肾上腺素能间充质细胞特征可在无细胞DNA中识别，并与神经母细胞瘤患儿的转移性疾病负担相关

背景：无细胞DNA（cfDNA）中的5-羟甲基胞嘧啶（5-hmC）谱是一种开放染色质和活跃基因表达的表观遗传标志物，与神经母细胞瘤患者的转移性疾病负担相关。神经母细胞瘤肿瘤由肾上腺素能（ADRN）和间充质（MES）细胞组成，其在肿瘤活检中的相对丰度具有预后意义。我们假设在cfDNA 5-hmC谱中可以量化ADRN和MES特异性特征，并增强对神经母细胞瘤患者转移负担的检测。方法：我们先前进行了整合分析，以确定ADRN和MES特异性基因（分别为n=373和n=159）。将细胞系纯化的DNA与健康供体cfDNA进行系列稀释。使用基因集变异分析（GSVA），优化了ADRN和MES特征。然后，我们量化了特征评分，以及我们之前的神经母细胞瘤特征，在来自46名高危患者的84份样本中，包括21名有系列样本的患者。结果：转移负担较高的患者样本中，ADRN和MES基因特征的GSVA评分均升高（p < 0.001）。虽然ADRN和MES特征评分在连续收集的样本中同步变化，但我们发现有患者在复发时MES或ADRN评分单独升高的实例。结论：虽然使用神经母细胞瘤患者cfDNA的5-hmC谱识别ADRN和MES特征并将其与转移负担相关联是可行的，但需要更多数据来确定临床实施的最佳策略。更大规模队列的前瞻性评估正在进行中。