼吸道、耳鼻喉)
年龄分组:<2岁、2-4岁、5-17岁 标本来源:侵袭性(血液、脑脊液/神经)与非侵袭性(呼吸道、耳鼻喉) 耐药定义:青霉素、大环内酯类、氟喹诺酮类、超广谱头孢菌素、四环素的中介或耐药 统计方法:广义估计方程、logistic回归,调整年龄、性别、环境、季节、医院特征和美国人口普查区域
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定来自美国儿童侵袭性和非侵袭性肺炎链球菌感染标本的分离株。
从BD Insights研究数据库(2011年1月至2020年2月)中,收集来自儿童(<18岁)的30天内非重复S. pneumoniae分离株。根据来源分为侵袭性(血液、脑脊液/神经)和非侵袭性(呼吸道、耳鼻喉)感染。排除皮肤/伤口、尿液和其他非无菌来源,以及可能污染或定植的培养物。
根据设施药敏报告评估肺炎链球菌分离株的耐药性。
基于设施的报告,评估对青霉素、大环内酯类、氟喹诺酮类、超广谱头孢菌素和四环素的耐药性(定义为中介或耐药)。计算总体、侵袭性和非侵袭性标本的耐药率,并按年份、性别、年龄组和医院特征进行分层。
确定2011-2020年期间肺炎链球菌耐药性的年度趋势。
使用广义估计方程和logistic回归分析(一阶自回归方差-协方差矩阵)按季度评估耐药率的趋势。模型调整了年龄、性别、环境、季节、医院人口统计和美国人口普查区域。并分别对侵袭性和非侵袭性标本进行分层分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 数据收集 | BD Insights研究数据库 | Becton, Dickinson and Company | -- |
| 数据分析 | R 4.0.3版 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 数据来源 | 医院数量:219家;数据时间范围:2011年1月-2020年2月;数据库:BD Insights研究数据库。 阅读提示:参见Methods部分:Study Design |
| 样本纳入标准 | 年龄小于18岁;非重复:30天内非重复分离株;来源:侵袭性(血液、CSF/神经)和非侵袭性(呼吸道、ENT)。 阅读提示:参见Methods部分:Study Design |
| 耐药性定义 | 中介或耐药;具体药物类别:青霉素、大环内酯类、氟喹诺酮类、ESC、四环素。 阅读提示:参见Methods部分:Study Design中的耐药性定义 |
| 统计分析 | GEE模型、logistic回归;调整变量:年龄、性别、环境、季节、医院特征、美国人口普查区域。 阅读提示:参见Methods部分:Statistical Analysis |