构建和验证重组腺病毒Tat-CRAds-DTA
构建受HIV-1 Tat调控的条件复制腺病毒载体,并验证其在Tat存在时能选择性表达DTA和增殖。
选用pAd5/F35腺病毒载体作为骨架,通过同源重组构建pAd5/F35-DTA和pAd5/F35-mCherry,转染HEK293A细胞进行病毒拯救。通过PCR确认病毒基因组结构,然后在HEK293A细胞中验证DTA和mCherry的Tat依赖性表达,并通过MTT实验检测细胞毒性。
Tat-dependent conditionally replicating adenoviruses expressing diphtheria toxin A for specifically killing HIV-1-infected cells
包含体外细胞系(TZM-bl、HEK293A)验证、原代PBMCs验证、人源化小鼠模型体内验证,并通过功能验证(细胞毒性)和机制验证(DTA表达、腺病毒增殖)支持结论。
TZM-bl细胞 HEK293A细胞 人外周血单个核细胞(PBMCs) NCG-HuPBL人源化小鼠模型
Tat-CRAds-DTA的MOI为10 HIV-1感染剂量为200 TCID50 TZM-bl细胞密度为5×10^3细胞/孔 PBMCs细胞密度为2×10^4细胞/孔 小鼠给药剂量为1.0×10^8 IFUs/只(腹腔注射)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建受HIV-1 Tat调控的条件复制腺病毒载体,并验证其在Tat存在时能选择性表达DTA和增殖。
选用pAd5/F35腺病毒载体作为骨架,通过同源重组构建pAd5/F35-DTA和pAd5/F35-mCherry,转染HEK293A细胞进行病毒拯救。通过PCR确认病毒基因组结构,然后在HEK293A细胞中验证DTA和mCherry的Tat依赖性表达,并通过MTT实验检测细胞毒性。
评估Tat-CRAds-DTA对不同HIV-1株(包括实验室适应性株和传播/创始人株)的抑制效果和广谱性。
在TZM-bl细胞中,用HIV-1(200 TCID50)感染4小时后,加入Tat-CRAds-DTA或对照病毒(MOI为10),培养3天后检测荧光素酶活性、p24水平和细胞活力。
评估Tat-CRAds-DTA在原代人外周血单个核细胞(PBMCs)中的抗HIV-1能力。
从健康供体分离PBMCs,PHA刺激后,感染HIV-1(200 TCID50)4小时,然后加入Tat-CRAds-DTA(MOI=10),在不同时间点(3,7,10,14 dpi)收集上清检测p24和DTA,并计算抑制率。
评估单次腹腔注射Tat-CRAds-DTA对HIV-1感染NCG-HuPBL小鼠的治疗效果。
NCG-HuPBL小鼠(人CD45+细胞比例>5%)腹腔注射10 ng p24的HIV-1BaL,1天后注射Tat-CRAds-DTA(1.0×10^8 IFUs)或PBS,每周采血监测病毒载量和CD4+ T细胞比例,28 dpi处死,检测组织中的p24+细胞。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基(Gibco) | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | -- | |
| RPMI 1640培养基 | Gibco | -- | |
| PBMCs分离 | 人外周血淋巴细胞分离液 | TBD Science | -- |
| PBMCs刺激 | 植物血凝素 | -- | -- |
| PBMCs培养 | 重组人白细胞介素-2 | -- | -- |
| 构建重组腺病毒 | ClonExpress MultiS一步克隆试剂盒 | Vazyme | C113 |
| 转染 | ExFect转染试剂 | Vazyme | T101 |
| Western blotting | PVDF膜 | Millipore | -- |
| 抗DTA兔多克隆抗体 | Bioss | bs-10667R | |
| HRP标记的山羊抗兔抗体 | Proteintech | SA00001-2 | |
| 增强化学发光试剂 | Millipore | -- | |
| MTT实验 | MTT | Beyotime | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 检测 | EnSpire多功能酶标仪 | PerkinElmer | -- |
| 荧光素酶检测 | 细胞裂解液 | Beyotime | P0013 |
| p24检测 | Triton X-100 | Sigma-Aldrich | -- |
| HIV-1 p24 ELISA试剂盒 | KeYuanAnBo | -- | |
| DTA检测 | DTA ELISA试剂盒 | Mlbio | -- |
| 病毒滴度测定 | 六邻体蛋白染色 | -- | -- |
| RT-qPCR | FastPure病毒DNA/RNA小提试剂盒 | Vazyme | RC311-01 |
| HiScript II Q RT SuperMix用于qPCR | Vazyme | R223-01 | |
| ChamQ SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q341-02 | |
| 流式细胞术 | 红细胞裂解液 | BD Bioscience | -- |
| Pacific Blue抗人CD3抗体 | BioLegend | 317314 | |
| PE/Cyanine7抗人CD4抗体 | BioLegend | 317414 | |
| PE抗人CD8a抗体 | BioLegend | 301051 | |
| Alexa Fluor 700抗人CD45抗体 | BioLegend | 304024 | |
| BD Cytofix/Cytoperm固定破膜液 | BD Bioscience | 554722 | |
| BD洗涤缓冲液 | BD Bioscience | 554723 | |
| 抗p24-FITC抗体 | -- | -- | |
| FACS Calibur流式细胞仪 | BD Bioscience | -- | |
| VOA | 离子霉素 | Millipore | I9657 |
| 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | P8139 | |
| 免疫荧光 | 中性缓冲福尔马林 | Sigma-Aldrich | Z2902 |
| 抗HIV-1 p24抗体(Kal-1) | Dako | M085701 | |
| 奥林巴斯IX73显微镜 | OLYMPUS | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 腺病毒构建与验证 | 重组腺病毒载体pAd5/F35-DTA和pAd5/F35-mCherry的构建、病毒拯救和纯化方法,以及DTA和mCherry的Tat依赖性表达验证条件。 阅读提示:Materials and methods: Construction and rescue of recombinant adenoviruses; Results: Construction and validation of Tat-CRAds-DTA |
| 体外抗病毒活性测定 | TZM-bl细胞中HIV-1感染剂量(200 TCID50)、Tat-CRAds-DTA的MOI(10)、感染间隔(4小时)以及检测时间点(3 dpi)。 阅读提示:Materials and methods: HIV-1 inhibition assay; Results: Tat-CRAds-DTA displays significant potency and breadth against HIV-1 |
| 原代PBMCs抗病毒活性测定 | PBMCs的分离和刺激方法(PHA 1 μg/mL,IL-2 20 U/mL)、细胞数量(2×10^4/孔)、HIV-1感染剂量(200 TCID50)、Tat-CRAds-DTA的MOI(10),及检测时间点(3、7、10、14 dpi)。 阅读提示:Materials and methods: HIV-1 inhibition assay; Results: Tat-CRAds-DTA exhibits highly inhibitory activities against HIV-1 infection of PBMCs |
| 人源化小鼠体内实验 | NCG-HuPBL小鼠的构建方法、HIV-1BaL挑战剂量(10 ng p24)、Tat-CRAds-DTA给药剂量(1.0×10^8 IFUs/只)、给药途径(腹腔注射)、给药时间(感染后1天)及28 dpi终点。 阅读提示:Materials and methods: Evaluation of Tat-CRAds in inhibiting HIV-1 infection of NCG-HuPBL mice; Results: Therapeutic efficacy of Tat-CRAds-DTA in HIV-1-infected NCG-HuPBL mice |
| 检测方法 | RT-qPCR检测病毒载量的方法(包括引物、试剂盒、标准曲线)、流式细胞术检测CD4+和p24+CD4+ T细胞的方法、VOA和免疫荧光的步骤。 阅读提示:Materials and methods: Viral loads tested by RT-qPCR, Flow cytometry, VOA, Immunofluorescence assay of HIV-1-infected cells in tissues |