患者队列建立与临床特征分析
评估登革热患者中HCV血清阳性率及临床特征。
纳入2014-2015年台湾高雄地区确诊登革热患者515例,收集基线临床和实验室数据,检测抗HCV和HCV RNA,观察登革热结局。
Viral Interference Between Dengue Virus and Hepatitis C Virus Infections
包含患者队列的临床观察、回顾性对照比较及体外病毒共感染实验,并进行了病毒载量动态分析和蛋白表达验证。
登革热患者队列 HCV单一感染对照组 Con1 HCV复制子细胞 C6/36细胞
DF确诊标准:发热≥38.0°C且NS1阳性、病毒分离、RT-PCR或血清学转换 HCV RNA检测:采用Abbott RealTime HCV,检测限12 IU/mL DENV1体外感染Con1细胞MOI=10,感染后第3、5天检测NS1和NS5A表达 统计学方法:独立t检验、Mann-Whitney U检验、卡方检验、Wilcoxon符号秩检验,P<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估登革热患者中HCV血清阳性率及临床特征。
纳入2014-2015年台湾高雄地区确诊登革热患者515例,收集基线临床和实验室数据,检测抗HCV和HCV RNA,观察登革热结局。
观察急性登革热期间及恢复后HCV RNA水平的变化。
对抗HCV阳性患者进行HCV RNA检测,包括DF时、恢复后及部分患者DF前,分析病毒载量变化。
比较DENV/HCV双重感染与HCV单一感染患者HCV RNA变化,以排除自然波动。
纳入年龄、性别、基因型、随访间隔匹配的HCV单一感染患者33例,按1:3比例,比较HCV RNA变化(delta HCV RNA)。
验证DENV感染对HCV复制的影响。
用DENV1(MOI=10)感染Con1 HCV复制子细胞,以热灭活DENV1为阴性对照,感染后第3、5天收集样本,Western blot检测DENV1 NS1和HCV NS5A蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| DF诊断 | 登革NS1抗原试纸条 | Bio-Rad Laboratories | -- |
| 抗HCV检测 | 第三代酶联免疫分析 | Abbott Laboratories | -- |
| HCV RNA定量与基因分型 | RealTime HCV检测试剂盒 | Abbott Molecular | -- |
| HBsAg检测 | ARCHITECT HBsAg检测试剂盒 | Abbott Diagnostics | -- |
| 核酸提取 | MagNA Pure Compact核酸提取试剂盒 | Roche | -- |
| 核酸浓度测定 | Nanodrop ND-1000分光光度计 | 文中未明确说明 | -- |
| 逆转录 | High Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- |
| PCR扩增 | Platinum PCR SuperMix High Fidelity | Invitrogen | -- |
| PCR产物纯化 | PCR片段提取试剂盒 | Geneaid | -- |
| DNA测序 | ABI PRISM BigDye Terminator循环测序试剂盒 | Applied Biosystems | 版本3.1 |
| ABI PRISM 3730XL DNA分析仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Invitrogen | -- | |
| RPMI-1640培养基 | 文中未明确说明 | -- | |
| Western blot | 抗NS1抗体 | Genetex | -- |
| 抗NS5A抗体 | Millipore | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | -- | |
| 蛋白提取 | RIPA细胞裂解液 | Biotools | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| ECL化学发光检测 | Millipore | -- | |
| Western blot成像 | BioSpectrum AC成像系统 | UVP | -- |
| 统计分析 | SPSS 12.0统计软件 | SPSS | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者队列 | 纳入DF确诊患者515例,排除标准(HIV感染、自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、硬化性胆管炎、威尔逊病、α1-抗胰蛋白酶缺乏症、正在接受HCV抗病毒治疗)、年龄≥18岁 阅读提示:Methods部分‘Patients’段落 |
| HCV RNA检测 | 抗HCV阳性患者于DF恢复后至少一次HCV RNA检测,检测方法为Abbott RealTime HCV(检测限12 IU/mL) 阅读提示:Methods部分‘Laboratory Tests’ |
| 对照组匹配 | 按年龄、性别、HCV基因型、随访间隔1:3匹配HCV单一感染患者,需为治疗初始者 阅读提示:Methods部分‘Patients’段落的最后一句 |
| 体外实验 | Con1细胞培养条件(DMEM+10%FBS,37°C,5%CO2),DENV1感染MOI=10,感染时间、灭活对照,样本收集时间点(第3、5天),实验重复次数(三次) 阅读提示:Methods部分‘Con1 Cell Line Experiment’ |
| 统计分析 | 统计检验方法选择(正态分布用t检验,非正态用Mann-Whitney U),分类变量用卡方或Fisher精确检验,HCV RNA变化用Wilcoxon符号秩检验,显著性水平P<0.05 阅读提示:Methods部分‘Statistical Analysis’ |