基于症状发作和密切接触暴露的严重急性呼吸综合征冠状病毒2诊断性能:来自Test Us at Home前瞻性队列研究的分析

Performance of and Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Diagnostics Based on Symptom Onset and Close Contact Exposure: An Analysis From the Test Us at Home Prospective Cohort Study

作者信息Carly Herbert, Biqi Wang, Honghuang Lin, Yi Yan, Nathaniel Hafer, Caitlin Pretz, Pamela Stamegna, Colton Wright, Thejas Suvarna, Emma Harman, Summer Schrader, Chris Nowak, Vik Kheterpal, Elizabeth Orvek, Steven Wong, Adrian Zai, Bruce Barton, Ben S Gerber, Stephenie C Lemon, Andreas Filippaios, Laura Gibson, Sharone Greene, Andres Colubri, Chad Achenbach, Robert Murphy, William Heetderks, Yukari C Manabe, Laurel O'Connor, Nisha Fahey, Katherine Luzuriaga, John Broach, Kristian Roth, David D McManus, Apurv Soni
PMID38911947
发布时间2024-05-31
DOI10.1093/ofid/ofae304

实验完整度

高

纵向队列研究,包含配对Ag-RDT和RT-PCR检测、症状和暴露追踪、病毒载量(Ct值)、变异株分型,并按多个变量分层分析,提供了功能验证和机制验证。

主要模型

居家自检个体队列(Test Us at Home) SARS-CoV-2感染者 有症状个体 暴露个体

重点核对

症状发作后第2天进行RT-PCR和Ag-RDT检测 暴露后第6天进行RT-PCR和Ag-RDT检测 无症状暴露个体中Ag-RDT阳性率较低 连续检测提高检测性能 不同变异株(Delta、Omicron)的病毒载量峰值时间差异

摘要

背景:了解不同人群中症状发作和严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)暴露后诊断性能的变化对于指导SARS-CoV-2诊断的使用至关重要。方法:Test Us at Home研究是一项纵向队列研究,于2021年10月至2022年2月期间在美国各地招募个体。参与者每48小时在家进行配对抗原检测快速诊断试验(Ag-RDT)和逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测,持续15天,并在检测前自我报告症状和已知的2019冠状病毒病暴露情况。计算症状发作后和暴露后每天的Ag-RDT和RT-PCR检测阳性率,并按疫苗接种状态、变异株、年龄组和性别进行分层。结果:阳性率最高出现在症状发作后2天(RT-PCR,91.2%;Ag-RDT,71.1%)和暴露后6天(RT-PCR,91.8%;Ag-RDT,86.2%)。RT-PCR和Ag-RDT的性能不因疫苗接种状况、变异株、年龄组或性别而异。暴露的无症状个体的Ag-RDT阳性率低于有症状个体(37.5% [95%置信区间{CI},13.7%–69.4%] vs 90.3% [75.1%–96.7%])。累积而言,Ag-RDT在症状发作后4天内检测出84.9%(95% CI,78.2%–89.8%)的感染。对于暴露参与者,Ag-RDT在暴露后6天内检测出94.0%(95% CI,86.7%–97.4%)的RT-PCR确诊感染。结论:Ag-RDT和RT-PCR检测的阳性率在症状发作后2天和暴露后6天最高,且性能随连续检测而提高。Ag-RDT的阳性率在无症状个体中最低,但不因性别、变异株、疫苗接种状况或年龄组而异。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
了解SARS-CoV-2感染中,基于症状发作和暴露时间的诊断检测性能变化,以及这些变化是否因年龄、性别、疫苗接种状态和变异株而异。
核心机制
文中未明确说明
主要证据
基于Test Us at Home前瞻性队列,参与者每48小时进行配对Ag-RDT和RT-PCR检测并报告症状和暴露,计算阳性率和Ct值,发现Ag-RDT和RT-PCR性能在症状发作后2天和暴露后6天达到峰值,且不因年龄、性别、疫苗接种状态或变异株而异。
研究意义
研究结果支持在症状或暴露情况下,连续使用Ag-RDT进行SARS-CoV-2检测的有效性,并为指导个体进行快速抗原检测的时机提供依据。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

研究设计与参与者招募

构建纵向队列以收集配对检测和临床数据

Test Us at Home研究纳入了2021年10月至2022年2月期间美国各地的参与者,要求参与者在入组时无症状,并在15天内每48小时进行Ag-RDT和RT-PCR检测,同时自我报告症状和暴露情况。

2

检测方法

评估Ag-RDT和RT-PCR检测的性能

参与者使用指定的Ag-RDT(QuickVue、BinaxNOW或BD Veritor)进行检测,并将样本送至中心实验室进行RT-PCR检测。使用RT-PCR结果作为参比标准,计算阳性率。

3

数据收集与症状和暴露评估

确定症状发作日期和暴露日期

参与者每48小时报告症状和暴露情况,记录症状发作日期(DPSO 0)和暴露日期(DPE 0)。

4

统计分析

评估检测性能随时间变化及不同亚组差异

计算各DPSO和DPE的RT-PCR和Ag-RDT阳性率,并按疫苗接种状态、变异株、年龄和性别进行分层分析,同时计算累积阳性率。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
参与者入组
入组时无症状,年龄≥2岁,来自美国各地
阅读提示:Methods - Study Population
检测频率
每48小时检测一次,持续15天
阅读提示:Methods - Study Population
症状和暴露定义
症状报告为至少一种症状;暴露定义为24小时内无口罩接触6英尺以内至少15分钟
阅读提示:Methods - Measures
诊断检测
Ag-RDT类型和RT-PCR方法,以及RT-PCR结果一致性判定标准
阅读提示:Methods - Measures
分层分析
疫苗接种状态(≥1剂 vs 0剂),年龄组(儿童<18 vs 成人≥18),性别,变异株(Delta vs Omicron)
阅读提示:Methods - Measures; Results