验证GRP/GRPR在AKI中的表达上调
确认GRP/GRPR在AKI患者和模型中是否异常表达。
通过ELISA检测患者血清ProGRP,IHC/IF检测肾组织GRPR,RT-qPCR和Western blot检测小鼠模型(I/R和顺铂)中GRP和GRPR表达。
Genetic and pharmacological inhibition of GRPR protects against acute kidney injury via attenuating renal inflammation and necroptosis
包含患者样本、多种小鼠模型(全局及条件性敲除、药物干预)、体外细胞实验及机制研究(RNA-seq、ChIP、Co-IP等),形成多层级验证。
人肾小管上皮细胞系HK2 小鼠肾小管上皮细胞mTEC GRPR基因敲除小鼠(全局KO) GRPR条件性敲除小鼠(GRPRFlox/Flox/KspCre)
GRPR表达水平:在患者和小鼠AKI模型中验证,尤其是在肾小管上皮细胞中。 GRPR敲除或过表达对肾损伤和炎症的影响:使用全局KO和条件性KO小鼠,以及细胞系。 STAT1信号通路:通过RNA-seq、Western blot、ChIP等验证STAT1在GRPR下游的作用。 GRPR拮抗剂RH-1402的疗效:在体内外模型中评估其预防和治疗效果。 TLR4与GRPR的相互作用:通过co-IP和IF验证。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认GRP/GRPR在AKI患者和模型中是否异常表达。
通过ELISA检测患者血清ProGRP,IHC/IF检测肾组织GRPR,RT-qPCR和Western blot检测小鼠模型(I/R和顺铂)中GRP和GRPR表达。
通过遗传学手段验证GRPR在AKI中的功能。
利用GRPR全局KO和条件性KO(KspCre)小鼠,建立顺铂和I/R诱导的AKI模型,检测肾功能、肾小管损伤和炎症指标。
在细胞水平证实GRPR对肾小管上皮细胞凋亡和炎症的影响。
在HK2和mTEC细胞中通过shRNA敲低或过表达GRPR,或使用CRISPR-Cas9敲除,用顺铂或H/R处理,检测KIM1、炎症因子和坏死性凋亡标志物。
阐明GRPR促进AKI的分子机制。
通过RNA-seq分析GRPR过表达mTEC的转录组,KEGG通路富集发现炎症和坏死性凋亡通路;验证GRPR与TLR4相互作用,STAT1磷酸化,STAT1结合MLKL和CCL2启动子,以及GRP的自分泌正反馈。
通过过表达STAT1验证其在GRPR介导的AKI中是否必要和充分。
在GRPR条件性KO小鼠和KO细胞中过表达STAT1,观察是否恢复肾损伤和炎症。
探索抑制GRPR是否对AKI具有治疗作用。
使用慢病毒介导的GRPR敲低和GRPR拮抗剂RH-1402,在体内外模型中评估其预防和治疗效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | VivaCell | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 细胞处理 | 顺铂 | -- | -- |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | -- | -- | |
| 牛奶 | -- | -- | |
| 实时荧光定量PCR | Trizol试剂 | -- | -- |
| RealMasterMix逆转录试剂 | Toyobo | -- | |
| iQ SYBR Green supermix | Bio-Rad | -- | |
| 细胞活性检测 | MTT试剂 | -- | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 组织学检测 | PAS染色试剂盒 | -- | -- |
| 免疫组织化学 | DAB显色底物 | -- | -- |
| 细胞荧光 | DAPI | -- | -- |
| 免疫荧光 | 羊抗兔IgG-罗丹明 | Bioss | -- |
| FITC标记二抗 | -- | -- | |
| 免疫沉淀 | NP-40免疫沉淀缓冲液 | Sigma-Aldrich | -- |
| Protein G Sepharose 珠子 | -- | -- | |
| 染色质免疫沉淀 | SimpleChIP酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | -- |
| 荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因系统 | Promega | -- |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC | -- | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| RNA测序 | BGISEQ测序平台 | BGI | -- |
| 肾功能检测 | 肌酐检测试剂盒 | Nanjingjiancheng | -- |
| 尿素氮检测试剂盒 | Nanjingjiancheng | -- | |
| ProGRP检测 | GRP前体检测试剂盒 | Roche | -- |
| 放射配体结合实验 | 125I-Tyr4-BBN | PerkinElmer | NEX258 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型诱导 | 顺铂剂量:20 mg/kg;I/R缺血时间:40分钟;再灌注时间:24小时;小鼠品系、年龄、性别;对照组处理 阅读提示:Methods - Mouse models |
| 细胞处理 | 顺铂浓度:20 μmol/L;处理时间:24小时;H/R条件:0.1% O2 12小时,复氧时间;FBS浓度(饥饿时0.5%) 阅读提示:Methods - Cell culture and transfection |
| 基因敲除验证 | GRPR KO小鼠构建策略;条件性KO效率(约80%);CRISPR sgRNA序列;Western blot验证抗体 阅读提示:Methods - Generation and verification of GRPR KO mice and conditional KO mice; Supplement Figure S2 |
| 药物处理 | RH-1402给药途径、剂量、时间点(预防实验在顺铂前,治疗实验在顺铂后1天);细胞实验浓度(1-4 μmol/L) 阅读提示:Results - Treatment with a GRPR antagonist RH-1402; Figure 8 |
| 检测指标 | 血清肌酐和BUN测定;PAS染色评分标准;KIM1、TNF-α、IL-1β、CCL2检测方法;流式细胞术检测细胞死亡率;ChIP-qPCR引物序列 阅读提示:Methods and Figure legends |