miR126序列设计与功能验证
确定化学修饰的miR126序列(OMe-miR126)是否保留抑制靶基因p85-β和细胞增殖的功能,并提高血浆稳定性。
合成Pre-miR126、PTO-miR126、OMe-miR126等序列,转染A375M-VR细胞,通过qRT-PCR检测miR126表达,WES检测p85-β蛋白水平,CellTiter-Glo检测细胞活力;在含50%人血浆的PBS中孵育评估稳定性。
MiR126-targeted-nanoparticles combined with PI3K/AKT inhibitor as a new strategy to overcome melanoma resistance
包含体外细胞增殖与迁移实验、纳米颗粒表征与稳定性检测,以及NSG小鼠体内肿瘤模型和转移评估,且具备功能验证和机制验证。
A375M黑色素瘤细胞系及其耐药亚系A375M-DR SKMEL28黑色素瘤细胞系及其耐药亚系SKMEL28-DR NSG小鼠脾内注射A375M-DR-LUC-GFP的体内转移模型 TCGA黑色素瘤数据集
OMe-miR126的化学修饰类型及位置(2'-O-甲基化和3'端两个脱氧胸苷) 壳聚糖纳米颗粒的N/P比(10)和分子量(50 kDa) anti-CSPG4单链抗体与纳米颗粒的偶联比例(1:10) A375M-DR-LUC-GFP细胞脾内注射剂量(5×10^4 cells/小鼠) 体内实验分组和给药方案(达拉非尼1.25 μg/g,PIK-75 2 μg/g,每周三次或每日)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定化学修饰的miR126序列(OMe-miR126)是否保留抑制靶基因p85-β和细胞增殖的功能,并提高血浆稳定性。
合成Pre-miR126、PTO-miR126、OMe-miR126等序列,转染A375M-VR细胞,通过qRT-PCR检测miR126表达,WES检测p85-β蛋白水平,CellTiter-Glo检测细胞活力;在含50%人血浆的PBS中孵育评估稳定性。
验证OMe-miR126与BRAF抑制剂(vemurafenib或dabrafenib)及PI3K抑制剂(PIK-75)联合是否能协同抑制黑色素瘤细胞生长,包括耐药细胞。
在A375M、SKMEL28及其耐药亚系(A375M-DR、SKMEL28-DR)中,用OMe-miR126或OMe-CTRL转染,再给予不同药物处理,测定IC50值并计算Excess over Bliss(EOB)指数。
合成装载OMe-miR126的壳聚糖纳米颗粒(CS126s),并用anti-CSPG4单链抗体功能化,表征其物理化学性质。
采用离子凝胶法制备CS126s,通过EDC/NHS化学偶联抗体,使用Nanosight、DLS、SEM/TEM表征尺寸、ζ电位、形态,qRT-PCR定量装载效率,WES检测抗体结合。
验证纳米颗粒能否被黑色素瘤细胞有效内化并释放miR126。
用FITC标记的CS-FITCs和Ab-CS-FITCs孵育A375M-DR和SKMEL28细胞,通过流式细胞术和荧光显微镜检测内化,qRT-PCR检测细胞内miR126水平。
评估CS-FITCs和Ab-CS-FITCs在小鼠体内的分布和潜在毒性,为后续治疗实验奠定基础。
将FITC标记的NPs静脉注射C57/Bl/6小鼠,通过FACS分析血浆清除,组织荧光显微镜观察分布,并用anti-His免疫组化验证;未治疗组每周三次静脉注射CS126s或Ab-CS126s持续4周,观察毒性。
验证纳米颗粒是否抑制黑色素瘤细胞的迁移能力。
使用伤口愈合实验,A375M-DR和SKMEL28-DR细胞与CS126s、Ab-CS-CTRLs、Ab-CS126s等孵育48小时,测量伤口愈合面积。
评估PIK-75与Ab-CS126s联合治疗在BRAF抑制剂耐药黑色素瘤小鼠模型中的抗肿瘤和抗转移效果。
A375M-DR-LUC-GFP细胞脾内注射NSG小鼠,约2周后随机分为六组:对照组(DAB)、DAB+PIK-75、DAB+Ab-CS126s、DAB+PIK-75+CS126s、DAB+PIK-75+Ab-CS-CTRLs、DAB+PIK-75+Ab-CS126s。通过IVIS监测肿瘤生长,比较生长曲线斜率,解剖后评估肝肺转移,qRT-PCR检测人GAPDH和p85-β。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 纳米颗粒制备 | 壳聚糖50 kDa | -- | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen by Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞活力测定 | CellTiter-Glo发光法细胞活力检测试剂盒 | Promega | -- |
| RNA提取 | 总RNA纯化微量试剂盒 | Norgen BIOTEK | -- |
| 逆转录 | TaqMan MicroRNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems by Thermo Fisher Scientific | 4366596 |
| qRT-PCR | SensiFAST探针Hi-ROX试剂盒 | Bioline | BIO-82020 |
| 蛋白表达分析 | WES自动化毛细管蛋白质印迹仪 | ProteinSimple | -- |
| 抗体纯化 | Ni-NTA琼脂糖树脂 | Qiagen | 1018244 |
| 流式细胞术 | CytoFLEX LX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| 纳米颗粒表征 | Nanosight NS300纳米颗粒追踪分析仪 | Malvern | -- |
| 扫描电子显微镜 | FEI | -- | |
| 透射电子显微镜 | FEI | -- | |
| 免疫组化 | 细胞和组织染色试剂盒(HRP-DAB) | R&D Systems | -- |
| 免疫荧光 | DAPI核染料 | Invitrogen | D1306 |
| 小鼠模型 | 达拉非尼 | Selleckchem | -- |
| PIK-75 | Selleckchem | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| miR126序列设计与稳定性分析 | OMe-miR126的化学修饰(2'-O-甲基化位置和3'端脱氧胸苷) 阅读提示:参见Results段落'OMe-miR126 sequence...'及Figure 1A |
| 细胞培养和耐药细胞系建立 | A375M-DR和SKMEL28-DR的建立方法,包括药物浓度和暴露时间 阅读提示:参见Materials and methods部分'Cell culture and transfection' |
| 细胞转染和功能实验 | 转染试剂Lipofectamine 2000的使用条件,细胞活力测定方法 阅读提示:参见Materials and methods部分'Cell culture and transfection'和'CellTiter-GLO' |
| 纳米颗粒制备和表征 | 壳聚糖分子量(50 kDa)、N/P比(10)、scFv:CS比例(1:10) 阅读提示:参见Materials and methods部分'Preparation of NP-CSs...'及'Conjugation...' |
| 体内实验 | NSG小鼠品系、脾内注射细胞数、给药方案(剂量、频率、途径) 阅读提示:参见Materials and methods部分'In vivo mouse model' |