晨起与随机后口咽唾液诊断SARS-CoV-2感染:标本采集时间对社区筛查的意义

Early-Morning vs Spot Posterior Oropharyngeal Saliva for Diagnosis of SARS-CoV-2 Infection: Implication of Timing of Specimen Collection for Community-Wide Screening

作者信息Derek Ling-Lung Hung, Xin Li, Kelvin Hei-Yeung Chiu, Cyril Chik-Yan Yip, Kelvin Kai-Wang To, Jasper Fuk-Woo Chan, Siddharth Sridhar, Tom Wai-Hin Chung, Kwok-Cheung Lung, Raymond Wai-To Liu, Grace Sze-Wai Kwan, Ivan Fan-Ngai Hung, Vincent Chi-Chung Cheng, Kwok-Yung Yuen
PMID32577428
发布时间2020-06-07
DOI10.1093/ofid/ofaa210

实验完整度

中

前瞻性观察研究,纳入18名确诊患者,在同一日内多个时间点采集唾液并检测Ct值,但无功能或机制验证。

主要模型

确诊SARS-CoV-2感染的住院患者 后口咽唾液标本

重点核对

采集时间点:晨起、午餐前、下午3点、晚餐前、睡前 采集量:每次至少2mL后口咽唾液 检测方法:RT-PCR检测E基因,记录Ct值 统计分析:Friedman检验、Dunn多重比较、单因素方差分析

摘要

背景:后口咽唾液逐渐被认为是SARS-CoV-2诊断的有效呼吸道标本。它易于采集,适合社区大规模筛查。目前最佳采集时间未知,我们推测在口腔卫生和早餐前采集晨起标本可提高诊断率。方法:在一天内的5个不同时间点采集18名经分子检测确诊SARS-CoV-2感染患者的后口咽唾液,比较循环阈值(Ct)值。结果:晨起采集标本的Ct值总体呈较低趋势,病毒载量逐渐下降至夜间,但仅与睡前标本比较差异有统计学意义。13名受试者中8名晨起病毒载量高于其余4个时间点(午餐前、下午3点茶点前、晚餐前、睡前)。结论:结果提示上呼吸道病毒排出存在昼夜节律变化,晨起病毒载量较高的趋势。对于社区筛查,可全天采集后口咽唾液,但最好在清晨采集以最大限度地提高检出率。关键词:冠状病毒;诊断;SARS-CoV-2;唾液;筛查。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
后口咽唾液的最佳采集时间是否影响SARS-CoV-2的诊断检出率。
核心机制
SARS-CoV-2病毒载量在晨起较高,可能因夜间分泌物浓缩病毒颗粒。
主要证据
18名患者同日5个时间点唾液Ct值比较,晨起Ct值最低,与睡前比较显著更低。
研究意义
社区筛查可优先采用晨起唾液,提高检出率,支持早期发现和隔离。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

患者纳入与标本采集

收集确诊患者在不同时间点的后口咽唾液,以比较病毒载量。

招募18名SARS-CoV-2感染住院患者,由护士指导在5个时间点采集唾液,每次至少2mL,保存于含2mL病毒转运液的标本瓶中。

2

核酸提取与RT-PCR检测

定量检测唾液标本中的SARS-CoV-2病毒载量。

使用NucliSENS easyMAG提取总核酸,采用Tib-molbiol试剂盒和LightCycler 480 II系统进行RT-PCR检测E基因,获得Ct值。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
无菌标本瓶----
病毒转运液----
NucliSENS easyMAGBioMerieux--
LightCycler 480 II实时荧光定量PCR仪Roche--
Tib-molbiol试剂盒Tib-molbiol--
PRISMGraphPad Software--
Microsoft Excel 2016Microsoft Corporation--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
患者纳入
患者需为SARS-CoV-2感染确诊,且同意参与;研究经伦理批准(UW 13-372);患者来源为特定医院。
阅读提示:Methods - Patients
标本采集
采集时间点(晨起、午餐前、下午3点、晚餐前、睡前);晨起采集需在刷牙、漱口、早餐前;每次至少2mL唾液。
阅读提示:Methods - Specimen Collection
病毒检测
使用NucliSENS easyMAG提取、Tib-molbiol试剂盒、LightCycler 480 II系统;具体PCR条件需参考试剂盒说明。
阅读提示:Methods - Nucleic Acid Extraction and Real-time RT-PCR
统计分析
Friedman检验、Dunn多重比较、One-way ANOVA;对未检出标本Ct值赋值为41。
阅读提示:Methods - Outcome Measurement and Statistical Analysis