新生小鼠模型建立
验证新生期感染rAAV靶向Rian位点是否导致HCC,并评估HFD的影响。
1日龄新生小鼠注射AAV-Rian或AAV-tdTomato(3×10^10 vg)或DPBS,3周龄开始喂食HFD或RD,6个月后处死评估肿瘤。
Liver Injury Increases the Incidence of HCC following AAV Gene Therapy in Mice
包含新生儿和成年小鼠模型、HFD和部分肝切除诱导肝损伤、雌激素处理、组织学、整合PCR、RNA-seq和生物信息学分析,功能验证和机制验证明确。
新生C57BL/6小鼠 成年C57BL/6小鼠(HFD或RD) 2/3部分肝切除成年小鼠 雌激素处理的成年小鼠
rAAV血清型(AAV-DJ)和注射剂量(新生儿3×10^10 vg,成年8×10^11 vg) 饮食类型(RD: 5LOD; HFD: Envigo)和开始时间(3周龄) rAAV注射时间(新生1天,成年10周)和途径(新生颞静脉,成年眶后) 部分肝切除(PH)在rAAV感染后1周进行 雌激素剂量(80 μg/kg i.p. 每周三次)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证新生期感染rAAV靶向Rian位点是否导致HCC,并评估HFD的影响。
1日龄新生小鼠注射AAV-Rian或AAV-tdTomato(3×10^10 vg)或DPBS,3周龄开始喂食HFD或RD,6个月后处死评估肿瘤。
评估肝损伤(HFD或PH)对成年小鼠rAAV诱导HCC的影响。
3周龄雄性小鼠开始HFD或RD,10周龄注射AAV-Rian或AAV-tdTomato(8×10^11 vg)经眶后,一组RD小鼠在感染后1周行2/3部分肝切除,6个月后处死评估肿瘤。
验证雌激素对HFD诱导的肝损伤和炎症的影响。
3周龄雄性小鼠喂食HFD或RD,并接受80 μg/kg雌激素(溶于玉米油)或玉米油对照(每隔一天腹腔注射),持续1个月,处死前2小时注射BrdU标记增殖细胞。
确认肿瘤中CAG启动子整合到Rian位点,并分析肿瘤转录组特征。
从肿瘤和背景肝组织提取DNA,通过PCR和测序检测CAG整合;提取RNA进行RNA-seq,分析AAV-Rian特征和HCC分子分型。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 载体生产 | AAV-DJ血清型 | -- | -- |
| 细胞培养 | HEK293细胞 | -- | -- |
| 杜氏改良Eagle培养基 | GIBCO | -- | |
| OptiMEM培养基 | GIBCO | -- | |
| 转染 | 聚乙烯亚胺 | Polysciences | -- |
| 载体生产 | 苯佐酶 | Sigma | -- |
| 聚乙二醇8000 | Spectrum Chemical | -- | |
| 动物实验 | 玉米油 | Sigma | -- |
| 细胞增殖检测 | 溴脱氧尿苷 | Alfa Aesar | -- |
| DNA/RNA提取 | MasterPure DNA和RNA纯化试剂盒 | Lucigen | -- |
| PCR | PrimeStar聚合酶 | Takara | -- |
| RNA提取 | RNAzol RT试剂 | MRC | -- |
| 测序 | Qubit荧光计 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 载体生产 | AAV-DJ血清型包装,PEI转染,病毒纯化方法,滴度测定 阅读提示:Materials and Methods, Vector Production |
| 新生小鼠模型 | 新生小鼠日龄(1天),病毒剂量(3×10^10 vg),注射途径(颞静脉),饮食类型(RD/HFD)和起始时间(3周龄),处死时间(6个月) 阅读提示:Materials and Methods, Effect of Diet-Induced Liver Injury on AAV Induced HCC in Neonates; Figure 2A |
| 成年小鼠模型 | 小鼠周龄(3周开始饮食,10周感染),病毒剂量(8×10^11 vg),注射途径(眶后),饮食类型(RD/HFD),部分肝切除时机(感染后1周),处死时间(6个月后) 阅读提示:Materials and Methods, Effect of Age- and Diet-Induced Liver Injury on AAV-Induced HCC; Figure 3A |
| 雌激素处理 | 小鼠周龄(3周),饮食(RD/HFD),雌激素剂量(80 μg/kg)和给药方式(腹腔注射,每隔一天),处理时间(1个月),BrdU标记 阅读提示:Materials and Methods, Effect of Estrogen on HFD-Induced Liver Injury; Figure 5A |
| 整合分析 | 引物序列,PCR条件,测序验证 阅读提示:Materials and Methods, DNA Isolation and Vector Integration Analysis |