人群层面因素与SARS-CoV-2家庭续发率之间的关联:系统综述与荟萃分析

Association Between Population-Level Factors and Household Secondary Attack Rate of SARS-CoV-2: A Systematic Review and Meta-analysis

作者信息Can Wang, Xiaotong Huang, Eric H Y Lau, Benjamin J Cowling, Tim K Tsang
PMID36655186
发布时间2022-12-16
DOI10.1093/ofid/ofac676

实验完整度

中

系统综述和荟萃分析,包含明确的文献筛选、数据提取和统计模型(随机效应荟萃分析、元回归),并进行了敏感性分析,但无实验操作。

主要模型

家庭接触者队列(来自163项研究)

重点核对

研究期间国家病例发病率(log2转换) 研究期间国家死亡发病率(log2转换) 研究期前累计病例发病率(log2转换) 主要流行病毒分类(祖先株、变种、Omicron) 病例确定方法(仅PCR或其他方法,测试覆盖率)

摘要

背景 准确估计家庭续发率对于理解严重急性呼吸综合征冠状病毒2的传播性至关重要。人群层面因素(如社区传播强度)对续发率估计的影响很少被探索。 方法 在本研究中,我们纳入了具有原始数据以计算家庭续发率的文章。为了确定社区传播强度对家庭续发率估计的影响,我们探讨了研究期间国家病例发病率与续发率估计之间的关联。 结果 我们确定了163项研究,从326031例病例和2009859名家庭接触者中提取了续发率数据。研究期间病例发病率与续发率估计之间的相关系数为0.37(95% CI,0.24-0.49)。我们发现,研究期间病例发病率加倍与家庭续发率增加1.2%(95% CI,0.5%-1.8%)相关。 结论 我们的研究结果表明,研究期间病例发病率与较高的续发率相关。忽略这一因素可能会高估续发率,尤其是在高发病率地区,这进一步影响控制策略和新出现变异的流行病学特征描述。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
人群层面因素,尤其是社区传播强度,是否与SARS-CoV-2家庭续发率估计相关?
核心机制
更高的社区发病率与更高的家庭续发率相关,可能因为家庭续发率未区分感染来源,部分续发病例可能从社区感染,且高社区发病率可能反映检测增加或公共卫生措施放宽等混杂因素。
主要证据
基于163项研究的系统综述和荟萃分析,发现研究期间病例发病率与续发率相关系数为0.37(95% CI 0.24-0.49),发病率每增加一倍,续发率增加1.2%(95% CI 0.5-1.8%)。
研究意义
提示在解释家庭续发率时需考虑人群层面因素,忽略这些因素可能导致高估病毒传播性,影响控制政策和新兴变异的流行病学特征评估。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

系统文献检索与筛选

全面收集家庭传播研究数据,评估家庭续发率。

遵循PRISMA指南,在PubMed等数据库检索相关文献,更新既往综述,筛选出163项研究。

2

数据提取与变量分类

提取家庭续发率计算所需数据,并分类影响SAR的变量。

从纳入研究中提取研究期间、地点、感染数、接触者数、病例确定方法、测试覆盖率、主要流行病毒等,并计算SAR。

3

荟萃分析与亚组分析

汇总SAR估计,探索不同因素对SAR的影响。

使用随机效应模型进行荟萃分析,按病毒类型、测试覆盖率、病例确定方法等分组,分析不同亚组SAR差异。

4

元回归分析探索人群因素

评估人群层面因素(如社区发病率)与家庭SAR的关联。

利用各国COVID-19病例和死亡时间序列数据,计算研究期间和期前的累计发病率、发病率以及疫苗接种率,通过元回归分析关联SAR,并调整病毒类型。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
PubMed----
R软件--4.0.5
Our World in Data数据库----
世界卫生组织----
Nextstrain网站----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
系统检索
检索词、数据库、截止日期、纳入排除标准
阅读提示:Methods: Search Strategy and Selection Criteria
数据提取与SAR计算
研究期间、病例确定方法、测试覆盖率、接触者定义
阅读提示:Methods: Definition of Household Secondary Attack Rate, Data extraction
荟萃分析与亚组
随机效应模型参数、异质性指标、亚组分组变量
阅读提示:Methods: Data Analysis
元回归模型
自变量(发病率、累计发病率、疫苗接种率)的计算方法和数据来源
阅读提示:Methods: Data Analysis