预测艰难梭菌感染的风险评分

A Risk Score to Predict Clostridioides difficile Infection

作者信息Laurie Aukes, Bruce Fireman, Edwin Lewis, Julius Timbol, John Hansen, Holly Yu, Bing Cai, Elisa Gonzalez, Jody Lawrence, Nicola P Klein
PMID33738316
发布时间2021-02-04
DOI10.1093/ofid/ofab052

实验完整度

中

研究为回顾性队列研究,包含大量样本,但未进行功能或机制验证,属于观察性分析。

主要模型

KPNC成员队列(≥18岁) 住院患者队列(≥18岁) ≥50岁成员队列

重点核对

CDI定义:PCR阳性且1年内无CDI病史 比较人群:随机日期无CDI的成员 随访窗口:IDRSA后31-365天 风险因素:1年或12周内的医疗利用、用药、合并症 模型验证:30%随机验证集

摘要

背景:艰难梭菌感染(CDI)是严重腹泻的主要原因。在这项回顾性研究中,我们通过比较北加州凯撒医疗机构18岁及以上成员中经实验室确诊的新发CDI患者与未患CDI者的人口统计学和临床特征,确定了CDI的危险因素。方法:我们将这些危险因素纳入逻辑回归模型,开发了2种风险评分,用于预测在风险评分评估指数日期(IDRSA)之后的未来CDI,该日期标志着我们估计CDI风险时期的开始。结果:在2011年5月至2014年7月期间,我们纳入了9986例CDI病例和2,230,354名无CDI的成员。CDI病例往往年龄较大、女性、白人,且有更多的住院、急诊科和门诊就诊、熟练护理机构停留、抗生素和质子泵抑制剂使用以及特定合并症。以出院作为IDRSA时,我们的风险评分模型在预测随后31-365天发生CDI的可能性方面表现出优异的性能(C统计量为0.848)。以随机日期作为IDRSA时,我们的模型也能较好地预测随后31-365天的CDI风险(C统计量为0.722)。结论:这些结果可用于识别高风险人群,以纳入艰难梭菌疫苗试验,并有助于评估研究可行性,包括样本量和完成时间。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
如何利用电子病历中常用的风险因素来预测个体未来发生CDI的风险?
核心机制
研究未提出生物学机制,仅构建风险预测模型。
主要证据
基于99,986例CDI病例和2,230,354例非CDI成员的回顾性队列,使用逻辑回归构建风险评分,并通过交叉验证评估模型性能。
研究意义
模型可用于识别高风险人群,以纳入艰难梭菌疫苗试验,并评估研究可行性。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

确定CDI危险因素

比较CDI病例与无CDI人群的人口学和临床特征,以识别潜在危险因素。

从KPNC电子病历中识别2011-2014年间所有新发CDI病例,并与无CDI成员比较基线期(诊断前1年或随机日期前1年)的特征。

2

开发并验证风险评分模型

构建并验证风险评分模型,以预测IDRSA后31-365天的CDI风险。

基于Phase 1识别的风险因素,使用逻辑回归分别对住院患者(出院IDRSA)和≥50岁成员(随机IDRSA)建立预测模型,并通过交叉验证评估模型性能。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

确定风险因素
开发预测模型

产品清单

实验环节名称品牌货号
Cepheid----
Alere----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
数据收集
研究人群:KPNC≥18岁成员;CDI定义:PCR阳性且1年内无CDI史;对照组:随机日期无CDI;风险因素收集窗口:1年或12周
阅读提示:Methods: Setting, Study Population and Design, Phase 1
模型开发
住院模型:≥18岁住院患者,出院IDRSA,随访31-365天;随机模型:≥50岁成员,随机IDRSA,随访31-365天;风险因素包含1年内的医疗利用、用药等
阅读提示:Methods: Phase 2, Statistical Analysis
模型验证
住院模型:70%训练集,30%验证集;C统计量:0.848(出院模型),0.722(随机模型)
阅读提示:Methods: Statistical Analysis; Results: Phase 2