系统文献检索与筛选
全面收集家庭传播研究数据,评估家庭续发率。
遵循PRISMA指南,在PubMed等数据库检索相关文献,更新既往综述,筛选出163项研究。
Association Between Population-Level Factors and Household Secondary Attack Rate of SARS-CoV-2: A Systematic Review and Meta-analysis
系统综述和荟萃分析,包含明确的文献筛选、数据提取和统计模型(随机效应荟萃分析、元回归),并进行了敏感性分析,但无实验操作。
家庭接触者队列(来自163项研究)
研究期间国家病例发病率(log2转换) 研究期间国家死亡发病率(log2转换) 研究期前累计病例发病率(log2转换) 主要流行病毒分类(祖先株、变种、Omicron) 病例确定方法(仅PCR或其他方法,测试覆盖率)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
全面收集家庭传播研究数据,评估家庭续发率。
遵循PRISMA指南,在PubMed等数据库检索相关文献,更新既往综述,筛选出163项研究。
提取家庭续发率计算所需数据,并分类影响SAR的变量。
从纳入研究中提取研究期间、地点、感染数、接触者数、病例确定方法、测试覆盖率、主要流行病毒等,并计算SAR。
汇总SAR估计,探索不同因素对SAR的影响。
使用随机效应模型进行荟萃分析,按病毒类型、测试覆盖率、病例确定方法等分组,分析不同亚组SAR差异。
评估人群层面因素(如社区发病率)与家庭SAR的关联。
利用各国COVID-19病例和死亡时间序列数据,计算研究期间和期前的累计发病率、发病率以及疫苗接种率,通过元回归分析关联SAR,并调整病毒类型。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 数据库检索 | PubMed | -- | -- |
| 数据分析 | R软件 | -- | 4.0.5 |
| 数据来源 | Our World in Data数据库 | -- | -- |
| 世界卫生组织 | -- | -- | |
| 病毒变异分类 | Nextstrain网站 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 系统检索 | 检索词、数据库、截止日期、纳入排除标准 阅读提示:Methods: Search Strategy and Selection Criteria |
| 数据提取与SAR计算 | 研究期间、病例确定方法、测试覆盖率、接触者定义 阅读提示:Methods: Definition of Household Secondary Attack Rate, Data extraction |
| 荟萃分析与亚组 | 随机效应模型参数、异质性指标、亚组分组变量 阅读提示:Methods: Data Analysis |
| 元回归模型 | 自变量(发病率、累计发病率、疫苗接种率)的计算方法和数据来源 阅读提示:Methods: Data Analysis |