2011-2017年美国结核病患者中核酸扩增检测用于快速检测结核分枝杆菌复合群的使用情况

Use of Nucleic Acid Amplification Testing for Rapid Detection of Mycobacterium tuberculosis Complex Among US Tuberculosis Patients, 2011‒2017

作者信息Varsha Kumar, Tracy L Dalton, Lori R Armstrong, Amy Whitesell, Rongxia Li, Angela M Starks
PMID35559127
发布时间2021-10
DOI10.1093/ofid/ofab528

实验完整度

中

基于国家监测数据的回顾性队列分析,包含完整的统计比较,但缺乏干预性实验验证。

主要模型

美国结核病监测队列(NTSS 2011-2017)

重点核对

NAA检测使用比例随时间变化(2011年为60.5%未检测,2017年为33.6%) AFB涂片阳性和阴性病例中的NAA检测比例(70.9% vs 38.0%) NAA检测结果阳性率与痰涂片及培养结果的关系(OR分别为13.17和27.75) NAA检测周转时间<6天的比例(63.7%)

摘要

背景:核酸扩增(NAA)检测可直接从临床标本中快速检测结核分枝杆菌复合群,为接受结核病评估的患者提供有价值的结果。方法:我们分析了进行NAA检测的病例特征,比较了NAA检测结果阳性和阴性的病例,并计算了2011-2017年间美国国家结核病监测系统报告的所有确诊病例的周转时间和治疗时间。结果:在67082例有NAA检测信息的结核病确诊病例中,30820例(45.9%)报告未进行NAA检测;未进行NAA检测的比例逐年下降,从2011年的60.5%降至2017年的33.6%。67082例确诊病例中,27912例(41.6%)NAA检测结果阳性,8215例(12.2%)阴性,135例(0.2%)不确定。在33937例痰涂片抗酸杆菌(AFB)阳性病例中,24093例(70.9%)进行了NAA检测;30244例痰涂片阴性病例中有11490例(38.0%)进行了NAA检测。虽然痰液是最常见的检测标本类型,但非痰标本中79.8%(7023/8804)的NAA检测结果阳性。总体而言,63.7%有实验室检测的病例在标本采集后不到6天报告了NAA检测结果;对于13891例尚未开始治疗的病例,实验室报告日期后至治疗开始的中位时间为2天。结论:我们的分析表明,2011年至2017年间NAA检测的使用有所增加。然而,很大一部分病例未进行NAA检测,这反映了广泛使用面临的挑战,提示有机会扩大这种诊断方法的应用。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
2011-2017年美国结核病病例中NAA检测的使用情况及其相关因素如何?
核心机制
NAA检测可直接从临床标本中检测结核分枝杆菌复合群,快速提供结果,其使用受标本类型、涂片结果等因素影响。
主要证据
基于NTSS 67082例结核病病例的分析显示,NAA检测使用率增加,但45.9%未检测;涂片阳性病例更可能接受NAA检测(OR=4.00);非痰标本阳性率较高。
研究意义
研究表明NAA检测使用增加,但仍有近半数病例未检测,提示需要扩大应用,尤其对非痰标本和涂片阴性病例。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

数据收集与病例筛选

确定纳入分析的结核病病例及NAA检测信息

从NTSS获取2011-2017年已验证的结核病病例,筛选具有NAA检测结果记录(阳性、阴性、不确定或未做)的病例,排除缺失或未知者。

2

描述NAA检测使用情况

评估NAA检测使用的整体趋势和特征

按年份、涂片结果、培养结果、标本类型等分层,计算NAA检测比例,并分析相关因素(OR)。

3

比较NAA检测阳性和阴性病例

确定与NAA阳性结果相关的因素

在36127例有NAA检测结果(阳性或阴性)的病例中,比较不同特征的阳性率和OR。

4

分析NAA检测与其它实验室结果的符合率

评估NAA检测与涂片和培养结果的一致性

计算不同涂片和培养状态下NAA阳性率,并分析不一致病例的特征。

5

评估周转时间及对治疗的影响

评估NAA检测报告时间及对治疗启动的影响

计算NAA检测从标本采集到报告的周转时间,并比较治疗前后报告对治疗时间的影响。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

数据分析与统计

产品清单

实验环节名称品牌货号
SAS----
Microsoft ExcelMicrosoft--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
数据来源与病例定义
NTSS报告病例,满足2009年国家结核病监测病例定义
阅读提示:Methods部分
NAA检测结果分类
NAA结果分为阳性、阴性、不确定或未做,且阳性结果优先于其他
阅读提示:Methods部分
NAA检测使用相关因素
AFB涂片阳性、培养阳性、胸片异常、年龄、出生地等特征与NAA检测的关联
阅读提示:Table 1
NAA阳性结果相关因素
涂片阳性、培养阳性、非痰标本等与NAA阳性结果的关联
阅读提示:Table 2
周转时间和治疗时间
NAA检测周转时间<6天的比例,治疗前后报告对时间的影响
阅读提示:Table 3和Results部分