基于组织纳米转染的内皮PLCγ2靶向表观遗传基因编辑挽救灌注和糖尿病缺血性创面愈合

Tissue nanotransfection-based endothelial PLCγ2-targeted epigenetic gene editing rescues perfusion and diabetic ischemic wound healing

作者信息Sumit S Verma, Chandan K Sen, Rajneesh Srivastava, Surya C Gnyawali, Parul Katiyar, Ajay K Sahi, Manishekhar Kumar, Yashika Rustagi, Sheng Liu, Diksha Pandey, Ahmed S Abouhashem, Leila N W Fehme, Sedat Kacar, Sujit K Mohanty, Julie Faden-McCormack, Michael P Murphy, Sashwati Roy, Jun Wan, Mervin C Yoder, Kanhaiya Singh
PMID39863930
期刊Mol Ther
发布时间2025-03
DOI10.1016/j.ymthe.2025.01.034

实验完整度

高

包含scRNA-seq、细胞模型、小鼠模型(STZ和db/db)以及功能/机制验证(IHC、免疫印迹、ELISA等),证据层级多样。

主要模型

人类糖尿病创缘组织(scRNA-seq) 小鼠内皮细胞(MPECs) 人皮肤微血管内皮细胞(HMECs) STZ诱导的糖尿病小鼠模型 db/db糖尿病小鼠模型

重点核对

PLCγ2启动子甲基化水平(人、小鼠) VEGF和去甲基化混合物的递送剂量和时间 TNT递送参数(脉冲数量、电压、电流) 细胞类型特异性(CDH5启动子驱动gRNA) 伤口血流测量(LSI,多普勒)

摘要

糖尿病创面因潜在的外周血管病变而复杂化。依赖血管内皮生长因子(VEGF)治疗来改善灌注在逻辑上是合理的,但临床研究结果在挽救糖尿病创面血管化方面却令人失望。我们之前的工作发现,内皮磷脂酶Cγ2(PLCγ2)低表达阻碍了VEGF对糖尿病缺血肢体的治疗效果。在这项工作中,以人创缘单细胞RNA测序为指导,我们测试了基因靶向治疗性去甲基化旨在改善VEGF介导的新血管形成的疗效。在所有五个已识别的糖尿病创缘内皮亚群中(包括动脉、静脉和毛细血管细胞),PLCγ2表达均降低。这种低表达与PLCγ2启动子高甲基化相关。小鼠糖尿病缺血创缘的PLCγ2启动子也高度甲基化。为了在VEGF治疗期间特异性去甲基化内皮PLCγ2启动子,使用组织纳米转染(TNT)技术将CRISPR-dCas9去甲基化混合物递送至缺血创缘。在VEGF治疗期间,基于去甲基化的PLCγ2上调通过激活p44/p42-丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)→缺氧诱导因子[HIF]-1α通路,改善了创面组织血流,并增加了von Willebrand因子(vWF)+ / PLCγ2+血管组织元件的丰度。总之,基于TNT的质粒递送去甲基化PLCγ2基因启动子活性,显著改善了糖尿病皮肤创面的VEGF治疗,导致更好的灌注和加速的创面闭合。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
糖尿病创面中内皮PLCγ2表达下调的表观遗传机制,以及靶向去甲基化改善VEGF疗效和促进创面愈合的效果。
核心机制
高血糖和缺血导致PLCγ2启动子高甲基化,抑制其表达;去甲基化恢复PLCγ2,通过激活MAPK44/42-HIF-1α通路促进内源性VEGF产生和血管生成。
主要证据
scRNA-seq和免疫组化显示糖尿病创面中PLCγ2表达降低与启动子甲基化增加相关;小鼠模型中TNT递送去甲基化混合物降低甲基化并增加PLCγ2;功能实验显示灌注和创面愈合改善,机制上激活MAPK通路和HIF-1α核转位。
研究意义
提出靶向表观遗传干预(如去甲基化)可提高糖尿病创面VEGF治疗的效果,为临床转化提供新策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

单细胞RNA测序分析创缘内皮异质性

鉴定糖尿病与正常创缘内皮细胞亚群,并比较PLCγ2表达差异

对糖尿病和非糖尿病个体创缘组织进行scRNA-seq,分析内皮亚群组成和PLCγ2表达。

2

验证PLCγ2表达与启动子甲基化关联

确定糖尿病创面中PLCγ2低表达是否与启动子高甲基化相关

通过免疫组化验证蛋白表达,通过激光显微切割和亚硫酸盐测序检测内皮细胞PLCγ2启动子甲基化。

3

小鼠模型验证高血糖和缺血对Plcγ2甲基化的影响

测试高血糖和缺血单独对Plcγ2启动子甲基化的因果作用

使用STZ诱导糖尿病小鼠和缺血皮瓣模型,检测皮肤中Plcγ2启动子甲基化和表达。

4

TNT递送CRISPR-dCas9去甲基化混合物

验证内皮特异性的PLCγ2启动子去甲基化效果

通过TNT技术将去甲基化混合物(dCas9-SunTag-TET1CD和CDH5启动子驱动的gRNA)递送到糖尿病小鼠缺血创面,检测内皮细胞特异性的去甲基化。

5

评估去甲基化对VEGF疗效和创面愈合的作用

确定内皮PLCγ2去甲基化是否增强VEGF介导的灌注和创面闭合

在糖尿病缺血创面模型中,比较VEGF单用、去甲基化单用或联合使用的效果,通过激光散斑成像、多普勒超声和创面闭合分析评估。

6

机制研究:PLCγ2-MAPK-HIF-1α通路

阐明PLCγ2去甲基化促进血管生成和VEGF表达的分子机制

通过免疫组化分析vWF/PLCγ2、vWF/VEGF、vWF/p-MAPK共定位,以及体外细胞实验验证PLCγ2过表达对MAPK和HIF-1α的影响。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
Chromium Next GEM 单细胞 3' GEM、文库与凝胶微珠试剂盒 v3.110x Genomics--
NovaSeq 6000Illumina--
全皮肤解离试剂盒Miltenyi Biotec130-101-540
MACS C管Miltenyi Biotec130-093-237
红细胞裂解缓冲液BioLegend420301
激光显微切割系统PALM Technologies--
KRT14抗体Novus BiologicalsNBP2-34403AF488
COL1A2抗体Santa Cruz Biotechnologysc-393573
vWF抗体Abcamab310904
CD144抗体BD Biosciences560411
QIAamp DNA 小型试剂盒Qiagen--
EZ DNA 甲基化-金试剂盒Zymo Research--
Platinum II Taq 热启动 DNA 聚合酶Thermo Fisher Scientific--
组织纳米转染(TNT2.0)系统----
镀金电极----
25G针----
MCDB 131培养基----
Lipofectamine LTXInvitrogen15338-100
Plus试剂Invitrogen11514-015
磷酸化PLCγ2(Tyr753)和总PLCγ2 ELISARayBiotechPEL-PLCγ2-Y753-T-1
VEGF ELISA试剂盒RayBiotechELM-VEGF-1
细胞裂解缓冲液Cell Signaling Technology9803
NuPAGE Bis-Tris凝胶InvitrogenNP0321BOX
MOPS运行缓冲液InvitrogenNP0001
WesternBright ECL喷雾AdvanstaK-12049-D50
Azure c600凝胶成像系统Azure Biosystems--
True-Nuclear 4x固定浓缩液BioLegend--
True-Nuclear 10x透化缓冲液BioLegend--
PLCγ2抗体Cell Signaling Technology3872S
vWF抗体Cell Signaling Technology3872S
COL1A2-PE抗体Cell Signaling Technology3872S
流式细胞仪BD BiosciencesBD
流式细胞仪BD BiosciencesBD
Vevo 2100超声系统FUJIFILM VisualSonics--
线阵探头MS400FUJIFILM VisualSonics--
超声耦合剂Parker Laboratories--
TrilogyCell Marque--
DAPI封片剂Invitrogen--
CD31抗体Abcam--
vWF抗体Abcam--
PLCγ2抗体Cell Signaling Technology3872S
p-PLCγ2抗体----
VEGF抗体----
p-44/42 MAPK抗体----
HIF-1α抗体----
激光共聚焦扫描显微镜LSM 880Zeiss--
AxioScan Z1Zeiss--
miRVana miRNA分离试剂盒AmbionAM1560
NanoDrop ND-1000Thermo Fisher Scientific--
SuperScript III第一链合成系统Invitrogen18080051
SYBR Green实时PCRApplied Biosystems--
C57BL/6小鼠The Jackson Laboratory--
链脲佐菌素----
拜安康血糖监测系统Bayer--
异氟烷----
卡洛芬----
皮肤打孔活检器----
透气敷料----
医用白布胶带----
PeriCam PSI系统Perimed--
Pimsoft软件Perimed--
GraphPad PrismGraphPad Software--
ImageJNational Institutes of Health--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
单细胞RNA测序
样本处理、细胞数量、测序平台
阅读提示:Materials and methods, scRNA-seq
糖尿病模型
STZ剂量(50 mg/kg,5天)及血糖标准(>250 mg/dL)
阅读提示:Materials and methods, Animal studies
缺血创面模型
切口尺寸、支架大小、血管凝固
阅读提示:Materials and methods, Ischemic bi-pedicle flap model
TNT递送
质粒浓度(0.04 ng/μL)、递送时间(d1)、电极参数(10x10ms脉冲,100V,电流<10A)
阅读提示:Materials and methods, In vivo non-viral transfection using tissue nanotransfection 2.0 technology
去甲基化混合物
gRNA序列(三个gRNA的组合)和CDH5启动子特异性
阅读提示:Materials and methods, Plasmids for targeted DNA demethylation
灌注测量
激光散斑成像时间点(d3, d7, d10)
阅读提示:Materials and methods, LSI
多普勒超声
扫描平面、深度(1.5-3 mm)
阅读提示:Materials and methods, Doppler blood flow ultrasonic acquisition