患者队列建立与临床数据收集
确定研究人群和临床基线特征。
回顾性纳入2017年6月至2021年6月间在浙江大学医学院附属第一医院接受首次allo-HSCT且采用清髓性预处理的364例成人AML患者,收集临床特征、移植相关信息、分子数据和随访结果。
Developmental stage modulates the prognostic impact of RAS pathway mutations in AML patients undergoing Allo-HSCT
该研究为回顾性队列分析,包含364例患者临床数据及分子检测,并进行多变量分析及GSEA,但缺乏体外或动物模型的功能验证。
364例接受allo-HSCT的成人AML患者队列
AML患者亚型根据FAB分类,原始亚型(M0/M1/M2)和单核细胞样亚型(M4/M5) RAS通路突变状态:包括NRAS、KRAS、HRAS、PTPN11、CBL、NF1、BRAF基因突变 主要终点:累积复发率(CIR),次要终点:OS和LFS 预处理方案:清髓性方案(BuCy或改良BuCy) 多变量分析调整变量:包括年龄、WBC、ELN风险、MRD状态等
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定研究人群和临床基线特征。
回顾性纳入2017年6月至2021年6月间在浙江大学医学院附属第一医院接受首次allo-HSCT且采用清髓性预处理的364例成人AML患者,收集临床特征、移植相关信息、分子数据和随访结果。
鉴定RAS通路基因突变状态。
使用96基因髓系测序面板(Illumina)对骨髓样本提取的DNA进行靶向二代测序,检测NRAS、KRAS、HRAS、PTPN11、CBL、NF1、BRAF等基因突变。
评估RAS通路突变对整个队列患者预后的影响。
比较RAS通路突变型与野生型患者的CIR、LFS和OS,并进行单因素和多因素分析。
探讨RAS通路突变在不同发育阶段亚组中的预后影响是否存在差异。
根据FAB分类将患者分为原始亚组(M0/M1/M2)和单核细胞样亚组(M4/M5),分别分析RAS通路突变对CIR、LFS和OS的影响,并进行多变量分析。
分析RAS通路突变与其他基因突变的共发生情况,以及不同发育阶段亚组间的差异。
比较RAS通路突变型与野生型患者的共突变谱,并在原始和单核细胞样亚组间进行比较。
探索RAS通路突变和发育阶段相关的生物学通路。
使用TCGA-LAML数据,对单核细胞样RAS通路突变型与原始型RAS通路突变型患者进行GSEA,分析富集的GO生物学过程。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 分子特征分析 | 96基因髓系测序面板 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者队列筛选 | 纳入标准:首次allo-HSCT;清髓性预处理;排除APL和缺乏分子数据。 阅读提示:Methods - Patients |
| RAS通路突变检测 | 检测基因列表;测序平台;样本类型(骨髓)。 阅读提示:Methods - Molecular characterization |
| 预后评估 | 主要终点CIR;次要终点OS和LFS;竞争风险事件定义。 阅读提示:Methods - Definitions and outcomes |
| 亚组分析 | FAB分类定义;原始亚组(M0/M1/M2);单核细胞样亚组(M4/M5)。 阅读提示:Methods - Definitions and outcomes |
| 统计方法 | 多变量模型调整变量;P值阈值(<0.05)。 阅读提示:Methods - Statistical analysis |