筛选抑制性信号域
比较不同抑制性信号域(BTLA、LILRB1、KIR2DL1等)对T细胞活化的抑制能力。
在Jurkat报告细胞中表达PD-1嵌合体,与表达mb-αCD3和PD-L1的TCS细胞共培养,检测NF-κB和NFAT报告基因活性。
Inhibitory CARs fail to protect from immediate T cell cytotoxicity
包含报告细胞系统、原代T细胞功能实验、单细胞转录组分析和体外杀伤实验等多层级验证。
Jurkat TPR报告细胞系 原代人T细胞 K562细胞系 公开scRNA-seq数据集
iCAR构建体的表达水平是否匹配 靶细胞上抑制性配体(CD19、PD-L1、HVEM)的表达 共培养时间(如5小时杀伤实验、72小时长期培养) 效应与靶细胞比例(如10:1、3:1、1:1)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较不同抑制性信号域(BTLA、LILRB1、KIR2DL1等)对T细胞活化的抑制能力。
在Jurkat报告细胞中表达PD-1嵌合体,与表达mb-αCD3和PD-L1的TCS细胞共培养,检测NF-κB和NFAT报告基因活性。
测试BTLA信号域在CAR/iCAR组合中的抑制效果,并研究抗原密度的影响。
使用X15-scTCR iCAR模型,脉冲不同浓度Tax肽,检测CAR介导的报告基因抑制。
确定适用于临床相关OTOT问题的CAR/iCAR抗原对。
重新分析公开scRNA-seq数据集,检查CD123/CD19和B7-H3/CD45在肿瘤和正常组织中的表达模式。
评估αCD19-BTLA iCAR和αCD45-BTLA iCAR对CAR活化的抑制能力。
在Jurkat TPR细胞中共表达αCD123-ζ CAR和αCD19-iCAR或αB7H3-ζ CAR和αCD45-iCAR,与表达相应抗原的K562细胞共培养,检测报告基因活性。
验证αCD19-BTLA iCAR是否能抑制第二代CAR(28ζ和BBζ)的活化。
在报告细胞中共表达αCD123-28ζ/BBζ CAR和αCD19-BTLA iCAR,与CD123和CD19双阳性靶细胞共培养,检测报告基因抑制。
测试αCD19-BTLA iCAR对原代CAR-T细胞增殖、细胞因子产生和CD25上调的影响。
从健康供体PBMCs制备αCD123-28ζ CAR-T细胞,共表达αCD19-BTLA iCAR、PD-1或BTLA,与表达相应配体的K562细胞共培养4天,分析增殖、细胞因子和CD25表达。
检测iCAR或抑制性受体是否能保护靶细胞免受CAR-T细胞杀伤。
进行5小时Annexin V杀伤实验和72小时长期共培养实验,比较iCAR靶抗原表达与否靶细胞的存活。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 细胞分离 | Lymphoprep分离液 | Technoclone | -- |
| 细胞分选 | FACSCalibur流式细胞仪 | BD Bioscience | -- |
| LSRFortessa流式细胞仪 | BD Bioscience | -- | |
| SH800分选仪 | Sony Biotechnology | -- | |
| 抗体染色 | B7-H3-PE抗体 | BioLegend | -- |
| BTLA-APC抗体 | BD Bioscience | -- | |
| CD107a-FITC抗体 | BioLegend | -- | |
| CD123-PE抗体 | BioLegend | -- | |
| CD19-PE抗体 | BioLegend | -- | |
| CD25-PE抗体 | BioLegend | -- | |
| CD4-BV421抗体 | BioLegend | -- | |
| CD45-PE抗体 | BioLegend | -- | |
| CD8-PerCP抗体 | BioLegend | -- | |
| HVEM-PE抗体 | BioLegend | -- | |
| mCD45.2-APC抗体 | BioLegend | -- | |
| PD-L1-PE抗体 | BioLegend | -- | |
| PD-1-APC抗体 | BioLegend | -- | |
| SA-FITC抗体 | BioLegend | -- | |
| SA-PE抗体 | BioLegend | -- | |
| Strep-II标签生物素抗体 | GenScript | -- | |
| V5标签抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 基因编辑 | crRNA | IDT | -- |
| tracrRNA | IDT | -- | |
| Cas9蛋白 | -- | -- | |
| Neon转染系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Gentra Puregene细胞试剂盒 | Qiagen | -- | |
| 病毒包装 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| T细胞分离 | 全T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- |
| T细胞激活 | Dynabeads磁珠 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞因子 | IL-2 | Peprotech | -- |
| IL-7 | Peprotech | -- | |
| IL-15 | Peprotech | -- | |
| 抗体 | OKT3抗体 | Ortho Pharmaceutical Corporation | -- |
| 抗CD28抗体 | BioLegend | -- | |
| 增殖实验 | CellTrace Violet增殖染料 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC | BioLegend | -- |
| Annexin V-PE | BioLegend | -- | |
| 细胞因子检测 | HCYTOMAG-60K试剂盒 | Merck | -- |
| HCD8MAG-15K试剂盒 | Merck | -- | |
| Luminex 100系统 | Luminex | -- | |
| 流式分析 | FlowJo 10.8.2软件 | Becton Dickinson | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 报告细胞实验 | TPR细胞系(JE6.1 TPR)、TCS或K562刺激细胞、共培养时间(18-24小时)、报告基因(NF-κB、NFAT、AP1) 阅读提示:Methods 'Reporter cell assays' |
| 原代T细胞功能实验 | PBMCs供体数量、T细胞分离方法、共培养时间(4天)、E:T比例(5:2)、检测指标(增殖、细胞因子、CD25) 阅读提示:Methods 'Determining T cell proliferation and upregulation of CD25' 和 'Cytokine profiling' |
| 细胞毒性实验 | 效应细胞与靶细胞比例(10:1、3:1、1:1)、共培养时间(5小时)、Annexin V染色方法 阅读提示:Methods 'Annexin V cytotoxicity assay' |
| 长期共培养实验 | 共培养时间(72小时)、E:T比例(1:1、1:3、1:10)、靶细胞计数方法、细胞因子检测 阅读提示:Methods 'Combined cytotoxicity and cytokine profiling assay' |