样本采集与运输
获取用于检测GBS定植的直肠和阴道拭子样本。
在阶段1中,从分娩时孕妇收集单独的阴道和直肠拭子;在阶段2中,从非孕妇收集双头直肠阴道拭子。拭子置于Amies运输培养基中,并在2–8°C下运输至实验室,在48小时内处理。
Rapid Point-of-care Testing to Inform Intrapartum Treatment of Group B Streptococcus-Colonized Women in Uganda
包含两阶段前瞻性诊断准确性研究,比较LAMP与增菌培养,并使用多重PCR对不一致样本进行判定,涉及孕妇和非孕妇样本。
孕妇直肠/阴道拭子样本 非孕妇直肠/阴道拭子样本
样本来源:孕妇(分娩时)和非孕妇(门诊) 检测方法:HG GBS LAMP检测(sip基因靶标)与增菌培养比较 样本类型:直肠和阴道拭子 不一致样本判定:使用Allplex 脑膜炎-B PCR检测(cfb基因靶标) 样本量:阶段1(1279个有效样本)和阶段2(166个样本)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取用于检测GBS定植的直肠和阴道拭子样本。
在阶段1中,从分娩时孕妇收集单独的阴道和直肠拭子;在阶段2中,从非孕妇收集双头直肠阴道拭子。拭子置于Amies运输培养基中,并在2–8°C下运输至实验室,在48小时内处理。
比较增菌培养和HG GBS LAMP检测对GBS的检出能力。
拭子接种于3 mL Lim肉汤中,在5%二氧化碳、37°C下孵育24小时。取150 µL增菌肉汤进行LAMP检测,另取10 µL接种于CHROMagar StrepB平板进行培养。培养板过夜培养后观察GBS推定菌落(呈淡紫色),阴性平板再孵育24小时。推定菌落通过Lancefield链球菌分型确认。
评估无增菌步骤的HG GBS LAMP检测对GBS的检出性能。
双头拭子的一个头在3 mL裂解缓冲液中洗脱,用于HG GBS LAMP检测;另一个头按阶段1所述进行培养。
解决LAMP检测与培养结果不一致样本的GBS真实状态。
阶段2中培养阴性但LAMP阳性的27份样本使用Allplex 脑膜炎-B PCR检测(靶标cfb基因)进行复测。结果:96.3%(26/27)为阳性,被视为GBS阳性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 样本采集与运输 | Amies运输培养基 | -- | -- |
| 增菌培养 | 含粘菌素和萘啶酸的Todd Hewitt肉汤(Lim肉汤) | -- | -- |
| CHROMagar™ StrepB显色培养基 | CHROMagar | -- | |
| Lancefield链球菌分型试剂盒 | Oxoid | -- | |
| LAMP检测 | HG GBS LAMP检测 | HiberGene Diagnostics | -- |
| HG Swift检测仪 | HiberGene Diagnostics | -- | |
| 不一致样本判定 | Allplex™ 脑膜炎-B PCR检测 | Seegene | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本采集 | 样本来源人群(孕妇或非孕妇)、样本类型(阴道和直肠拭子)、采集时机(分娩时或门诊) 阅读提示:Materials and Methods - Eligibility Criteria and Sampling |
| 增菌培养 | Lim肉汤配制、培养条件(5% CO2,37°C,24小时)、培养基品牌 阅读提示:Materials and Methods - Laboratory Methods, Phase 1 |
| LAMP检测 | 样本处理体积(150 µL或80 µL)、裂解剂类型、加热变性条件(105°C,5分钟)、反应体积(25 µL)、检测仪器 阅读提示:Materials and Methods - Laboratory Methods, HG GBS LAMP assay |
| 不一致样本判定 | 判定检测方法(Allplex Meningitis-B PCR)、靶标基因(cfb) 阅读提示:Materials and Methods - Laboratory Methods, Allplex™ Meningitis-B PCR assay |