美国18个医疗保健系统研究地点的儿童耐碳青霉烯肠杆菌:一项前瞻性多中心队列研究的临床和分子流行病学

Carbapenem-resistant Enterobacterales in Children at 18 US Health Care System Study Sites: Clinical and Molecular Epidemiology From a Prospective Multicenter Cohort Study

作者信息Matthew Fisher, Lauren Komarow, Jordan Kahn, Gopi Patel, Sara Revolinski, W Charles Huskins, David van Duin, Ritu Banerjee, Bettina C Fries
PMID38390459
发布时间2024-01-08
DOI10.1093/ofid/ofad688

实验完整度

中

该研究为前瞻性观察性队列研究,包含51名儿科患者,采用PCR和全基因组测序进行分子检测,但缺乏干预性功能验证,主要基于观察性数据分析。

主要模型

51名儿科CRE患者队列 CRACKLE-1和CRACKLE-2队列

重点核对

CRE定义遵循CDC 2012和2015指南 碳青霉烯酶基因检测采用PCR和全基因组测序 碳青霉烯敏感性在中央实验室复核 患者年龄小于18岁,中位年龄8个月

摘要

背景:耐碳青霉烯肠杆菌(CRE)在美国是紧迫的公共卫生威胁。目的:描述多中心儿科队列中CRE的临床和分子流行病学。方法:CRACKLE-1和CRACKLE-2是前瞻性队列研究,于2011年12月24日至2017年8月31日期间连续纳入CRE感染或定植的住院患者。本分析纳入年龄小于18岁且入组CRACKLE研究的患者。临床数据来自电子健康记录。碳青霉烯酶基因通过聚合酶链反应和全基因组测序检测。结果:在代表美国所有人口普查区域的18个医疗保健系统研究地点共识别出51名儿童。中位年龄为8个月,67%小于2岁。从入院到培养采集的中位天数为11天。73%的患者需要重症监护,41%有机械通气史。超过一半的儿童没有记录在案的合并症(Q1,Q3 0,2)。67%在住院期间既往接受过抗生素治疗。最常见的分离菌种为肠杆菌属(41%)、肺炎克雷伯菌(27%)和大肠杆菌(20%)。在检测的分离株中,29%检出碳青霉烯酶基因,低于先前描述的该队列成人(61%)。34名患者在培养采集当天接受了经验性治疗,但只有6名接受了体外确认对CRE分离株敏感的抗生素。30天死亡率为13.7%。结论:美国儿童的CRE感染或定植在地理上分布广泛,主要影响2岁以下儿童,与显著死亡率相关,且由产碳青霉烯酶菌株引起的比例低于成人。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
美国儿童中CRE的临床和分子流行病学特征是什么?
核心机制
研究中未明确阐明具体机制,但指出与成人相比,儿童CRE中碳青霉烯酶基因检出率较低(29% vs 61%),且物种分布不同,肠杆菌属更常见。
主要证据
来自CRACKLE-1和CRACKLE-2队列的51名儿科患者,通过电子健康记录获取临床数据,采用PCR和全基因组测序检测碳青霉烯酶基因,发现30天死亡率为13.7%,且大多数死亡患者符合感染标准。
研究意义
研究表明儿科CRE感染在美国多地出现,主要影响2岁以下儿童,且死亡率显著,强调需要包含儿童的临床试验和抗生素管理,以减少抗菌素耐药性的传播。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

患者入组与数据收集

识别并纳入儿科CRE患者,收集临床数据

从CRACKLE-1和CRACKLE-2前瞻性队列中筛选年龄小于18岁的患者,从电子健康记录提取人口统计学、临床、微生物学、治疗和结局数据。

2

微生物学与分子分析

鉴定CRE菌种并检测碳青霉烯酶基因

在各参与实验室进行细菌鉴定和药敏测试,采用PCR检测碳青霉烯酶基因(CRACKLE-1)和全基因组测序(CRACKLE-2),并在中央实验室复核碳青霉烯敏感性。

3

临床结局评估

评估30天和90天全因死亡率

从电子健康记录和随访数据中确定死亡情况,计算死亡率和95%置信区间。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
MicroScan系统Beckman Coulter--
Vitek 2系统bioMérieux--
Etest法bioMérieux--
BD Phoenix系统Becton Dickinson--
BBL纸片Becton Dickinson--
Sensititre系统Thermo Fisher--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
患者入组
纳入标准:年龄≤18岁,CDC定义的CRE感染或定植;入组时间范围
阅读提示:Methods部分:Study Participants and Design
微生物检测
用于药敏测试的方法和仪器;碳青霉烯酶检测方法(PCR或全基因组测序);确认测试的中央实验室
阅读提示:Methods部分:Microbiologic and Molecular Analysis
临床结局评估
死亡率定义(30天和90天);统计方法(Clopper-Pearson精确区间)
阅读提示:Methods部分:Statistical Analysis