AAV载体构建与生产
生成携带Fam161a较长或较短转录本的AAV8载体,用于基因增强治疗。
设计并构建包含FLAG标签的mFam161a较长和较短转录本,由IRBP增强子和hGRK1启动子驱动,包装为AAV8;通过HEK293T细胞三质粒共转染、碘克沙醇梯度离心纯化,qPCR定量。
Gene augmentation therapy attenuates retinal degeneration in a knockout mouse model of Fam161a retinitis pigmentosa
包含体外病毒载体构建、小鼠模型体内注射、RT-PCR表达验证、活体影像(FFERG、FAF、OCT)功能结构评估及组织学与免疫组化验证,多个独立证据层级。
Fam161a基因敲除小鼠模型 HEK293T细胞(用于病毒载体生产) 野生型小鼠视网膜(对照)
P24-P29小鼠、单次或双次视网膜下注射AAV-mFam161aLo(5×10^10 vg/μL) RT-PCR检测Fam161a较长转录本表达量(注射后4周) OCT检测ONL厚度、FAF检测自发荧光斑点,3、6、8月龄 FFERG检测暗适应和光适应反应,评估功能拯救 H&E和免疫组化检测ONL厚度和FAM161A蛋白表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
生成携带Fam161a较长或较短转录本的AAV8载体,用于基因增强治疗。
设计并构建包含FLAG标签的mFam161a较长和较短转录本,由IRBP增强子和hGRK1启动子驱动,包装为AAV8;通过HEK293T细胞三质粒共转染、碘克沙醇梯度离心纯化,qPCR定量。
将AAV载体递送至Fam161a KO小鼠视网膜下腔,以实现感光细胞转导。
P24-P29小鼠麻醉后,经巩膜穿孔,用34G钝针注射病毒悬液至视网膜下腔,形成bleb;单次注射鼻侧,双次注射鼻侧和颞侧。
确认Fam161a较长转录本在注射视网膜中表达。
注射后4周提取视网膜RNA,进行RT-PCR,特异性扩增包含外显子4的较长转录本。
纵向评估治疗后视网膜结构和功能的变化。
在3、6、8月龄进行FAF、OCT成像,以及FFERG记录;在8月龄进行视动反应测试评估视觉 acuity。
定量评估视网膜结构拯救并确认FAM161A蛋白表达定位。
摘取眼球,固定、包埋、切片,H&E染色测量ONL厚度;免疫组化检测FAM161A、FLAG、感光细胞标记物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 载体生产 | HEK293T细胞 | -- | -- |
| 脱氧核糖核酸酶 | Roche | 11284.932.001 | |
| OptiPrep密度梯度介质 | Sigma-Aldrich | D1556 | |
| Amicon Ultra-15 | Millipore | -- | |
| Pluronic F-68 | Sigma-Aldrich | P5556 | |
| 动物手术 | 30G针头 | -- | -- |
| 34G钝针 | -- | -- | |
| Hamilton注射器 | Hamilton | -- | |
| OPMI解剖显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| 小鼠头部固定器 | David Kopf Instruments | 921-E | |
| 动物术后 | 5%氯霉素抗生素眼膏 | Rekah Pharmaceutical | -- |
| RNA提取 | TRI试剂 | Sigma-Aldrich | T9424 |
| DNA去除试剂盒 | Invitrogen | AM1906 | |
| RT-PCR | qScript cDNA合成试剂盒 | Quanta Bio | 95047-100 |
| 1 kb Plus DNA分子量标准 | NEB | N3200L | |
| OCT | Heidelberg-SPECTRALIS OCT | Heidelberg Engineering | -- |
| OMT | OptoMotry系统 | Cerebral Mechanics | -- |
| FFERG | Espion E2 | Diagnosys | -- |
| IHC | 柠檬酸盐缓冲液 | BioSb | -- |
| 抗原修复液 | -- | -- | |
| 抗FLAG M2抗体 | Sigma-Aldrich | F1804 | |
| 抗FAM161A抗体 | Sigma-Aldrich | HPA032119 | |
| 抗蓝视蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-16363 | |
| 抗CRX抗体 | Abcam | ab140603 | |
| 抗蓝视蛋白抗体 | Millipore | Ab5407 | |
| 抗绿视蛋白抗体 | Invitrogen | PA5-24842 | |
| 抗视紫红质抗体 | Thermo Fisher Scientific | MS-1233-P | |
| 驴抗兔DyLight 488二抗 | Abcam | ab96919 | |
| 驴抗小鼠Cy3二抗 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 711-165-152 | |
| 组织学显微镜 | 奥林巴斯BX41显微镜 | Olympus | -- |
| Aperio CS2扫描仪 | Leica Biosystems | -- | |
| 奥林巴斯Fluoview FV1000共聚焦显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 载体生产 | AAV载体构建和包装条件:质粒构建细节、HEK293T细胞转染效率、病毒纯化方法、滴度测定(qPCR) 阅读提示:Materials and methods: AAV-mFam161a vector generation |
| 动物模型与注射 | Fam161a KO小鼠品系、年龄(P24-P29)、注射途径(视网膜下)、注射体积(1 μL)、病毒滴度(5×10^10 vg/μL)、单次或双次注射部位、麻醉和手术细节 阅读提示:Materials and methods: Animals; Subretinal injection of the AAV-mFam161a vector |
| 表达验证 | RT-PCR检测时间点(4周)、引物序列、RNA提取和cDNA合成试剂盒、PCR条件 阅读提示:Materials and methods: RNA extraction and RT-PCR analysis |
| 活体评估 | FAF和OCT成像时间点(3,6,8月龄)、FFERG记录条件(暗适应、刺激强度、电极)、OMT测试参数 阅读提示:Materials and methods: In vivo FAF and OCT imaging; OMT; FFERG |
| 组织学与免疫组化 | 固定、包埋、切片方法、H&E染色、ONL厚度测量步骤、IHC抗体浓度、抗原修复条件 阅读提示:Materials and methods: Histology and IHC |