2020年加利福尼亚州圣克拉拉县一例近期印度旅行后因娱乐性水源暴露导致的原发性阿米巴脑膜脑炎死亡病例

Death From Primary Amebic Meningoencephalitis After Recreational Water Exposure During Recent Travel to India-Santa Clara County, California, 2020

作者信息Glenn R Harris, Ellora N Karmarkar, Rebecca Quenelle, Lyndsey Chaille, Jai Madhok, Vivian Tien, Jyoti Gupta, Seema Jain, Maria Liu, Shantanu Roy, Supriya Narasimhan, Akiko Kimura, Jennifer R Cope, Ibne Karim M Ali
PMID34395708
发布时间2021-07-27
DOI10.1093/ofid/ofab322

实验完整度

中

包含临床病例报告、流行病学调查与分子基因分型分析,但缺乏体外或动物模型等实验验证。

主要模型

患者脑脊液样本 福氏耐格里原虫临床分离株(MW033524) 北美参考菌株(15株, 来自美国及墨西哥)

重点核对

患者于2020年2月自印度返回,潜伏期内唯一鼻腔水暴露为印度度假租赁房屋室内泳池,但泳池水质与消毒情况不明 脑脊液检查提示中性粒细胞为主的白细胞增高、低葡萄糖、高蛋白,革兰染色与培养阴性,需手工镜检确认阿米巴滋养体 基因分型通过ITS1重复序列及5.8S rRNA基因第572位单核苷酸多态性鉴定为I型 比较重复性非多态性位点(n=24)时,患者株与15株北美参考株在5个位点存在差异 印度GenBank可用序列均为I型,但缺乏印度株的重复性非多态性位点比较数据

摘要

背景:2020年2月,一名男子在美国境外旅行11天后返回美国,因鼻腔接触在温水中发现的自生阿米巴原虫福氏耐格里原虫而死于原发性阿米巴脑膜脑炎。我们确定了潜在的暴露因素,确认了病因,并描述了感染的分子流行病学。方法:我们查阅了医疗记录以描述其临床过程,并采访了他的家人以确定水暴露情况。通过重复性非多态性核位点分析,对福氏耐格里原虫菌株进行了基因分型,并与北美菌株进行了比较。我们查阅了美国国家生物技术信息中心数据库(GenBank)中的福氏耐格里原虫菌株,以确定印度存在的基因型。结果:患者返回后3天出现急性脑病;唯一已知的鼻腔水暴露是5天前在印度的一个室内游泳池。脑脊液检查显示中性粒细胞为主的脑脊液细胞增多和低葡萄糖,但革兰染色和培养均为阴性。脑脊液显微镜检查显示滋养体;通过实时聚合酶链反应检测到福氏耐格里原虫。经典基因分型确认为I型,在美国和GenBank中的印度菌株中常见。北美福氏耐格里原虫菌株与患者菌株在5个非多态性位点存在差异。结论:一名男子在印度度假租赁游泳池可能暴露后死于原发性阿米巴脑膜脑炎。我们建议当脑脊液检查提示细菌性脑膜炎但革兰染色阴性时,将原发性阿米巴脑膜脑炎纳入鉴别诊断。基因分型可以增进我们对福氏耐格里原虫分子流行病学的理解,并支持未来的调查。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
一名从印度旅行归来的美国男子在出现急性脑病并死亡后,其原发性阿米巴脑膜脑炎的病因及感染源是什么?
核心机制
福氏耐格里原虫通过鼻腔水暴露进入体内,经嗅神经穿过筛板侵袭中枢神经系统,导致严重的脑组织损伤。
主要证据
患者脑脊液镜检发现滋养体,实时PCR确认福氏耐格里原虫;经典基因分型显示为I型,与北美菌株在5个重复性非多态性位点存在差异,提示感染可能发生在印度。
研究意义
强调旅行相关PAM的风险,建议将PAM纳入鉴别诊断,并提倡加强国际旅行者的水安全意识和国际合作。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

流行病学调查

确定患者可能的感染源和暴露途径。

回顾患者旅行史,访谈其家人以确定水暴露情况,发现患者在印度度假租赁房屋的室内游泳池游泳并头部入水。

2

临床诊断与实验室确认

明确病原体并确认PAM诊断。

采集脑脊液标本,进行常规检查、革兰染色、培养、实时PCR及病理学检查,发现阿米巴滋养体并确认福氏耐格里原虫。

3

分子流行病学分析

对患者分离株进行基因分型并与参考菌株比较,以推断感染来源。

采用经典基因分型方法(基于ITS1和5.8S rRNA序列)确定患者菌株基因型为I型;通过重复性非多态性位点分析比较患者菌株与15株北美参考株的差异;并查阅GenBank中印度菌株的序列信息。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
聚合酶链反应----
基因银行数据库----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
流行病学调查
旅行史、水暴露史(包括游泳池、湖泊、溪流等)、鼻腔冲洗史
阅读提示:Methods中的Epidemiologic Investigation
临床诊断
脑脊液常规、生化、革兰染色、培养、实时PCR及显微镜检查
阅读提示:Case Report及Results中的Laboratory Investigation
分子基因分型
引物序列、PCR条件、测序方法
阅读提示:Methods中的Laboratory Investigation及Supplementary Table 2
序列比较
参考菌株来源、数量、GenBank登录号、比较的位点
阅读提示:Methods中的Laboratory Investigation及Supplementary Table 1
统计与数据分析
文中未明确说明
阅读提示:Method中的Laboratory Investigation