患者样本收集与表型药敏试验
鉴定Xpert检测利福平耐药但表型药敏试验显示敏感的病例。
回顾性收集2015年1月至2018年6月北京胸科医院患者样本,进行Xpert MTB/RIF检测和pDST。
Interpretation of Discordant Rifampicin Susceptibility Test Results Obtained Using GeneXpert vs Phenotypic Drug Susceptibility Testing
研究基于医院患者样本的回顾性分析,包含Xpert检测、表型药敏试验、rpoB基因测序和MIC测定,但缺乏前瞻性实验和功能验证。
结核病患者临床分离株 结核分枝杆菌H37Rv参考菌株(ATCC27294)
Xpert MTB/RIF检测结果判读 表型药敏试验的利福平临界浓度(1.0 mg/L) rpoB基因RRDR突变类型 细菌载量分级(极低、低、中、高) MIC测定方法
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定Xpert检测利福平耐药但表型药敏试验显示敏感的病例。
回顾性收集2015年1月至2018年6月北京胸科医院患者样本,进行Xpert MTB/RIF检测和pDST。
分析rpoB RRDR序列,确定突变类型与频率。
使用Sanger测序分析104株分离株的rpoB RRDR片段(688bp)。
评估分离株对利福平的体外敏感性,并分析MIC与突变的关系。
采用琼脂稀释法(Alamar blue显色)测定MIC。
评估Xpert阳性等级与rpoB突变状态之间的关系,探讨假耐药原因。
根据Xpert阳性等级(高、中、低、极低)对病例分组,比较有无RRDR突变的分布。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 耐药检测 | GeneXpert MTB/RIF | Cepheid | -- |
| 药敏试验 | MGIT | Becton Dickinson | -- |
| MIC测定 | 利福平 | Sigma-Aldrich | -- |
| 阿尔玛蓝 | -- | -- | |
| 测序 | BioEdit | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本收集与pDST | Xpert和pDST的操作流程;pDST所用临界浓度;培养时间 阅读提示:Methods部分:Bacterial Isolates and Culture Condition |
| rpoB基因测序 | 引物序列;扩增片段长度;测序方法 阅读提示:Methods部分:DNA Amplification and Sequencing |
| MIC测定 | 药物浓度范围;接种菌量;培养时间和条件;判定标准 阅读提示:Methods部分:Minimal Inhibitory Concentration |
| 细菌载量分析 | Xpert阳性等级分级标准 阅读提示:Results部分:Cases Without RRDR Mutation and MTB Bacterial Load |